Sorun
Çekirdek 2.6.32 ve 128 GB fiziksel RAM'e sahip bir CentOS makinesi birkaç gün önce başını belaya soktu. Sorumlu sistem yöneticisi, PHP-FPM uygulamasının, takas nedeniyle artık taleplere zamanında cevap vermediğini ve free
neredeyse hiç bellek kalmamış olduğunu gördükten sonra, makineyi yeniden başlatmayı seçtiğini söyledi.
Boş hafızanın Linux'ta kafa karıştırıcı bir kavram olabileceğini ve belki de yeniden başlatmanın yanlış bir şey olduğunu biliyorum. Ancak, söz konusu yönetici PHP uygulamasını (sorumlu olduğum) sorumlu tutuyor ve daha fazla araştırma yapmayı reddediyor.
Tek başıma öğrenebileceğim şey şu:
- Yeniden başlatmadan önce boş hafıza (tamponlar ve önbellek dahil) sadece birkaç yüz MB idi.
- Yeniden başlatmadan önce,
/proc/meminfo
yaklaşık 90 GB (evet, GB) civarında Slab bellek kullanımı bildirildi. - Yeniden başlattıktan sonra, boş hafıza 119 GB'dı, bir saat içinde 100 GB'a düşüyordu, çünkü PHP-FPM işçileri (yaklaşık 600 tanesi) hayatlarına geri dönüyordu; RES sütunu üsttedir (aylardır bu şekilde olmuştur ve PHP uygulamasının niteliği göz önüne alındığında mükemmel şekilde uygundur). Sıradışı veya kayda değer miktarda RAM tüketen işlem listesinde başka hiçbir şey yoktur.
- Yeniden başlattıktan sonra Slab hafızası 300 MB civarındaydı.
O zamandan beri sistemi izliyorsanız ve en önemlisi, Slab hafızası, günde yaklaşık 5 GB'lık bir düz çizgi şeklinde artmaktadır. Tarafından bildirilen boş bellek free
ve /proc/meminfo
aynı oranda azalır. Slab şu anda 46 GB'da. Girişlere göre slabtop
çoğuna göre kullanılır dentry
:
Boş hafıza:
free -m
total used free shared buffers cached
Mem: 129048 76435 52612 0 144 7675
-/+ buffers/cache: 68615 60432
Swap: 8191 0 8191
meminfo:
cat /proc/meminfo
MemTotal: 132145324 kB
MemFree: 53620068 kB
Buffers: 147760 kB
Cached: 8239072 kB
SwapCached: 0 kB
Active: 20300940 kB
Inactive: 6512716 kB
Active(anon): 18408460 kB
Inactive(anon): 24736 kB
Active(file): 1892480 kB
Inactive(file): 6487980 kB
Unevictable: 8608 kB
Mlocked: 8608 kB
SwapTotal: 8388600 kB
SwapFree: 8388600 kB
Dirty: 11416 kB
Writeback: 0 kB
AnonPages: 18436224 kB
Mapped: 94536 kB
Shmem: 6364 kB
Slab: 46240380 kB
SReclaimable: 44561644 kB
SUnreclaim: 1678736 kB
KernelStack: 9336 kB
PageTables: 457516 kB
NFS_Unstable: 0 kB
Bounce: 0 kB
WritebackTmp: 0 kB
CommitLimit: 72364108 kB
Committed_AS: 22305444 kB
VmallocTotal: 34359738367 kB
VmallocUsed: 480164 kB
VmallocChunk: 34290830848 kB
HardwareCorrupted: 0 kB
AnonHugePages: 12216320 kB
HugePages_Total: 2048
HugePages_Free: 2048
HugePages_Rsvd: 0
HugePages_Surp: 0
Hugepagesize: 2048 kB
DirectMap4k: 5604 kB
DirectMap2M: 2078720 kB
DirectMap1G: 132120576 kB
Slabtop:
slabtop --once
Active / Total Objects (% used) : 225920064 / 226193412 (99.9%)
Active / Total Slabs (% used) : 11556364 / 11556415 (100.0%)
Active / Total Caches (% used) : 110 / 194 (56.7%)
Active / Total Size (% used) : 43278793.73K / 43315465.42K (99.9%)
Minimum / Average / Maximum Object : 0.02K / 0.19K / 4096.00K
OBJS ACTIVE USE OBJ SIZE SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME
221416340 221416039 3% 0.19K 11070817 20 44283268K dentry
1123443 1122739 99% 0.41K 124827 9 499308K fuse_request
1122320 1122180 99% 0.75K 224464 5 897856K fuse_inode
761539 754272 99% 0.20K 40081 19 160324K vm_area_struct
437858 223259 50% 0.10K 11834 37 47336K buffer_head
353353 347519 98% 0.05K 4589 77 18356K anon_vma_chain
325090 324190 99% 0.06K 5510 59 22040K size-64
146272 145422 99% 0.03K 1306 112 5224K size-32
137625 137614 99% 1.02K 45875 3 183500K nfs_inode_cache
128800 118407 91% 0.04K 1400 92 5600K anon_vma
59101 46853 79% 0.55K 8443 7 33772K radix_tree_node
52620 52009 98% 0.12K 1754 30 7016K size-128
19359 19253 99% 0.14K 717 27 2868K sysfs_dir_cache
10240 7746 75% 0.19K 512 20 2048K filp
VFS önbellek basıncı:
cat /proc/sys/vm/vfs_cache_pressure
125
Swappiness:
cat /proc/sys/vm/swappiness
0
Kullanılmayan hafızanın boşa harcandığını biliyorum, bu nedenle mutlaka kötü bir şey olmamalı (özellikle 44 GB'nin SReclaimable olduğu gösteriliyorsa). Ancak, görünüşe göre, makine yine de sorunlar yaşadı ve Slab’in 90 GB’yi aştığında birkaç gün içinde aynı şeylerin tekrar yaşanmasından korkuyorum.
Sorular
Bu sorularım var:
- Slab hafızasının her zaman fiziksel RAM olduğunu ve sayının MemFree değerinden zaten çıkarıldığını düşünmekte yanlış mıyım?
- Bu kadar yüksek sayıda dentry girişi normal midir? PHP uygulaması yaklaşık 1,5 M dosyaya erişebiliyor, ancak çoğu arşivde ve düzenli web trafiği için hiçbir zaman erişilemiyor.
- Önbelleğe alınan inode sayısının önbellek sayısına göre çok daha düşük olduğu gerçeği için bir açıklama olabilir, bir şekilde ilişkilendirilmemeleri gerekir mi?
- Sistem hafıza sorunuyla karşılaşırsa, çekirdek bazı dişlileri otomatik olarak serbest bırakmaz mı? Bunun olmamasının bir nedeni ne olabilir?
- Tüm bu hafızanın ne olduğunu görmek için dişçi önbelleğini "incelemenin" herhangi bir yolu var mı (yani önbellekte saklanan yollar nelerdir)? Belki de bu bir çeşit bellek sızıntısına, sembolik bağ döngüsüne veya gerçekten PHP uygulamasının yanlış yaptığı bir şeye işaret eder.
- PHP uygulama kodu ve tüm varlık dosyaları GlusterFS ağ dosya sistemi aracılığıyla monte edilir, bununla bir ilgisi olabilir mi?
Lütfen root olarak, sadece normal bir kullanıcı olarak araştırma yapamayacağımı ve yöneticinin yardım etmeyi reddettiğini unutmayın. echo 2 > /proc/sys/vm/drop_caches
Slab hafızasının gerçekten geri çağrılabilir olup olmadığını görmek için tipik bir testi bile yapmıyor .
Neler olup bittiğini ve daha fazlasını nasıl araştırabileceğime dair içgörü çok takdir edilecektir.
Güncellemeler
Bazı ileri tanı bilgileri:
Bağlantılar:
cat /proc/self/mounts
rootfs / rootfs rw 0 0
proc /proc proc rw,relatime 0 0
sysfs /sys sysfs rw,relatime 0 0
devtmpfs /dev devtmpfs rw,relatime,size=66063000k,nr_inodes=16515750,mode=755 0 0
devpts /dev/pts devpts rw,relatime,gid=5,mode=620,ptmxmode=000 0 0
tmpfs /dev/shm tmpfs rw,relatime 0 0
/dev/mapper/sysvg-lv_root / ext4 rw,relatime,barrier=1,data=ordered 0 0
/proc/bus/usb /proc/bus/usb usbfs rw,relatime 0 0
/dev/sda1 /boot ext4 rw,relatime,barrier=1,data=ordered 0 0
tmpfs /phptmp tmpfs rw,noatime,size=1048576k,nr_inodes=15728640,mode=777 0 0
tmpfs /wsdltmp tmpfs rw,noatime,size=1048576k,nr_inodes=15728640,mode=777 0 0
none /proc/sys/fs/binfmt_misc binfmt_misc rw,relatime 0 0
cgroup /cgroup/cpuset cgroup rw,relatime,cpuset 0 0
cgroup /cgroup/cpu cgroup rw,relatime,cpu 0 0
cgroup /cgroup/cpuacct cgroup rw,relatime,cpuacct 0 0
cgroup /cgroup/memory cgroup rw,relatime,memory 0 0
cgroup /cgroup/devices cgroup rw,relatime,devices 0 0
cgroup /cgroup/freezer cgroup rw,relatime,freezer 0 0
cgroup /cgroup/net_cls cgroup rw,relatime,net_cls 0 0
cgroup /cgroup/blkio cgroup rw,relatime,blkio 0 0
/etc/glusterfs/glusterfs-www.vol /var/www fuse.glusterfs rw,relatime,user_id=0,group_id=0,default_permissions,allow_other,max_read=131072 0 0
/etc/glusterfs/glusterfs-upload.vol /var/upload fuse.glusterfs rw,relatime,user_id=0,group_id=0,default_permissions,allow_other,max_read=131072 0 0
sunrpc /var/lib/nfs/rpc_pipefs rpc_pipefs rw,relatime 0 0
172.17.39.78:/www /data/www nfs rw,relatime,vers=3,rsize=65536,wsize=65536,namlen=255,hard,proto=tcp,port=38467,timeo=600,retrans=2,sec=sys,mountaddr=172.17.39.78,mountvers=3,mountport=38465,mountproto=tcp,local_lock=none,addr=172.17.39.78 0 0
Bilgi bağla:
cat /proc/self/mountinfo
16 21 0:3 / /proc rw,relatime - proc proc rw
17 21 0:0 / /sys rw,relatime - sysfs sysfs rw
18 21 0:5 / /dev rw,relatime - devtmpfs devtmpfs rw,size=66063000k,nr_inodes=16515750,mode=755
19 18 0:11 / /dev/pts rw,relatime - devpts devpts rw,gid=5,mode=620,ptmxmode=000
20 18 0:16 / /dev/shm rw,relatime - tmpfs tmpfs rw
21 1 253:1 / / rw,relatime - ext4 /dev/mapper/sysvg-lv_root rw,barrier=1,data=ordered
22 16 0:15 / /proc/bus/usb rw,relatime - usbfs /proc/bus/usb rw
23 21 8:1 / /boot rw,relatime - ext4 /dev/sda1 rw,barrier=1,data=ordered
24 21 0:17 / /phptmp rw,noatime - tmpfs tmpfs rw,size=1048576k,nr_inodes=15728640,mode=777
25 21 0:18 / /wsdltmp rw,noatime - tmpfs tmpfs rw,size=1048576k,nr_inodes=15728640,mode=777
26 16 0:19 / /proc/sys/fs/binfmt_misc rw,relatime - binfmt_misc none rw
27 21 0:20 / /cgroup/cpuset rw,relatime - cgroup cgroup rw,cpuset
28 21 0:21 / /cgroup/cpu rw,relatime - cgroup cgroup rw,cpu
29 21 0:22 / /cgroup/cpuacct rw,relatime - cgroup cgroup rw,cpuacct
30 21 0:23 / /cgroup/memory rw,relatime - cgroup cgroup rw,memory
31 21 0:24 / /cgroup/devices rw,relatime - cgroup cgroup rw,devices
32 21 0:25 / /cgroup/freezer rw,relatime - cgroup cgroup rw,freezer
33 21 0:26 / /cgroup/net_cls rw,relatime - cgroup cgroup rw,net_cls
34 21 0:27 / /cgroup/blkio rw,relatime - cgroup cgroup rw,blkio
35 21 0:28 / /var/www rw,relatime - fuse.glusterfs /etc/glusterfs/glusterfs-www.vol rw,user_id=0,group_id=0,default_permissions,allow_other,max_read=131072
36 21 0:29 / /var/upload rw,relatime - fuse.glusterfs /etc/glusterfs/glusterfs-upload.vol rw,user_id=0,group_id=0,default_permissions,allow_other,max_read=131072
37 21 0:30 / /var/lib/nfs/rpc_pipefs rw,relatime - rpc_pipefs sunrpc rw
39 21 0:31 / /data/www rw,relatime - nfs 172.17.39.78:/www rw,vers=3,rsize=65536,wsize=65536,namlen=255,hard,proto=tcp,port=38467,timeo=600,retrans=2,sec=sys,mountaddr=172.17.39.78,mountvers=3,mountport=38465,mountproto=tcp,local_lock=none,addr=172.17.39.78
GlusterFS yapılandırması:
cat /etc/glusterfs/glusterfs-www.vol
volume remote1
type protocol/client
option transport-type tcp
option remote-host 172.17.39.71
option ping-timeout 10
option transport.socket.nodelay on # undocumented option for speed
# http://gluster.org/pipermail/gluster-users/2009-September/003158.html
option remote-subvolume /data/www
end-volume
volume remote2
type protocol/client
option transport-type tcp
option remote-host 172.17.39.72
option ping-timeout 10
option transport.socket.nodelay on # undocumented option for speed
# http://gluster.org/pipermail/gluster-users/2009-September/003158.html
option remote-subvolume /data/www
end-volume
volume remote3
type protocol/client
option transport-type tcp
option remote-host 172.17.39.73
option ping-timeout 10
option transport.socket.nodelay on # undocumented option for speed
# http://gluster.org/pipermail/gluster-users/2009-September/003158.html
option remote-subvolume /data/www
end-volume
volume remote4
type protocol/client
option transport-type tcp
option remote-host 172.17.39.74
option ping-timeout 10
option transport.socket.nodelay on # undocumented option for speed
# http://gluster.org/pipermail/gluster-users/2009-September/003158.html
option remote-subvolume /data/www
end-volume
volume replicate1
type cluster/replicate
option lookup-unhashed off # off will reduce cpu usage, and network
option local-volume-name 'hostname'
subvolumes remote1 remote2
end-volume
volume replicate2
type cluster/replicate
option lookup-unhashed off # off will reduce cpu usage, and network
option local-volume-name 'hostname'
subvolumes remote3 remote4
end-volume
volume distribute
type cluster/distribute
subvolumes replicate1 replicate2
end-volume
volume iocache
type performance/io-cache
option cache-size 8192MB # default is 32MB
subvolumes distribute
end-volume
volume writeback
type performance/write-behind
option cache-size 1024MB
option window-size 1MB
subvolumes iocache
end-volume
### Add io-threads for parallel requisitions
volume iothreads
type performance/io-threads
option thread-count 64 # default is 16
subvolumes writeback
end-volume
volume ra
type performance/read-ahead
option page-size 2MB
option page-count 16
option force-atime-update no
subvolumes iothreads
end-volume
cat /etc/nfsmount.conf
. Ayrıca kendi dizininde çok sayıda dosya içeren herhangi bir dizininiz var mı?
cat /proc/self/mounts
ve (belki oldukça uzun) verinizcat /proc/self/mountinfo
.