DISPLAY tanımsız olduğunda matplotlib ile bir PNG oluşturma

Python ile networkx kullanmaya çalışıyorum. Bu programı çalıştırdığımda bu hatayı alıyorum. Eksik bir şey var mı?

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Şimdi farklı bir hata alıyorum:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Şimdi farklı bir hata alıyorum:

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

Ana sorun (sisteminizde) matplotlib varsayılan olarak bir x-kullanarak arka uç seçmesidir. Aynı problemi sunucularımdan birinde de yaşadım. Benim için çözüm, diğer herhangi bir pylab / matplotlib / pyplot içe aktarmadan önce okunan bir yere aşağıdaki kodu eklemekti :

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

Alternatif .matplotlibrc içinde ayarlamak için

Tıpkı Reinout'un cevabının bir tamamlayıcısı olarak.

Bu tür bir sorunu çözmenin kalıcı yolu .matplotlibrc dosyasını düzenlemektir. Aracılığıyla bulun

>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

Ardından bu dosyadaki arka ucu olarak değiştirin backend : Agg. İşte bu.

Temiz cevap, yürütme ortamınızı doğru bir şekilde hazırlamak için biraz zaman ayırmaktır.

Eğer çalıştırma ortamını hazırlamak zorunda İlk teknik bir kullanmaktır matplotlibrcdosyayı olarak akıllıca Chris Q. tarafından önerilen ayar,

backend : Agg

bu dosyada. Matplotlib'in matplotlibrcdosyayı nasıl ve nerede arayacağını ve nerede bulacağını - kod değişikliği olmadan - bile kontrol edebilirsiniz .

Yürütme ortamınızı hazırlamanız gereken ikinci teknik, MPLBACKENDortam değişkenini kullanmaktır (ve kullanıcılarınızı bundan yararlanmaları için bilgilendirmektir):

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

Bu işe yarar, çünkü bu işi yapmak için diskte başka bir dosya bile sağlamanız gerekmez. Bu yaklaşımı, örneğin sürekli entegrasyonda test etme ve ekranları olmayan uzak makinelerde çalıştırma ile kullandım.

Matplotlib arka ucunuzu Python kodunuzda "Agg" ye sabit olarak kodlamak, kare bir peg'i büyük bir çekiçle yuvarlak bir deliğe daldırmaya benzer, bunun yerine matplotlib'e kare bir delik olması gerektiğini söylemiş olabilirsiniz.

Spark aracılığıyla matplotlib kullanırken hata aldım. matplotlib.use('Agg')benim için çalışmıyor. Sonunda, aşağıdaki kod benim için çalışıyor. Daha fazlası burada

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

Sadece @Ivo Bosticky'nin gözden kaçabilecek söylediklerini tekrarlayacağım. Bu satırları py dosyasının ÇOK başlangıcına koyun .

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

Ya da biri hata alır

* / usr / lib / pymodules / python2.7 / matplotlib / __ init__.py:923: UserWarning: matplotlib.use () öğesine yapılan bu çağrının hiçbir etkisi yoktur
çünkü arka uç zaten seçilmiş;
matplotlib.use (), * pylab, matplotlib.pyplot, * öncesinde * çağrılmalıdır.

Bu, tüm Ekran sorununu çözecektir

Bu snippet'in X ve X olmayan ortamlar arasında geçiş yaparken iyi çalıştığını gördüm.

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Kodu yürütmek için sunucuda oturum açarken bunun yerine şunu kullanın:

ssh -X username@servername

-XHiçbir görüntü adı ve hiçbir $ DISPLAY değişkeni hata kurtulur

:)

Hangi sistemdesiniz? X11 ile bir sisteminiz var gibi görünüyor, ancak DISPLAY ortam değişkeni düzgün ayarlanmamış. Aşağıdaki komutu çalıştırmayı ve ardından programınızı yeniden çalıştırmayı deneyin:

export DISPLAY=localhost:0

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

Benim için çalışıyor.

Kontrol edilmesi gereken bir diğer şey, mevcut kullanıcınızın X ekranına bağlanma yetkisine sahip olup olmadığıdır. Benim durumumda, root'un bunu yapmasına izin verilmedi ve matplotlib aynı hatayla şikayet ediyordu.

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

kaynak: http://www.debian-administration.org/articles/494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

Kodunuzun Windows, Linux ve OSX'te ve ekranlı ve ekransız sistemlerde taşınabilir olduğundan emin olmak için aşağıdaki snippet'i öneririm:

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

Kredi bilgileri: https://stackoverflow.com/a/45756291/207661

Google Cloud Machine Öğrenim Motoru için:

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

Ve sonra dosyaya yazdırmak için:

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

PDF oluşturmak için:

multi_page(report_name)