Geom_bar ggplot2'deki çubukları yeniden sıralayın


119

Arsanın miRNAen yüksekten en valuedüşüğe doğru sıralandığı bir çubuk arsa yapmaya çalışıyorum miRNA. Kodum neden çalışmıyor?

> head(corr.m)

        miRNA         variable value
1    mmu-miR-532-3p      pos     7
2    mmu-miR-1983        pos    75
3    mmu-miR-301a-3p     pos    70
4    mmu-miR-96-5p       pos     5
5    mmu-miR-139-5p      pos    10
6    mmu-miR-5097        pos    47

ggplot(corr.m, aes(x=reorder(miRNA, value), y=value, fill=variable)) + 
  geom_bar(stat="identity")

Yanıtlar:


216

Barkodun düşükten yükseğe doğru sıralanması dışında kodunuz iyi çalışıyor. Çubukları yüksekten düşüğe doğru sıralamak istediğinizde, -önce bir işaret eklemeniz gerekir value:

ggplot(corr.m, aes(x = reorder(miRNA, -value), y = value, fill = variable)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

hangi verir:

görüntü açıklamasını buraya girin


Kullanılan veriler:

corr.m <- structure(list(miRNA = structure(c(5L, 2L, 3L, 6L, 1L, 4L), .Label = c("mmu-miR-139-5p", "mmu-miR-1983", "mmu-miR-301a-3p", "mmu-miR-5097", "mmu-miR-532-3p", "mmu-miR-96-5p"), class = "factor"),
                         variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "pos", class = "factor"),
                         value = c(7L, 75L, 70L, 5L, 10L, 47L)),
                    class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))


@ user3741035 Garip. Yukarıda sağladığınız örnek veri kümesinde mi yoksa tüm veri kümesinde mi kullandınız?
Jaap

R & ggplot'un hangi sürümünü kullanıyorsunuz? Ayrıca daha büyük bir örnek veri kümesine (tercihen birden fazla değerle variable) ayrıcalık tanıyabilir misiniz ?
Jaap

6
çözümü buldum: İşleri karıştıran kitaplığı (gplots)
yükledim

1
@maycca Bana doğru sonucu veriyor (hem OSX 10.10.4 / Windows 7, R 3.2.3 ve ggplot2 2.1.0'da). Belki yeni bir seansla başlamalısın?
Jaap
Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.