Not, difflib.SequenceMatcher
sadece en uzun bitişik eşleştirme dizisini bulur, bu genellikle istenen şey değildir, örneğin:
>>> a1 = "Apple"
>>> a2 = "Appel"
>>> a1 *= 50
>>> a2 *= 50
>>> SequenceMatcher(None, a1, a2).ratio()
0.012 # very low
>>> SequenceMatcher(None, a1, a2).get_matching_blocks()
[Match(a=0, b=0, size=3), Match(a=250, b=250, size=0)] # only the first block is recorded
İki tel arasındaki benzerliği bulmak biyoinformatikte ikili dizi hizalaması kavramı ile yakından ilgilidir. Bunun için biyopthon da dahil olmak üzere birçok özel kütüphane bulunmaktadır . Bu örnek, Needleman Wunsch algoritmasını uygular :
>>> from Bio.Align import PairwiseAligner
>>> aligner = PairwiseAligner()
>>> aligner.score(a1, a2)
200.0
>>> aligner.algorithm
'Needleman-Wunsch'
Biyopthon veya başka bir biyoinformatik paketi kullanmak, birçok farklı skorlama şeması ve algoritması bulunduğundan, python standart kütüphanesinin herhangi bir kısmından daha esnektir. Ayrıca, neler olduğunu görselleştirmek için eşleşen dizileri alabilirsiniz:
>>> alignment = next(aligner.align(a1, a2))
>>> alignment.score
200.0
>>> print(alignment)
Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-Apple-
|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-|||-|-
App-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-elApp-el