Bir String> 4k'den oluşturulan yüklemde Oracle clob kullanın

Aşağıda bir Oracle SELECT yükleminde kullanılmak üzere 4000 dosya karakterleri (file_data bağlama değişkeninde sağlanan) bir dizeden bir clob oluşturmaya çalışıyorum:

myQuery=
select *
from dcr_mols
WHERE flexmatch(ctab,:file_data,'MATCH=ALL')=1;

TO_CLOB () yuvarlak file_data eklersem bir varchar için rezil Oracle 4k sınırını başarısız olur (<4k dizeleri için iyidir). Hata (SQL Developer'da):

ORA-01460: unimplemented or unreasonable conversion requested
01460. 00000 -  "unimplemented or unreasonable conversion requested"

FYI Esnek eşleşme işlevi molekülleri aramak için kullanılır ve burada açıklanmıştır: http://help.accelrysonline.com/ulm/onelab/1.0/content/ulm_pdfs/direct/developers/direct_2016_developersguide.pdf

Fonksiyonun kendisi biraz karmaşıktır ama özü 2. parametrenin bir clob olması gerekir. Yani benim sorum nasıl 4000 karakterden bind_variable bir Java String sql (veya Java) bir clob dönüştürmek olduğunu.

Java (Bahar önyükleme 2) kullanarak aşağıdaki yöntemi (clobs eklerken çalışır) denedim:

MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
parameters.addValue("file_data", fileDataStr,Types.CLOB);
jdbcNamedParameterTemplate.query(myQuery,parameters,…

Bu yöntem çalışmalıdır, ancak FYI olan dönüştürülmüş bir flexmatch hatasıyla başarısız olur:

SQL state [99999]; error code [29902]; ORA-29902: error in executing ODCIIndexStart() routine\nORA-20100: 
MDL-0203: Unable to read from CLOB (csfrm=1, csid=873): 
ORA-22922: nonexistent LOB value\nMDL-0021: Unable to copy LOB to string\nMDL-1051: Molstructure search query is not a valid molecule\nMDL-0976: 
Molecule index search initialization failed\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 329\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 309\n; nested exception is java.sql.SQLException: 
ORA-29902: error in executing ODCIIndexStart() routine\nORA-20100: MDL-0203: Unable to read from CLOB (csfrm=1, csid=873): 
ORA-22922: nonexistent LOB value\nMDL-0021: Unable to copy LOB to string\nMDL-1051: Molstructure search query is not a valid molecule\nMDL-0976: 
Molecule index search initialization failed\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 329\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 309\n"

Not SpringBoot 2 kullanıyorum ama (bile benim bahar NamedParametersJdbcTemplate nesneden elde edilen) bir OracleConnection kullanarak herhangi bir yöntem alamıyorum (hatta <4k clobs), bu yüzden aptalca bir şey yaptığından şüpheleniyorum. Denedim:

 @Autowired
 NamedParameterJdbcTemplate  jdbcNamedParameterTemplate;
OracleConnection conn =  this.jdbcNamedParameterTemplate.getJdbcTemplate().getDataSource().getConnection().unwrap(OracleConnection.class);
Clob myClob =  conn.createClob();
myClob.setString( 1, fileDataStr);
MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
parameters.addValue("file_data", myClob,Types.CLOB);

application.properties:

spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@//${ORA_HOST}:${ORA_PORT}/${ORA_SID}
spring.datasource.username=${ORA_USER}
spring.datasource.password=${ORA_PASS}

Ben eski okula gidip bahar olmayan bir bağlantı artı bir setClob () yöntemi olan bir PreparedStatement kullanırsanız iyi çalışır unutmayın:

OracleDataSource ods = new OracleDataSource();
String url ="jdbc:oracle:thin:@//" + ORA_HOST +":"+ORA_PORT +"/"+ORA_SID;
ods.setURL(url);
ods.setUser(user);
ods.setPassword(passwd);
Connection conn = ods.getConnection();
Clob myClob=conn.createClob();
PreparedStatement ps = conn.prepareStatement("select dcr_number from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1");
myClob.setString(1,myMol);
ps.setClob(1,myClob);
ResultSet rs =ps.executeQuery();

Ancak Java veya Sql'de bir Spring 2 çözümünü tercih ederim. Herhangi bir yardım, öneri takdir.

Akış. Büyük bir değeri bir SQL deyimine yapıştıramazsınız.

Yapmanız gerekenler:

• INSERTİfadeye boş bir BLOB ekleyin (EMPTY_BLOB () kullanarak? ... hatırlamıyorum).
• Boş damla için çıkış akışını alın.
• Sonra dosyadan bir girdi akışı alın. Lütfen dosyanın tamamını belleğe yüklemeyin.
• Daha sonra tamponları kullanarak blokları giriş akışından çıkış akışına aktarın. 16 KB'lık bir arabellek yapmalıdır.
• Her iki akışı da kapatın.

Oracle'daki büyük verilerle baş etmenin standart yolu budur. Orada çok sayıda örnek var.

Büyük verileri ( BLOBve CLOBtürleri) almak aynı şekilde çalışır. Bu durumda yalnızca InputStreams kullanın.

"BIOVIA Direct" API'sinin belgelerini okurken, aşağıda gösterilen alıntıdan sayfa 27'de ilginç bir örnek var:

select ...
from ...
where flexmatch(
ctab,
(select ctab from nostruct_table),
'all'
)=1

Zaten yüklü bir CLOB kullanır . Bu nedenle, yeterince iyi bir çözüm CLOB'unuzu bir tablonuza yüklemek (veya önceden önceden yüklemek) ve sadece bunları kullanmak olacaktır.

Adım # 1 - CLOB'nizi bir tabloya yükleyin:

create table mol_file (
  id number(12) primary key not null,
  content clob
);

insert into mol_file (id, content) values (:id, :content);

Ve Java kodunuzu, başka bir yanıtta gösterildiği gibi CLOB eklentisini (muhtemelen akışları kullanarak) gerçekleştirmek için kullanın (İnternette çok sayıda örnek). Örneğin, mol veri içeriğinizi ID = ile ekleyin 123.

Adım # 2 - Yüklü mol dosyasını kullanarak sorgunuzu çalıştırın:

select *
from dcr_mols
WHERE flexmatch(
        ctab,
        (select content from mol_file where id = :id),
        'MATCH=ALL'
      ) = 1;

:idParametreyi, 123önceden yüklediğiniz dosyayı (veya başka bir dosyayı) kullanacak şekilde ayarlayabilirsiniz .

Eski moda fonksiyonunuza böyle diyebilirsiniz. ResultSet'i işlemek için bir Sınıf oluşturma

 class MyPreparedStatementCallback implements PreparedStatementCallback {
    public Object doInPreparedStatement(PreparedStatement preparedStatement)
            throws SQLException, DataAccessException {
        ResultSet rs = preparedStatement.executeQuery();
        List result = new LinkedList();
        rs.close();
        return result;
    }
}

ve yönteminizde JdbcTemplate kullanarak sorgunuzu arayın

 jdbcTemplate.execute(new PreparedStatementCreator() {
        @Override
        public PreparedStatement createPreparedStatement(Connection connection)

                throws SQLException, DataAccessException {

            PreparedStatement ps = connection.prepareStatement("select dcr_number from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1");
            Clob myClob =  connection.createClob();
            myClob.setString( 1, fileDataStr);
            MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
            parameters.addValue("file_data", myClob, Types.CLOB);
            ps.setClob(1,myClob);
            return ps;

        };
    }, new MyPreparedStatementCallback());

Bir PreparedStatement kullanmaya geri dönmek zorunda kaldım, ancak Spring'den bağlantı alıp ResacheSet'i bir nesne listesine eşleştirmek için apache commons BeanListHandler kullanarak normal uygulamayı biraz geliştirdim.

import org.apache.commons.dbutils.ResultSetHandler;
import org.apache.commons.dbutils.handlers.BeanListHandler;

@Autowired
NamedParameterJdbcTemplate  jdbcTemplate;

List<MyDao> myMethod(String fileData){
    String myQuery="select * from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1";

try {
    Connection conn =  this.jdbcTemplate.getJdbcTemplate().getDataSource().getConnection().unwrap(OracleConnection.class);   // Get connection from spring

    Clob myClob =  conn.createClob();   // Open a dB clob 
    myClob.setString( 1, fileData);     // add data to clob
    PreparedStatement ps = conn.prepareStatement(myQuery);
    ps.setClob(1,myClob);              // Add a clob into the PreparedStatement
    ResultSet rs =ps.executeQuery();   // Execute the prepared statement

    //ResultSetHandler<List<MyDao>> handler = new BeanListHandler<MyDao>(MyDao.class);   // Define the ResultSet handler
    ResultSetHandler<List<MyDao>> handler = new BeanListHandler<MyDao>(MyDao.class, new BasicRowProcessor(new GenerousBeanProcessor()));  // This is better than the above handler , because GenerousBeanProcessor removes the requirement for the column names to exactly match the java variables

    List<MyDao> myDaoList = handler.handle(rs);   // Map ResultSet to List of MyDao objects
    }catch (Exception e) {
        e.printStackTrace();
    }

return myDaoList;
}

Bağlantı olan con'u kullanarak fileDataStr dosyasını CLOB olarak bildirebilirsiniz

java.sql.Clob fileDataStr = oracle.sql.CLOB.createTemporary
(con, false, oracle.sql.CLOB.DURATION_SESSION);

ve sonra aşağıdaki gibi kullanın

 parameters.addValue("file_data", fileDataStr,Types.CLOB);

Ayrıca bağlantı dizenizde Hizmet adı yerine SID kullanıyorsanız özellik dosyanızı aşağıdaki gibi değiştirmeyi deneyin

spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@//${ORA_HOST}:${ORA_PORT}:${ORA_SID}