Paralel hata ayıklama için hangi yazılımı kullanmak iyidir?

Şu anda herhangi bir paralel kod çalıştırmıyorum, ancak gelecekte OpenMP ve MPI hibridlerini kullanarak paralel kod çalıştırmayı tahmin ediyorum. Hata ayıklayıcılar seri projeler yürütürken benim için paha biçilmez araçlardı.

Paralel yazılımda hata ayıklamak için kullanmak isteyen herhangi biri paralel hata ayıklayıcı (veya çoklu hata ayıklayıcı) önerebilir mi? Özgür yazılım tercih edilir, ancak etkili ticari yazılımlardan bahsetmekte tereddüt etmeyin.

İki büyük ticari seçimler temelde vardır dışarı şunlardır: DDT (biz de kullanmak ne Allinea dan TACC (diğer açıklamada belirtildiği gibi) ve Totalview). Kıyaslanabilir özelliklere sahipler, hem aktif olarak geliştiriliyorlar hem de doğrudan rakipler.

Eclipse, MPI ve OpenMP programlama desteği ve paralel bir hata ayıklayıcı içermesi gereken Paralel Araçlar Platformuna sahiptir .

Curmudgeon'a cevap vermeliyim. Verimliliğim yukarıdaki önerilerden herhangi biriyle asla geliştirilmedi. Paralel olarak tercih ettiğim seçeneğe göre yavaş ve pahalı: İşlem başına bir gdb oturumu. Her gdb bir MPI işlemine bağlanabilir ve bir xterm'de oturabilir (bu otomatik olarak PETSc'de olur -start_in_debugger). Bunu mutlu bir şekilde 15 yıldır kullanıyorum. İtirazlar:

1) Global verilere bakamıyorum

MPI paylaşılan yok bir model olduğundan, küresel veri yok, yalnızca yerel veri var

2) Bu strateji birçok sürece ölçeklendirilmez

Hata da yok. Hatalar, bireysel işlemlerde olabilir, belki 1 veya 2 komşunun girişi olabilir. Gdb’yi kolayca katılan işlemlere kolayca ekleyebilirsiniz ( -debugger_nodes 0,5,17örneğin, kullandığınız PETSc’de ). Ayrıca, yukarıdaki sistemler her işlemden geçtiklerinde çok vazgeçerler, bu da onları yavaşlatır. Gdb yöntemi aslında, çok daha ölçeklenebilir.

Gdb de çok taşınabilir. Her yerde çalışır, C ++ ve Fortran'ı anlar ve çalışma içinde rasgele kod yürütmenize izin verir. İçinde çalışırken kolayca verileri görüntülemek için özel fonksiyonlar yazdım.

Seri ve paralel programlar için sadece iki hata ayıklayıcı kullanıyorum:

1. Kernighan hata ayıklayıcı, yani adli baskı ifadeleri ve dikkatli düşünme.
2. Http://www.open-mpi.org/faq/?category=debugging#serial-debuggers adresinde açıklandığı gibi birden fazla GDB örneği .

(2) 'nin yeterince ölçeklenemez olması durumunda, (1b)' ye bakın.

Orada Intel Parallel Studio paralel hata ayıklayıcı içerir. Daha önce hiç çalışmadım ama birkaç gösteride kullanıldığını gördüm. İşte bazı özellikleri gösteren bir video eğitimi .

Ayrıca, gdb'nin bazı durumlarda oldukça iyi çalışan birkaç ambalajı gördüm.

Totalview . Ticari bir hata ayıklayıcı. Her bir işlemcideki yığını görüntülemek çok kolaydır. İşlemciler / iş parçacıkları arasında değişken değerlerini görebilir (ve bunları değiştirebilirsiniz). Değişken değerlerini görselleştirmek için vektörleri veya matrisleri çizebilirsiniz. Görünüşe göre senaryo yazımı da (Tk / Tcl) sofistike gözlem noktası analizi için mümkün, ancak bununla hiç çalışmamıştım.

Ayıklama paralel kodlarına birkaç basit yollarla için, ayıklama bölümünde deal.II SSS birkaç cevapları derledik: https://github.com/dealii/dealii/wiki/Frequently-Asked-Questions#debugging -dealii-uygulamaları

Neden hiç kimsenin OP'yi tercih ettiği kadar açık kaynaklı ve özgür bir yazılım olan, ancak ticari meslektaşları kadar güçlü olmayan Padb'den (Paralel Uygulama Hata Ayıklayıcı) neden bahsetmediğini merak ediyorum , örneğin HPC için TotalView

İşte bana daha önce verilen bazı cevapların özeti:

OpenMP zamanlama işlevlerine sahiptir: omp_get_wtime()ve omp_get_wtick()- çevrimiçi dokümanlar

Google’ın bir CPU profili var

Orada Scalasca OpenMP ve MPI profili ve analizini yapar

Sonra kullanmadığım Tau ve vtune var.

İyi şanslar!