Sayı dizilerini SWIG ile <int> & (başvuru) vektörüne dönüştürme


10

Amacım:

Python'da 3 numpy dizisi oluşturun (bunlardan 2 tanesi belirli değerlerle başlatılır), sonra üçünü de swig yoluyla vektör referansları olarak bir c ++ fonksiyonuna gönderin (bu, verilerin üzerine kopyalanmayı ve verimliliği kaybetmeyi önlemek içindir). C ++ işlevine girdikten sonra dizilerden 2'sini ekleyin ve toplamlarını 3. diziye koyun.

vec_ref.h

#include <vector>
#include <iostream>

void add_vec_ref(std::vector<int>& dst, std::vector<int>& src1, std::vector<int>& src2);

vec_ref.cpp

#include "vec_ref.h"
#include <cstring> // need for size_t
#include <cassert>

void add_vec_ref(std::vector<int>& dst, std::vector<int>& src1, std::vector<int>& src2) {
    std::cout << "inside add_vec_ref" << std::endl;
    assert(src1.size() == src2.size());
    dst.resize(src1.size());

    for (size_t i = 0; i < src1.size(); i++) {
        dst[i] = src1[i] + src2[i];
    }
}

vec_ref.i

%module vec_ref
%{
    #define SWIG_FILE_WITH_INIT
    #include "vec_ref.h"
%}

%include "numpy.i"
%init %{
import_array();
%}

%include "std_vector.i"
%template(vecInt) std::vector<int>;
// %template(vecIntRef) std::vector<int> &; 

// %apply (std::vector<int> * INPLACE_ARRAY1, int DIM1) {(std::vector<int> * dst, int a),(std::vector<int> * src1, int b),(std::vector<int> * src2, int c)};
// %apply (std::vector<int> * INPLACE_ARRAY1) {(std::vector<int> * dst),(std::vector<int> * src1),(std::vector<int> * src2)};
// %apply (std::vector<int> & INPLACE_ARRAY1) {(std::vector<int> & dst),(std::vector<int> & src1),(std::vector<int> & src2)};
// %apply (std::vector<int> & INPLACE_ARRAY1, int DIM1) {(std::vector<int> & dst, int a),(std::vector<int> & src1, int b),(std::vector<int> & src2, int c)};

%include "vec_ref.h"

Makefile

all:
    rm -f *.so *.o *_wrap.* *.pyc *.gch vec_ref.py
    swig -c++ -python vec_ref.i
    g++ -O0 -g3 -fpic -c vec_ref_wrap.cxx vec_ref.h vec_ref.cpp -I/home/lmckeereid/tools/anaconda3/pkgs/python-3.7.3-h0371630_0/include/python3.7m/
    g++ -O0 -g3 -shared vec_ref_wrap.o vec_ref.o -o _vec_ref.so

tester.py

import vec_ref as vec
import numpy as np

a = np.array([1,2,3], dtype=np.intc)
b = np.array([4,5,6], dtype=np.intc)
c = np.zeros(len(a), dtype=np.intc)

print('---Before---\na:', a)
print('b:', b)
print('c:', c)

vec.add_vec_ref(c,a,b)

print('---After---\na:', a)
print('b:', b)
print('c:', c)

Çıktı:

---Before---
a: [1 2 3]
b: [4 5 6]
c: [0 0 0]
Traceback (most recent call last):
  File "tester.py", line 12, in <module>
    vec.add_vec_ref(c,a,b)
TypeError: in method 'add_vec_ref', argument 1 of type 'std::vector< int,std::allocator< int > > &'

Ben vec_ref.i bulunan tüm yorum% uygulandı ve% şablon yönergeleri denedim, ama işe yaramadı.

Olmamam da dahil olmak üzere bazı tipemapler var mı?


3
Bu mümkün değil. C ++ 'da, yalnızca gerçekte var olan nesnelere referans oluşturabilirsiniz. Ancak, numpy dizileri a içermez std::vector.
— pschill

Yanıtlar:


3

@Pschill ile aynı fikirdeyim: Veri kopyalamadan std :: vector almak mümkün değil.

Alternatif olarak std::spansınıf şablonu (C ++ 20'de tanıtıldı) veya spanbir kitaplıkta tanımlanan benzer bir sınıf şablonu kullanmaktır.

Bir oluşturma std::span<int>bir sağlayacak görünümü , bir mevcut veri numpydizisinin ve temin birçok kullanışlı üye işlevlerini (örneğin operator[]yineleyicileri, front(), back()C ++, vs.).

Span oluşturmak asla numpy dizisinden veri kopyalamaz.


En iyi alternatif olarak gördüğümü sağladığınız için teşekkürler (kendi sınıfımı oluşturmanın yanı sıra).
— Otherness

Gerçekten C ++ fonksiyonumda kopyalamadan bir std :: vector kullanmak (ve değiştirmek) isteseydim, ne gibi alternatiflerim olurdu? Std :: raw için işaretçi vektör? std :: vector?
— Gabriel Devillers

@GabrielDevillers, eğer sorunuzu anlarsam, bir vektör varsa ve fonksiyonunuzda değiştirmek istiyorsanız, vector'a bir referans kullanmanızı tavsiye ederim : std::vector<T>& v
— NicholasM

@NicholasM SWIG kullanarak sarmak istediğim bir API demek istedim. Soruyorum çünkü SWIG'nin vektörlere const olmayan referansı sartamayacağını anlıyorum.
— Gabriel Devillers

Ay pardon. Özel durumunuza odaklanan yeni bir soru oluşturmanızı öneririm.
— NicholasM

0

Daha zarif bir şekilde elde etmek istediğiniz şeyi elde eden Facebook başarısız kütüphanesine başvurabilirsiniz.

Python'a özgü: numpy dizisi <-> C ++ işaretçi arabirimi (vektör)

Kodu Github sayfasında görebilirsiniz .

Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.