R gstat krige () - Konumdaki tekil kovaryans matrisi [5.88,47.4,0]: atlama


10

Kriging yapmak istediğimde, datatable'ımda kullandığım değerlere bağlı olarak sadece bazen çalışıyor. Krige işlevinin bir sonucu olarak alıyorum var1.pred: NA NA NA ...ve var1.var: NA NA NA ...(ancak yalnızca datatable'ımda "yanlış" değerleri kullandığımda).

Örneğin:

  • o çalışır her zaman (şimdiye kadar) Ben sadece 10 değerler kullandığınızda
  • o çalışır Ben 50 değerler kullandığınızda ancak belirli olanlarla,
  • o değil çalışıyor ben 50 değerlerini ve "yanlış" değerler kullandığınızda
  • o çalışır Ben 25 değer ve daha önce sözü edilen "yanlış" değerler kullandığınızda

Neden işe yarayıp bazen işe yaramadığını anlamıyorum. Garip olan şey, Zwiesel;49.02999878;13.22999954;2.2datatable'a eklediğimde ~ 20'den az değer kullandığımda çalışıyor, ancak 50'den fazla değer kullandığımda çalışmıyor ...

Benim hatam nerede?

myWeatherTable.csv:

Place;Latitude;Longitude;Temperature
Aachen;50.77999878;6.09999990;3
Abbikenhausen;53.52999878;8.00000000;7.9
Adelbach;49.04000092;9.76000023;3.1
Adendorf;51.61999893;11.69999981;1.9
Alberzell;48.45999908;11.34000015;4.6
...
...

Kriging enterpolasyonu yapmak için kodum

WeatherData <- read.csv(file="myWeatherTable", header = TRUE, sep ";")

coordinates(WeatherData) = ~Longitude + Latitude

vario <-  variogram(log(Temperature) ~1, WeatherData)
vario.fit <- fit.variogram(vario, vgm("Sph"))

min_lon <- min(WeatherData$Longitude)
max_lon <- max(WeatherData$Longitude)
min_lat <- min(WeatherData$Latitude)
max_lat <- max(WeatherData$Latitude)
Longitude.range <- as.numeric(c(min_lon,max_lon))
Latitude.range <- as.numeric(c(min_lat,max_lat))
grd <- expand.grid(Longitude = seq(from = Longitude.range[1], to = Longitude.range[2], by = 0.1),
  Latitude = seq(from = Latitude.range[1],to = Latitude.range[2], by = 0.1))
coordinates(grd) <- ~Longitude + Latitude
gridded(grd) <- TRUE

plot1 <- WU_data_spatial %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points with measurements")

plot2 <- grd %>% as.data.frame %>%
  ggplot(aes(Longitude, Latitude)) + geom_point(size=1) + coord_equal() + 
  ggtitle("Points at which to estimate")

grid.arrange(plot1, plot2, ncol = 2)

kriged <- krige(Temperature~ 1, WeatherData, grd, model=variogram_fit)

Uyarılar :

1: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.88,47.4,0]: skipping...
2: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [5.98,47.4,0]: skipping...
3: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.08,47.4,0]: skipping...
4: In predict.gstat(g, newdata = newdata, block = block,  ... :
Covariance matrix singular at location [6.18,47.4,0]: skipping...
...
...

Yanıtlar:


16

Yinelenen konumlarınız olduğundan bu hata genellikle döndürülür. Bu sp::zerodistişlevi kullanarak kontrol edebilirsiniz .

sp::zerodistKöşeli ayraç dizini içinde yinelenen konumları kaldırmak için çağırırsınız .

WeatherData <- WeatherData[-zerodist(WeatherData)[,1],] 
Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.