Bir metin dosyasında n'inci sütunu al

Bir metin dosyam var:

1 Q0 1657 1 19.6117 Exp
1 Q0 1410 2 18.8302 Exp
2 Q0 3078 1 18.6695 Exp
2 Q0 2434 2 14.0508 Exp
2 Q0 3129 3 13.5495 Exp

Her satırın 2. ve 4. kelimesini şöyle almak istiyorum:

1657 19.6117
1410 18.8302
3078 18.6695
2434 14.0508
3129 13.5495

Bu kodu kullanıyorum:

 nol=$(cat "/path/of/my/text" | wc -l)
 x=1
 while  [ $x -le "$nol" ]
 do
     line=($(sed -n "$x"p /path/of/my/text)
     echo ""${line[1]}" "${line[3]}""  >> out.txt
     x=$(( $x + 1 ))
 done

Çalışır, ancak çok karmaşıktır ve uzun metin dosyalarını işlemek uzun zaman alır.

Bunu yapmanın daha basit bir yolu var mı?

iirc:

cat filename.txt | awk '{ print $2 $4 }'

veya yorumlarda belirtildiği gibi:

awk '{ print $2 $4 }' filename.txt

Şu cutkomutu kullanabilirsiniz :

cut -d' ' -f3,5 < datafile.txt

baskılar

1657 19.6117
1410 18.8302
3078 18.6695
2434 14.0508
3129 13.5495

the

• -d' '- demek, spacesınırlayıcı olarak kullanın
• -f3,5 - 3. ve 5. sütunu alın ve yazdırın

cutOlduğunu çok daha hızlı bir saf kabuk çözüm olarak büyük dosyalar için. Dosyanız birden çok boşlukla sınırlandırılmışsa, önce bunları kaldırabilirsiniz, örneğin:

sed 's/[\t ][\t ]*/ /g' < datafile.txt | cut -d' ' -f3,5

burada (gnu) sed herhangi tabveya spacekarakterleri tek ile değiştirecektir space.

Bir varyant için - işte bir perl çözümü de:

perl -lanE 'say "$F[2] $F[4]"' < datafile.txt

Bütünlüğü uğruna:

while read _ _ one _ two _; do
    echo "$one $two"
done < file.txt

_Keyfi bir değişken yerine (örneğinjunk ) da kullanılabilir. Önemli olan sadece sütunları çıkarmaktır.

Demo:

$ while read _ _ one _ two _; do echo "$one $two"; done < /tmp/file.txt
1657 19.6117
1410 18.8302
3078 18.6695
2434 14.0508
3129 13.5495

Daha basit bir varyant -

$ while read line
  do
      set $line          # assigns words in line to positional parameters
      echo "$3 $5"
  done < file

Dosyanız n satır içeriyorsa , komut dosyanızın n dosyasını okuması gerekir kez ; bu nedenle, dosyanın uzunluğunu iki katına çıkarırsanız, betiğinizin yaptığı iş miktarını dört katına çıkarırsınız ve neredeyse tüm bu iş bir kenara atılır, çünkü tek yapmak istediğiniz sırayla satırların üzerinden geçmektir.

Bunun yerine, bir dosyanın satırları üzerinde döngü yapmanın en iyi yolu while, koşul komutunun readyerleşik olduğu bir döngü kullanmaktır :

while IFS= read -r line ; do
    # $line is a single line of the file, as a single string
    : ... commands that use $line ...
done < input_file.txt

Sizin durumunuzda, çizgiyi bir diziye bölmek istediğinizden ve readyerleşik aslında bir dizi değişkenini doldurmak için özel desteğe sahip olduğundan, istediğiniz şey budur, yazabilirsiniz:

while read -r -a line ; do
    echo ""${line[1]}" "${line[3]}"" >> out.txt
done < /path/of/my/text

veya daha iyisi:

while read -r -a line ; do
    echo "${line[1]} ${line[3]}"
done < /path/of/my/text > out.txt

Ancak, yaptığınız şey için cutyardımcı programı kullanabilirsiniz :

cut -d' ' -f2,4 < /path/of/my/text > out.txt

(veya awkTom van der Woerdt'ın önerdiği gibi perl, veya hatta sed).

Yapılandırılmış veri kullanıyorsanız, bu, çalıştırmak trve / cutveya başka bir şey için fazladan bir kabuk işlemi başlatmama avantajına sahiptir . ...

(Elbette, koşullu ve mantıklı alternatiflerle kötü girdilere karşı korunmak isteyeceksiniz.)

...
while read line ; 
do 
    lineCols=( $line ) ;
    echo "${lineCols[0]}"
    echo "${lineCols[1]}"
done < $myFQFileToRead ; 
...