R cinsinden karşılaştırma "örnek" fonksiyonu

Ben kıyaslama edildi sampleR fonksiyonu ile karşılaştırarak igraph:sample_seqgarip sonucu içine ve kaçtı.

Ne zaman bir şey çalıştırmak:

library(microbenchmark)
library(igraph)
set.seed(1234)
N <- 55^4
M <- 500
(mbm <- microbenchmark(v1 = {sample(N,M)}, 
                       v2 = {igraph::sample_seq(1,N,M)}, times=50))

Böyle bir sonuç alıyorum:

Unit: microseconds
 expr       min        lq        mean     median        uq       max neval
   v1 21551.475 22655.996 26966.22166 23748.2555 28340.974 47566.237    50
   v2    32.873    37.952    82.85238    81.7675    96.141   358.277    50

Ama koştuğumda, örneğin,

set.seed(1234)
N <- 100^4
M <- 500
(mbm <- microbenchmark(v1 = {sample(N,M)}, 
                      v2 = {igraph::sample_seq(1,N,M)}, times=50))

Şunun için çok daha hızlı sonuç alıyorum sample:

Unit: microseconds
 expr    min     lq     mean  median     uq     max neval
   v1 52.165 55.636 64.70412 58.2395 78.636  88.120    50
   v2 39.174 43.504 62.09600 53.5715 73.253 176.419    50

Görünüşe Ngöre 10'un gücü (veya başka bir özel sayı?) Olduğunda, 10'un gücü olmayan samplediğer küçüklerden çok daha hızlıdır N. Bu beklenen davranış mı yoksa bir şey mi kaçırıyorum?

sample()daha doğrusu sample.int(), belirli koşullar karşılandığında varsayılan olarak bir karma algoritma kullanır, bunlardan biri n> 1e7'dir.

İkinci kıyaslama karma olmadan tekrar çalıştırılırsa, igraph işlevinden çok daha yavaş olduğunu göreceksiniz.

set.seed(1234)
N2 <- 100^4
M <- 500
(mbm <- microbenchmark(v1 = {sample.int(N2,M, useHash = FALSE)}, 
                       v2 = {igraph::sample_seq(1,N2,M)}, times=50))

Unit: microseconds
 expr        min         lq         mean     median         uq       max neval cld
   v1 144297.936 150368.649 167224.95664 154283.077 157832.520 407710.78    50   b
   v2     61.218     65.392     92.35544     87.885    118.262    148.87    50  a 

useHashArgümanın belgelerinden :

algoritmanın karma sürümünün kullanılıp kullanılmayacağını gösteren mantıksal. Yalnızca replace = FALSE, prob = NULL ve boyut <= n / 2 için kullanılabilir ve usehash = FALSE, n ile orantılı bellek kullanacağı için gerçekten büyük n için kullanılmalıdır.