İki RMarkdown (.Rmd) dosyası tek bir çıktıda nasıl birleştirilir?

Aynı klasörde iki dosyam var: aşağıdaki içeriğe sahip bölüm1.Rmd ve bölüm2.Rmd:

Bölüm1.Rmd

---
title: "Chapter 1"
output: pdf_document
---

## This is chapter 1. {#Chapter1}

Next up: [chapter 2](#Chapter2)

Bölüm2.Rmd

---
title: "Chapter 2"
output: pdf_document
---

## This is chapter 2. {#Chapter2}

Previously: [chapter 1](#Chapter1)

Bunları tek bir pdf çıktısında birleşecek şekilde nasıl örebilirim?

Elbette render(input = "chapter1.Rmd", output_format = "pdf_document")mükemmel çalışıyor ama render(input = "chapter1.Rmd", input = "chapter2.Rmd", output_format = "pdf_document")yaramıyor.

Bunu neden yapmak istiyorum? Dev bir belgeyi mantıksal dosyalara bölmek için .

@Hadley'in bookdown paketini .Rmd'den lateks oluşturmak için kullandım, ancak bu, bu belirli görev için aşırıya kaçmış gibi görünüyor. Eksik olduğum knitr / pandoc / linux komut satırını kullanan basit bir çözüm var mı? Teşekkürler.

Ağustos 2018 güncellemesi: Bu cevap, Rmarkdown tabanlı kitaplar yazmak için daha güçlü bir yaklaşım olan bookdown'un gelişinden önce yazılmıştır . Minimal göz atın bookdown Mikey-Harper @ örneğe cevap !

Büyük bir raporu ayrı bir Rmd'ye bölmek istediğimde, genellikle bir ana Rmd oluşturur ve bölümleri çocuk olarak eklerim. Bu yaklaşım, yeni kullanıcıların anlaması kolaydır ve bir içindekiler tablosu (toc) eklerseniz, bölümler arasında gezinmek kolaydır.

report.Rmd

---  
title: My Report  
output: 
  pdf_document:
    toc: yes 
---

```{r child = 'chapter1.Rmd'}
```

```{r child = 'chapter2.Rmd'}
```

Bölüm1.Rmd

# Chapter 1

This is chapter 1.

```{r}
1
```

Bölüm2.Rmd

# Chapter 2

This is chapter 2.

```{r}
2
```

İnşa etmek

rmarkdown::render('report.Rmd')

Hangi üretir:

Ve alt belgeleriniz için yığınlar oluşturmanın hızlı bir yolunu istiyorsanız:

rmd <- list.files(pattern = '*.Rmd', recursive = T)
chunks <- paste0("```{r child = '", rmd, "'}\n```\n")
cat(chunks, sep = '\n')
# ```{r child = 'chapter1.Rmd'}
# ```
#
# ```{r child = 'chapter2.Rmd'}
# ```

İnsanların birden çok R Markdown dosyasından raporlar oluşturmak için bookdown paketini kullanmalarını tavsiye ederim . Daha uzun belgeler için çok yararlı olan çapraz referans gibi birçok yararlı özellik ekler.

Örneği @Eric'ten uyarlayarak , aşağıda yer ayırma kurulumunun minimal bir örneğini bulabilirsiniz . Ana ayrıntı, ana dosyanın çağrılması index.Rmdve ek YAML satırını içermesidir site: bookdown::bookdown_site:

index.Rmd

---
title: "A Minimal bookdown document"
site: bookdown::bookdown_site
output:
  bookdown::pdf_document2:
    toc: yes
---

01-giriş.Rmd :

# Chapter 1

This is chapter 1.

```{r}
1
```

02-giriş.Rmd :

# Chapter 2

This is chapter 2.

```{r}
2
```

Biz Örme Eğer index.Rmd bookdown alfabetik aynı dizindeki tüm dosyaları birleştirme (bu davranış ekstra kullanılarak değiştirilebilir _bookdown.ymldosyası).

Eğer bu temel kurulum ile rahat olsun, ek yapılandırma dosyaları yani kullanarak bookdown belgesi ve çıkış biçimlerini özelleştirmek kolaydır _bookdown.ymlve_output.yml

Daha fazla okuma

• R Markdown: Kapsamlı Kılavuz : Bölüm 11, kitap indirmeye ilişkin harika bir genel bakış sunar
• Bookdown ile kitap yazmak , kitap düşürme konusunda kapsamlı bir kılavuz sağlar ve daha gelişmiş ayrıntılar için önerilir.

Bu benim için çalıştı:

Rmd_bind <- 
    function(dir = ".",
    book_header = readLines(textConnection("---\ntitle: 'Title'\n---")))
{
    old <- setwd(dir)
    if(length(grep("book.Rmd", list.files())) > 0){
    warning("book.Rmd already exists")
    }
    write(book_header, file = "book.Rmd", )
    cfiles <- list.files(pattern = "*.Rmd", )
    ttext <- NULL
    for(i in 1:length(cfiles)){
    text <- readLines(cfiles[i])
    hspan <- grep("---", text)
    text <- text[-c(hspan[1]:hspan[2])]
    write(text, sep = "\n", file = "book.Rmd", append = T)
    }
    render("book.Rmd", output_format = "pdf_document")
    setwd(old)
    }

Daha iyi bir çözüm olduğunu hayal edin ve rmarkdown veya örme paketlerde buna benzer bir şeye sahip olmak güzel olurdu.