Plot.new () 'de hata: R' de şekil kenar boşlukları çok büyük

R'de yeniyim ama daha küçük veri kümeleriyle çok sayıda korelasyon grafiği yaptım. Bununla birlikte, büyük bir veri setini (2gb +) çizmeye çalıştığımda, grafiği gayet güzel üretebilirim, ancak efsane görünmüyor. Herhangi bir tavsiye? veya alternatifler?

library(gplots)
r.cor <- cor(r)
layout(matrix(c(1,1,1,1,1,1,1,1,2,2), 5, 2, byrow = TRUE))
par(oma=c(5,7,1,1))
cx <- rev(colorpanel(25,"yellow","black","blue"))
leg <- seq(min(r.cor,na.rm=T),max(r.cor,na.rm=T),length=10)
image(r.cor,main="Correlation plot Normal/Tumor data",axes=F,col=cx)
axis(1, at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]], 
    cex.axis=0.9,las=2)
axis(2,at=seq(0,1,length=ncol(r.cor)), labels=dimnames(r.cor)[[2]],
     cex.axis=0.9,las=2)
image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)     

Hata plot.new(): şekil marjları çok büyük

tmp <- round(leg,2)
axis(1,at=seq(0,1,length=length(leg)), labels=tmp,cex.axis=1)

Sorunun, layout()aramanızın oluşturduğu küçük şekil bölgesi 2'nin , bırakın bir grafiği, sadece varsayılan marjları içerecek kadar yeterince büyük olmadığından şüpheleniyorum .

Soruna neden olan çizgiden önce şunu deneyin:

par(mar = rep(2, 4))

sonra ikinci resmi çizin

image(as.matrix(leg),col=cx,axes=T)

Kenar boşluklarının boyutu ile oynamanız gerekecek. par() doğru yapmak için gösterdiğim görüşmedeki . Ayrıca üzerine çizdiğiniz gerçek aygıtın boyutunu da artırmanız gerekebilir.

Son bir ipucu, par()değiştirmeden önce varsayılanları kaydedin , bu nedenle mevcut par()çağrınızı şu şekilde değiştirin :

op <- par(oma=c(5,7,1,1))

öyleyse planlamanın sonunda yap

par(op)

Bu hata, Rstudio'da sadece "Grafikler" bölmenizin çok küçük olması nedeniyle oluşabilir. "Dosyalarınızı, Grafiklerinizi, Paketlerinizi, Yardımınızı, Görüntüleyicinizi" yakınlaştırmayı deneyin ve yardımcı olup olmadığına bakın!

Bu mesajı RStudio'da alırsanız, Plots sekmesindeki 'süpürge sopası' figürüne tıklamak ve plot () tekrar denemek işe yarayabilir.

Bu bazen RStudio'da olur. Bunu çözmek için harici bir pencereye (yalnızca Windows) çizim yapmayı deneyebilirsiniz:

windows() ## create window to plot your file
## ... your plotting code here ...
dev.off() 

Bu hatayı R Studio'da aldım ve kenar çubuğunu tıklayıp sağdan sola sürükleyerek kenar çubuğunu büyütmekle düzeltildi.

Nesnenizin bir liste mi yoksa bir vektör mü olduğunu kontrol edin. Bunu yapmak için yazın is.list(yourobject). Bu doğruysa, yeniden adlandırmayı deneyin x<-unlist(yourobject). Bu, onu çizebileceğiniz bir vektör haline getirecektir.

RStudio kullanıyorsanız bu alanı yakınlaştırmanız yeterlidir.

Bugün bu hatayı buldum. Başlangıçta, onu .jpegdüşük genişlik ve yüksekliğe sahip bir dosyaya çıkarmaya çalışıyordum .

jpeg("method1_test.jpg", width=900, height=900, res=40)

Daha sonra genişliği ve yüksekliği şu şekilde artırdım:

jpeg("method1_test.jpg", width=1900, height=1900, res=40)

Hata orada değildi. :)

Çözünürlükle de oynayabilirsiniz, çözünürlük yüksekse daha fazla genişliğe ve yüksekliğe ihtiyacınız var.

Yüksek boyutlu verileri çizmeye çalışırken bu hatayı aldım. Sizin durumunuz buysa, çok boyutlu ölçeklendirmeyi deneyin: http://www.statmethods.net/advstats/mds.html

Bu hatayla haftalarca uğraştım (RStudio kullanarak). Çizim penceresini gitgide küçültmeyi denedim, ancak bu sürekli olarak yardımcı olmadı. Uygulamayı daha büyük monitörüme taşıdığımda (sürüklediğimde) sorun ortadan kalktı! Şaşkına döndüm ... boşa harcanan çok saat ... Kodumun doğru olduğunu biliyordum ...

RStudio Plots tuvali, çizim genişliğini ve yüksekliğini sınırlıyor. Ancak grafiğinizi Rmarkdown kod yığınından yaparsanız , çizim alanı kağıt boyutuna göre ayarlandığından tuval alanı sınırlaması olmadan çalışır.

Örneğin:

    ```{r}
#inside of code chunk in Rmarkdown
        grid <- par(mfrow=c(4, 5))
        plot(faithful, main="Faithful eruptions")
        plot(large.islands, main="Islands", ylab="Area")
        ...
        par(grid)
    ```

Bugün aynı hatayı buldum. "Clear all Plots" düğmesini denedim, ancak bana aynı hatayı veriyordu. Sonra bu hile benim için çalıştı , çizim alanını sürükleyerek artırmaya çalışın. Kesinlikle size yardımcı olacaktır.

Sadece Clear all plots'u kullandım, sonra tekrar plot komutunu verdim ve yardımcı oldu

Marj düşükse, yeni çizim cihazıyla başlamak her zaman daha iyidir:

dev.new()
# plot()
# save your plot
dev.off()

Yerleştirilemeyen büyük bir şey çizmediğiniz sürece asla marj hatası almazsınız.