Conda ortamı oluşturun: “Çatışma bulundu!” ortamı çözerken ve “en kısa çatışma yolunu bulma” sonsuza dek sürerken

12

environment.ubuntu.ymlBir conda ortamı oluşturmak için bana bir dosya sağlandı. Ancak, çalışan conda create env --file environment.ubuntu.ymlaşağıdaki çıktıyı alıyorum:

conda env create --file environment.ubuntu.yml
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: - 
Found conflicts! Looking for incompatible packages.
This can take several minutes.  Press CTRL-C to abort.
Examining fontconfig:   5%|▉                 | 10/202 [00:00<00:00, 5393.91it/ ]
Comparing specs that have this dependency:   0%|         | 0/12 [00:00<?, ?it/s]
Finding shortest confli|  path for fontconfig==2.13.1=he4413a7_1000:  12%|▏| 1/8
Finding shortest conflict path for fontconfig==2.13.1=he4413a7_1000:  25%|▎| 2/8
Finding shortest conflict pa/  for fontconfig[version='>=2.13.0,<3.0a0']:  25%|
Finding shortest conflict path for fontconfig[version='>=2.13.0,<3.0a0']:  38%|
Finding shortest conf- ct path for fontconfig[version='>=2.11.1']:  38%|▍| 3/8 [
Finding shortest conflict path for fontconfig[version='>=2.11.1']:  50%|▌| 4/8 [
Finding shortest conflict pa|  for fontconfig[version='>=2.12.4,<3.0a0']:  50%|
...

Finding shortest conflict pathGörünüşe göre bazı bağımlılık sorunları çözmek için çalışıyor - uzun süre devam eder. 2 saat boyunca koşup durmayacağı belli değil.

Sorum şu: Burada neler oluyor ve bu işlemi bir şekilde manuel olarak hızlandırabilir miyim, örneğin gereksiz bağımlılıkları kaldırarak? Ortamı yaratmadığım için hangisinin gerçekten gerekli olduğunu bilmiyorum.

Merak etmemin sebebi, içeri fontconfig[version='>=2.12.6,<3.0a0']girdiği zaman olduğu gibi çatışma yollarını kontrol ediyor dependenciesolması 2.13.1ve2.13.1

Başvuru için lütfen .yml dosyasının altına bakın.

name: cea
channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - dlr-sc
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - conda-forge
  - conda-forge/label/gcc7
  - defaults
dependencies:
  - attrs=19.1.0=py_0
  - backports=1.0=py_2
  - backports.functools_lru_cache=1.5=py_1
  - backports_abc=0.5=py_1
  - boost-cpp=1.68.0=h11c811c_1000
  - bzip2=1.0.6=h14c3975_1002
  - ca-certificates=2019.3.9=hecc5488_0
  - cairo=1.14.12=h80bd089_1005
  - certifi=2019.3.9=py27_0
  - click=7.0=py_0
  - click-plugins=1.0.4=py_0
  - cligj=0.5.0=py_0
  - curl=7.64.1=hf8cf82a_0
  - cycler=0.10.0=py_1
  - descartes=1.1.0=py_2
  - enum34=1.1.6=py27_1001
  - expat=2.2.5=hf484d3e_1002
  - fiona=1.8.6=py27hf242f0b_2
  - fontconfig=2.13.1=he4413a7_1000
  - freetype=2.10.0=he983fc9_0
  - freexl=1.0.5=h14c3975_1002
  - functools32=3.2.3.2=py_3
  - futures=3.2.0=py27_1000
  - gdal=2.4.1=py27h5f563d9_8
  - geopandas=0.4.1=py_1
  - geos=3.7.1=hf484d3e_1000
  - geotiff=1.4.3=h1105359_1000
  - gettext=0.19.8.1=hc5be6a0_1002
  - giflib=5.1.7=h516909a_1
  - glib=2.56.2=had28632_1001
  - hdf4=4.2.13=h9a582f1_1002
  - hdf5=1.10.4=nompi_h3c11f04_1106
  - icu=58.2=hf484d3e_1000
  - jpeg=9c=h14c3975_1001
  - json-c=0.13.1=h14c3975_1001
  - kealib=1.4.10=h1978553_1003
  - kiwisolver=1.0.1=py27h6bb024c_1002
  - krb5=1.16.3=h05b26f9_1001
  - libblas=3.8.0=4_openblas
  - libcblas=3.8.0=4_openblas
  - libcurl=7.64.1=hda55be3_0
  - libdap4=3.19.1=hd48c02d_1000
  - libedit=3.1.20170329=hf8c457e_1001
  - libffi=3.2.1=he1b5a44_1006
  - libgdal=2.4.1=heae24aa_8
  - libiconv=1.15=h516909a_1005
  - libkml=1.3.0=h328b03d_1009
  - liblapack=3.8.0=4_openblas
  - libnetcdf=4.6.2=hbdf4f91_1001
  - libpng=1.6.36=h84994c4_1000
  - libpq=11.2=h4770945_0
  - libspatialindex=1.9.0=he1b5a44_0
  - libspatialite=4.3.0a=hb5ec416_1026
  - libssh2=1.8.2=h22169c7_2
  - libtiff=4.0.10=h648cc4a_1001
  - libuuid=2.32.1=h14c3975_1000
  - libxcb=1.13=h14c3975_1002
  - libxml2=2.9.8=h143f9aa_1005
  - mapclassify=1.0.1=py27_1
  - matplotlib=2.2.3=py27h8a2030e_1
  - matplotlib-base=2.2.3=py27h60b886d_1
  - munch=2.3.2=py_0
  - ncurses=6.1=hf484d3e_1002
  - numpy=1.16.2=py27h8b7e671_1
  - openblas=0.3.5=h9ac9557_1001
  - openjpeg=2.3.0=hf38bd82_1003
  - openssl=1.1.1b=h14c3975_1
  - pandas=0.24.2=py27hf484d3e_0
  - pip=19.0.3=py27_0
  - pixman=0.34.0=h14c3975_1003
  - poppler=0.67.0=h2fc8fa2_1002
  - poppler-data=0.4.9=1
  - postgresql=11.2=h61314c7_0
  - proj4=5.2.0=h14c3975_1001
  - pthread-stubs=0.4=h14c3975_1001
  - pyparsing=2.3.1=py_0
  - pyproj=1.9.6=py27hc0953d3_1000
  - pyqt=5.6.0=py27h13b7fb3_1008
  - python=2.7.15=h721da81_1008
  - python-dateutil=2.8.0=py_0
  - pytz=2018.9=py_0
  - readline=7.0=hf8c457e_1001
  - rtree=0.8.3=py27h666c49c_1002
  - scipy=1.2.1=py27h09a28d5_1
  - setuptools=40.8.0=py27_0
  - shapely=1.6.4=py27h2afed24_1003
  - singledispatch=3.4.0.3=py27_1000
  - sip=4.18.1=py27hf484d3e_1000
  - six=1.12.0=py27_1000
  - sqlite=3.26.0=h67949de_1001
  - subprocess32=3.5.3=py27h14c3975_0
  - tbb=2019.5=hc9558a2_0
  - tk=8.6.9=h84994c4_1001
  - tornado=5.1.1=py27h14c3975_1000
  - tzcode=2018g=h14c3975_1001
  - wheel=0.33.1=py27_0
  - xerces-c=3.2.2=hac72e42_1001
  - xorg-kbproto=1.0.7=h14c3975_1002
  - xorg-libice=1.0.9=h516909a_1004
  - xorg-libsm=1.2.3=h84519dc_1000
  - xorg-libx11=1.6.7=h14c3975_1000
  - xorg-libxau=1.0.9=h14c3975_0
  - xorg-libxdmcp=1.1.3=h516909a_0
  - xorg-libxext=1.3.4=h516909a_0
  - xorg-libxrender=0.9.10=h516909a_1002
  - xorg-renderproto=0.11.1=h14c3975_1002
  - xorg-xextproto=7.3.0=h14c3975_1002
  - xorg-xproto=7.0.31=h14c3975_1007
  - xz=5.2.4=h14c3975_1001
  - zlib=1.2.11=h14c3975_1004
  - freeimageplus=3.18.0=hf484d3e_2
  - gl2ps=1.3.8=h14c3975_4
  - oce=0.17.2=h6bb024c_10
  - pythonocc-core=0.17=py27_1
  - mkl=2017.0.3=0
  - mkl-service=1.1.2=py27_3
  - dbus=1.13.2=h714fa37_1
  - gst-plugins-base=1.14.0=hbbd80ab_1
  - gstreamer=1.14.0=hb453b48_1
  - libgcc-ng=8.2.0=hdf63c60_1
  - libgfortran-ng=7.3.0=hdf63c60_0
  - libstdcxx-ng=8.2.0=hdf63c60_1
  - pcre=8.43=he6710b0_0
  - qt=5.6.3=h8bf5577_3
  - pip:
    - alabaster==0.7.12
    - babel==2.6.0
    - backports.shutil-get-terminal-size==1.0.0
    - bleach==3.1.0
    - chardet==3.0.4
    - cloudpickle==0.8.1
    - configparser==3.7.4
    - cvxopt==1.2.3
    - decorator==4.4.0
    - defusedxml==0.5.0
    - docutils==0.14
    - doit==0.29.0
    - entrypoints==0.3
    - ephem==3.7.6.0
    - funcsigs==1.0.2
    - h5py==2.9.0
    - idna==2.8
    - imagesize==1.1.0
    - importlib-resources==1.0.2
    - ipaddress==1.0.22
    - ipykernel==4.10.0
    - ipython==5.8.0
    - ipython-genutils==0.2.0
    - ipywidgets==7.4.2
    - jinja2==2.10
    - joblib==0.12.5
    - jsonschema==3.0.1
    - jupyter==1.0.0
    - jupyter-client==5.2.4
    - jupyter-console==5.2.0
    - jupyter-core==4.4.0
    - llvmlite==0.28.0
    - lxml==4.3.3
    - markupsafe==1.1.1
    - mistune==0.8.4
    - mock==2.0.0
    - nbconvert==5.4.1
    - nbformat==4.4.0
    - networkx==2.2
    - notebook==5.7.8
    - numba==0.43.1
    - packaging==19.0
    - pandocfilters==1.4.2
    - pathlib2==2.3.3
    - patsy==0.5.1
    - pbr==5.1.3
    - pexpect==4.6.0
    - pickleshare==0.7.5
    - pkginfo==1.5.0.1
    - plotly==3.7.1
    - prometheus-client==0.6.0
    - prompt-toolkit==1.0.15
    - ptyprocess==0.6.0
    - py4design==0.27
    - pycollada==0.6
    - pygments==2.3.1
    - pyinotify==0.9.6
    - pymc3==3.6
    - pymf==0.1.9
    - pyrsistent==0.14.11
    - pysal==1.14.4.post2
    - pyshp==2.1.0
    - pyyaml==5.1
    - pyzmq==18.0.1
    - qtconsole==4.4.3
    - readme-renderer==24.0
    - requests==2.21.0
    - requests-toolbelt==0.9.1
    - retrying==1.3.3
    - salib==1.2
    - scandir==1.10.0
    - scikit-learn==0.20.3
    - seaborn==0.9.0
    - send2trash==1.5.0
    - simplegeneric==0.8.1
    - snowballstemmer==1.2.1
    - sphinx==1.8.5
    - sphinxcontrib-websupport==1.1.0
    - terminado==0.8.2
    - testpath==0.4.2
    - theano==1.0.4
    - timezonefinder==4.0.1
    - tqdm==4.31.1
    - traitlets==4.3.2
    - twine==1.13.0
    - typing==3.6.6
    - urllib3==1.24.1
    - utm==0.4.2
    - wcwidth==0.1.7
    - webencodings==0.5.1
    - widgetsnbextension==3.4.2
    - xlrd==1.2.0
    - xlwt==1.3.0
    - deap==1.3.0

— Toivo Säwén
kaynak

2

Evet, bu bir karmaşa. Nereden başlamalı ... Bunun büyük bir kısmının gereksiz olması muhtemeldir (Çin'de değilseniz kesinlikle bu Çin ayna kanallarına ihtiyacınız yoktur). Bunu doğrudan halletmenize yardım etmemiz için umutsuzluğa kapılıyorum. En iyi şansınız, aslında çalıştırmaya çalıştığınız bazı kod tabanınız varsa. GREP, içe aktarma ifadeleri için yalnızca içe aktarılanları tutar. Ve Conda'da bir şeyin eşdeğer bir paketi varsa, gerçekten pipbölümden taşınmalıdır , ancak bu sadece iyi bir uygulamadır ve env'yi oluşturma hedefinize doğru ilerlemez.

— merv

Bunun cevabı olduğundan endişelendim. O gibi çatışma yolları kontrol ediyor neden sadece merak ediyorum version='>=2.12.6,<3.0a0'bir zaman dependenciesolduğunu 2.13.1ve ben bunu yüklemiş conda install fontconfig=2.13.1.

— Toivo Säwén

Tam olarak emin değilim. Tahmin etmek zorunda kalsaydım, Conda çatışma çözümleme moduna girdiğinde, açık spesifikasyonu fontconfig=2.13.1başka bir kısıt olarak ele alıyor, bir bağımlılık (örneğin fontconfig[version='>=2.12.6,<3.0a0']) olan tüm paketlerden gelenlerle birlikte ve sonra bulmaya çalışıyor gibi görünüyor. kavşak. Belki de, tüm özelliklerinizin yapıya açık olduğu için, aslında kıpır kıpır oda olmadığı farkına varmaz.

— merv

7

Bu hata ve sonraki davranış büyük olasılıkla zaman zaman yerel ortamda tutarsızlıklara neden olan Anaconda hatasından kaynaklanmaktadır. 26 Ocak 2020 itibariyle hata henüz çözülmedi.

Benim için aynı sorun Mac'te derinden ortaya çıkıyor.

— sophros
kaynak

3

Genel olarak, bu sorunun cevabı, sadece gerekli kanallar ve kısıtlamalar ile .yml'nizi sıfırdan oluşturmalısınız. Sürüm kısıtlamalarını, 1.19.10 yerine yalnızca 1.19 gibi görünecek şekilde gevşetmelisiniz.

Ancak, bu tavsiyeyi izlememe rağmen, şu anda neredeyse tam olarak sorununuz var. Fontconfig üzerinde uzun saatler geçirdi ve vazgeçmeden önce bir gece bıraktım. Spesifikasyonum oldukça basit:

channels:
  - conda-forge
  - usgs-astrogeology
  - defaults
dependencies:
  - python=3.6
  - isis3
  - gdal=2.3

Anladığım zaman bunu düzenleyeceğim.

EDIT: Bu sorun burada tartışılıyor (kurmaya çalıştığım yazılıma özgü, muhtemelen başkaları için yararlı değil) https://github.com/USGS-Astrogeology/ISIS3/issues/3570

— foobarbecue
kaynak

1

Benim durumumda, ben yapı sürümleri (bazı yerini almıştı ...=he4413a7_1000orijinal dosyadaki olanlar olarak yeniden etiketlenmek edilmişti olarak kısım) brokenüzerine conda-forge. Ancak, bu bağımlılıklar için sürüm numarası değişmemiş olsa da, alt bağımlılıkları değişerek tüm bu çatışmalara neden olmuştur. Sonuç olarak: bağımlılıkları elle karıştırmayın.

Ben orijinal derleme sürümü özellikleri aynı tutarak ve ekleyerek sorunu çözdü conda-forge/labels/brokeniçin channelsbir parçası .ymldosyası.

— Toivo Säwén
kaynak

0

Aynı zamanda, Windows 10'da aynı sorunla karşı karşıya kaldım, 17.2020 itibariyle anaconda (python 3.7) ile son inşa et. Tuhaf bir şekilde pycharm'ın ayarlarındaki proje yorumlayıcı sayfasındaki "conda paket yöneticisini kullan", numpy'yi güncellememe ve paketleri normal bir şekilde yüklememe izin verdi. Conda paket yöneticisi olmadan ve conda paket yöneticisi ile bir paket kurmayı deneyin. İyi şanslar!

— Frozenranger
kaynak

-1

Bu konuyla tanıştım ve çözdüm. İlk olarak, anaconda sürümümün yaml dosyasının dışa aktarıldığı yerle tutarlı olmasını sağladım. Bu işe yaramaz olabilir ama tutarlı conda sürümünün tutarlı temel ortam vaat edebileceğini düşünüyorum. İkincisi, tüm bağımlılıkları ama aslında benim yaml dosyasında kullanmak istiyorum bazı 'ana' paketleri sildi.Bu demek 'ana' paket bağımlılık sorunları ele izin anlamına gelir.

— valax
kaynak

-1

Benim için çalıştı yaml dosyasına aşağıdaki ekledi:

channels:
  - conda-forge
  - defaults
  - conda-forge/label/broken

— Frank Tap
kaynak

Bunu başka bir cevapta zaten yazdım mı?

— Toivo Säwén

Üzgünüm, haklısın

— Frank Tap

-2

Benim için en iyisini yaptım:

which python (anaconda3 bölmesinde olduğunu doğrulayan)

python --version
conda search "^python$"

Anaconda için kullanılan sürümle (burada 3.7.3) hangi sürümün eşleştiğine dikkat edin (yeni bir ortam oluşturduğumdan, Anaconda'nın kullandığı Python'un aynı sürümünü kullanabilmemin sebebi var). Conda kanallarındaki girişimin (yukarıdaki conda araması) yalnızca bir 3.7.3 satır gösterdiğini unutmayın.

Sonra bunu yapın:

conda create -n myenv python=3.7.3 anaconda

Son komutu çalıştırmak için yaklaşık 1 dakika sürdü :)

— Cameron Tully-Smith
kaynak