dplyr özetle: Çıktıda sıfır uzunlukta grupları tutmak için ".drop = FALSE" eşdeğeri


98

Kullanırken summariseile plyrbireyin ddplyfonksiyonu, boş kategorileri varsayılan olarak bırakılır. Bu davranışı ekleyerek değiştirebilirsiniz .drop = FALSE. Ancak bu, summariseile kullanıldığında çalışmaz dplyr. Sonuçta boş kategorileri tutmanın başka bir yolu var mı?

İşte sahte verilerle bir örnek.

library(dplyr)

df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6))

# Now add an extra level to df$b that has no corresponding value in df$a
df$b = factor(df$b, levels=1:3)

# Summarise with plyr, keeping categories with a count of zero
plyr::ddply(df, "b", summarise, count_a=length(a), .drop=FALSE)

  b    count_a
1 1    6
2 2    6
3 3    0

# Now try it with dplyr
df %.%
  group_by(b) %.%
  summarise(count_a=length(a), .drop=FALSE)

  b     count_a .drop
1 1     6       FALSE
2 2     6       FALSE

Tam olarak umduğum gibi değil. Bir var mı dplyraynı sonucu elde etmek için bir yöntem .drop=FALSEde plyr?


Yanıtlar:


27

Dplyr 0.8 , tam istediğiniz şeyi group_byyapan .dropargümanı kazandığından beri :

df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6))
df$b = factor(df$b, levels=1:3)

df %>%
  group_by(b, .drop=FALSE) %>%
  summarise(count_a=length(a))

#> # A tibble: 3 x 2
#>   b     count_a
#>   <fct>   <int>
#> 1 1           6
#> 2 2           6
#> 3 3           0

@ Moody_Mudskipper'ın cevabına ek bir not: Kullanmak .drop=FALSE, bir veya daha fazla gruplama değişkeni faktör olarak kodlanmadığında potansiyel olarak beklenmedik sonuçlar verebilir. Aşağıdaki örneklere bakın:

library(dplyr)
data(iris)

# Add an additional level to Species
iris$Species = factor(iris$Species, levels=c(levels(iris$Species), "empty_level"))

# Species is a factor and empty groups are included in the output
iris %>% group_by(Species, .drop=FALSE) %>% tally

#>   Species         n
#> 1 setosa         50
#> 2 versicolor     50
#> 3 virginica      50
#> 4 empty_level     0

# Add character column
iris$group2 = c(rep(c("A","B"), 50), rep(c("B","C"), each=25))

# Empty groups involving combinations of Species and group2 are not included in output
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally

#>   Species     group2     n
#> 1 setosa      A         25
#> 2 setosa      B         25
#> 3 versicolor  A         25
#> 4 versicolor  B         25
#> 5 virginica   B         25
#> 6 virginica   C         25
#> 7 empty_level <NA>       0

# Turn group2 into a factor
iris$group2 = factor(iris$group2)

# Now all possible combinations of Species and group2 are included in the output, 
#  whether present in the data or not
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally

#>    Species     group2     n
#>  1 setosa      A         25
#>  2 setosa      B         25
#>  3 setosa      C          0
#>  4 versicolor  A         25
#>  5 versicolor  B         25
#>  6 versicolor  C          0
#>  7 virginica   A          0
#>  8 virginica   B         25
#>  9 virginica   C         25
#> 10 empty_level A          0
#> 11 empty_level B          0
#> 12 empty_level C          0

Created on 2019-03-13 by the reprex package (v0.2.1)

Cevabınıza ek bir not ekledim. Düzenlemeyi beğenmezseniz lütfen silmekten çekinmeyin.
— eipi10

Bunun bir hata mı yoksa amaçlanan davranış mı olduğunu öğrenmek için github'da bununla ilgili bir sorun bildirdim.
— eipi10

@ eipi10 biraz daha kısa, aşağıdakilerin kullanımıdır count:iris %>% count(Species, group2, .drop=FALSE)
— Tjebo

59

Sorun hala açık, ancak bu arada, özellikle verileriniz zaten hesaba completekatıldığı için, aradığınız şeyi elde etmek için "tidyr" den kullanabilirsiniz :

library(tidyr)
df %>%
  group_by(b) %>%
  summarise(count_a=length(a)) %>%
  complete(b)
# Source: local data frame [3 x 2]
# 
#        b count_a
#   (fctr)   (int)
# 1      1       6
# 2      2       6
# 3      3      NA

Değişim değerinin sıfır olmasını istiyorsanız, bunu şununla belirtmeniz gerekir fill:

df %>%
  group_by(b) %>%
  summarise(count_a=length(a)) %>%
  complete(b, fill = list(count_a = 0))
# Source: local data frame [3 x 2]
# 
#        b count_a
#   (fctr)   (dbl)
# 1      1       6
# 2      2       6
# 3      3       0

11
Bunu anlamak için duvara vurmam çok fazla kafamı aldı, bu yüzden burada bahsedeceğim ... 2 değişkene göre gruplandırırsanız ve bunlar faktörlerden ziyade karakter ise, ungroup()tamamlamadan önce kullanmanız gerekecek . completeGerçekte tamamlanmadığını fark ederseniz ungroup, muhtemelen gereklidir.
— williamsurles

Ya daha fazla gruplama değişkeniniz varsa? Group_by
— TobiO'daki

1
Bunu anladım: complete(variablewithdroppedlevels, nesting(var1,var2,var3))complete
— İç içe geçmeyi

20

dplyr çözümü:

Önce gruplandırılmış df yapın

by_b <- tbl_df(df) %>% group_by(b)

sonra bu seviyeleri sayarak özetliyoruz n()

res <- by_b %>% summarise( count_a = n() )

daha sonra sonuçlarımızı tüm faktör seviyelerini içeren bir veri çerçevesinde birleştiriyoruz:

expanded_res <- left_join(expand.grid(b = levels(df$b)),res)

son olarak, bu durumda sayılara baktığımız için NAdeğerler 0 olarak değiştirilir.

final_counts <- expanded_res[is.na(expanded_res)] <- 0

Bu aynı zamanda işlevsel olarak da uygulanabilir, cevaplara bakın: dplyr ile gruplanmış verilere satırlar eklensin mi?

Bir hack:

Faiz uğruna bu durumda işe yarayan korkunç bir hack göndereceğimi düşündüm . Bunu gerçekten yapmanız gerektiğinden ciddi olarak şüpheliyim, ancak bu, seviyelerle bir faktör değil, bir karakter vektörüymüş group_by()gibi değerleri nasıl ürettiğini gösteriyor df$b. Ayrıca, bunu doğru bir şekilde anlıyormuş gibi yapmıyorum - ama bunun öğrenmeme yardımcı olacağını umuyorum - bunu yayınlamamın tek nedeni bu!

by_b <- tbl_df(df) %>% group_by(b)

Veri kümesinde bulunamayacak bir "sınır dışı" değeri tanımlayın.

oob_val <- nrow(by_b)+1

nitelikleri "hile" olarak değiştirin summarise():

attr(by_b, "indices")[[3]] <- rep(NA,oob_val)
attr(by_b, "group_sizes")[3] <- 0
attr(by_b, "labels")[3,] <- 3

özeti yap:

res <- by_b %>% summarise(count_a = n())

oob_val'in tüm oluşumlarını dizine ekleyin ve değiştirin

res[res == oob_val] <- 0

amaçlanan:

> res
Source: local data frame [3 x 2]

b count_a
1 1       6
2 2       6
3 3       0

11

bu tam olarak soruda sorulan şey değil, ama en azından bu basit örnek için, xtabs kullanarak aynı sonucu elde edebilirsiniz, örneğin:

dplyr kullanarak:

df %>%
  xtabs(formula = ~ b) %>%
  as.data.frame()

veya daha kısa:

as.data.frame(xtabs( ~ b, df))

sonuç (her iki durumda da eşittir):

  b Freq
1 1    6
2 2    6
3 3    0
Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.