NTFS günlük kaydı dosya sistemidir, bu nedenle USB sürücüsünde bir miktar gevşemeye neden olur ve bir şekilde sürücünün ortalama ömrünü azaltır. Artık tüm modern işletim sistemleri tarafından destekleniyor, ancak bazı eski Linux veya MacOS PC'lerin ntfs-3g sürücüsünü yüklemesi gerekebilir.
FAT32 tüm işletim sistemleri tarafından desteklenir, ancak maksimum 4 GB dosya boyutu sınırına sahiptir.
Yani hiçbiri USB sürücüler için iyi değil. exFAT en uygun olanıdır, çünkü özellikle flash sürücüler için tasarlanmıştır ve şimdi (neredeyse) tüm işletim sistemleri tarafından desteklenmektedir.