pydot ve graphviz hatası: dot_parser içe aktarılamadı, nokta dosyalarının yüklenmesi mümkün olmayacak

Pydot ile çok basit bir kod çalıştırdığımda

import pydot
graph = pydot.Dot(graph_type='graph')

for i in range(3):

  edge = pydot.Edge("king", "lord%d" % i)
  graph.add_edge(edge)

vassal_num = 0
for i in range(3):
  for j in range(2):
    edge = pydot.Edge("lord%d" % i, "vassal%d" % vassal_num)
    graph.add_edge(edge)
    vassal_num += 1

graph.write_png('example1_graph.png')

Bana şu hata mesajını yazdırıyor:

Couldn't import dot_parser, loading of dot files will not be possible.

Python 2.7.3 kullanıyorum

Cevap pydot >= 1.1:

(Yukarı akış) uyumsuzluğu 6dff94b3f1pydot tarafından düzeltildi ve bu nedenle pydot >= 1.1ile uyumlupyparsing >= 1.5.7 olacaktır .

Cevap pydot <= 1.0.28:

Bununla karşılaşan herhangi biri için, 1.x'ten 2.x sürümüne geçişteki değişikliklerden kaynaklanmaktadır. Pydot'u pip kullanarak kurmak için, önce pyparsing'in eski sürümünü kurun:

pip install pyparsing==1.5.7
pip install pydot==1.0.28

pyparsingKullanarak yüklemediyseniz pip, bunun yerine kullandıysanız setup.py, paketi kaldırmak için bu çözüme bir göz atın . Teşekkürler @qtips.

Pip deposunda, pyparsing2 ile doğru şekilde çalışan pydot2 adında yeni bir paket var. Paketlerimi düşüremedim çünkü matplotlib yeni pyparsing paketine bağlı.

Not: macports'tan python2.7

pydot, pyparsing'den özel bir modül değişkeni (_noncomma) kullandı. Aşağıdaki diff, 2.0.1'i pyparsing için kullanmak üzere düzeltir:

diff --git a/dot_parser.py b/dot_parser.py
index dedd61a..138d152 100644
--- a/dot_parser.py
+++ b/dot_parser.py
@@ -25,8 +25,9 @@ from pyparsing import __version__ as pyparsing_version
 from pyparsing import ( nestedExpr, Literal, CaselessLiteral, Word, Upcase, OneOrMore, ZeroOrMore,
     Forward, NotAny, delimitedList, oneOf, Group, Optional, Combine, alphas, nums,
     restOfLine, cStyleComment, nums, alphanums, printables, empty, quotedString,
-    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, _noncomma, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )
+    ParseException, ParseResults, CharsNotIn, dblQuotedString, QuotedString, ParserElement )

+_noncomma = "".join( [ c for c in printables if c != "," ] )

 class P_AttrList:

Pydot deposunu [1] çatalladım, Gabi Davar yamasını ve python-3'ü desteklemek için bazı değişiklikleri uyguladım. Paket PyPI [2] 'de mevcuttur.

Şerefe

• [1] https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32
• [2] https://pypi.python.org/pypi/pydot2

$ sudo pip uninstall pydot

$ sudo pip install pydot2

Şu bağlantıya bakın: http://infidea.net/tr trouble-couldnt-import-dot_parser-loading-of-dot-files-will-not-be-possible/

Çözüm, pydot'u bir yerden değil, resmi ubuntu depolarından "python-pydot" kurmaktı.

Artık PyParsing-2 ve Python-3'ü destekleyen görünen en az 2 sürüm daha var:

• PyDotPlus tarafından Carlos Jenkins ile bir güzel BuildBot'ın ve fantezi Travis belgeleri . Ancak, klasör adını yerine olarak değiştirmeniz gerekecektir site-packages\pydotplus.site-packages\pydot mevcut programların olduğu ithalat pydot çalışmak için.
• pydot3k tarafından bmcorser . Ne yazık ki işe yaramadı!
• James Mills tarafından hazırlanan prologic / pydot , resmi pydot Google kod sayfasından şu şekilde bağlantılıdır ...

  Python 3 uyumluluğu için bir dal

• ve işte iyi çalışan David Villa'nın pydot2'sine çalışan bir bağlantı: https://pypi.python.org/pypi/pydot2/1.0.32

Sorunu tekrar yaşadım ve yukarıdaki çözümüm işe yaramadı. Bu sizin için doğruysa ve Anaconda'yı El Capitan ile Mac'te de kullanıyorsanız, şunu deneyin:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG graphviz`
conda install --channel https://conda.anaconda.org/RMG pydot

Sonunda burada gördüğümden birçok denemeden sonra yaptığım şey (networkx için çalışması için sözde sıra):

apt-get remove python-pydot
pip install pydotplus
apt-get install libcgraph6
apt-get install python-pygraphviz


# pip freeze | grep pydot
 pydotplus==2.0.2
# pip freeze | grep pyparsing
pyparsing==2.2.0
# pip freeze | grep graphviz
pygraphviz==1.2
# python -c 'import pydotplus'
#

Bu benim için çalıştı (Anaconda'da Python 2.7.10 ile Mac OS X 10.9):

conda uninstall pydot

Sonra,

conda install pydot

Pyparsing daha sonra pydot'un kurulumu üzerine indirgenir (2.x'ten 1.5.7'ye). Geleceğin Google Çalışanları: Bu, Theano'yu doğru şekilde yüklememe ve içe aktarmama izin verdi.

OSX Mavericks'te aşağıdakiler hile yaptı ... Aynı hatayı aldım ama altta ayrıca graphviz çalıştırılabilirinin mevcut olmadığına dair bir şikayet vardı ... Sanırım sorun diğer modüllerden önce graphviz'i kurmuştum?

brew uninstall graphviz
brew install graphviz

Diğer çözümler işe yaramadığında, sorunu çözmek için bu hızlı ve kirli bir yöntemdir:

Bu örnek, Ubuntu 16.04'teki python 2.7'den alınmıştır.

Python2.7 / site-packages / keras / utils / visualize_util.py dosyasını düzenleyin ve aşağıdaki kod segmentini yorumlayın.

if not pydot.find_graphviz():
    raise ImportError('Failed to import pydot. You must install pydot'
                      ' and graphviz for `pydotprint` to work.')

find_graphviz (), pydot'un daha yeni sürümlerinde fazlalıktır ve yukarıdaki çağrı çalışmaz.

Ayrıca problemle karşılaştım ve pydot == 1.0.28 iken pyparsing == 2.2.0. Google'dan en yeni pydot 1.2.3'ü (tar.gz) indirip çevrimdışı yükleyerek sorunu çözdüm. Ubuntu 14.04'teki pydot'u güncellediğimde, pydot 1.0.28'in en yeni sürüm olduğunu söyledi. Bu nedenle Google'dan 1.2.3 sürümünü indiriyorum.

Pydot'un düzgün çalışması için pyparsing'i 2.x sürümünden 1.5.7 sürümüne düşürmeniz gerekir.

Win-64 için Conda kullanarak bu benim için çalıştı:

conda install -c https://conda.anaconda.org/Trentonoliphant pyparsing=1.5.7

Daha sonra 2.x sürümünü devre dışı bıraktım / kaldırdım ve komut dosyamda pyparsing'i yeniden yükledim:

pyparsing = reload(pyparsing)
pydot = reload(pydot)

Doğru sürümün çalışıp çalışmadığını kontrol etmek için:

print pyparsing.__version__