önceki komutlar bitinceye kadar bash komut dosyasını duraklatma

Aşağıdaki gibi görünen bir bash betiği var:

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

İlki için 30 tane daha devam etmek için bir tane daha döngü oluşturmak istiyorum. Örneğin.

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

Yeni kümeye başlamadan önce ilk iş grubunun bitmesini istiyorum. Ama nohupöyle görünüyor ki hepsi aynı anda çalışıyor.

Ben var nohupçünkü uzaktan sunucuma giriş yapıp oradaki işleri başlatıyorum ve bash'ımı kapatıyorum. Alternatif bir çözüm var mı?

Bunu waitsizin için yapmak için komutu kullanmak isteyeceksiniz. Tüm alt işlem kimliklerini yakalayabilir ve özellikle bekleyebilirsiniz veya komut dosyanızın oluşturduğu tek arka plan işlemleri bunlarsa, waitbağımsız değişken olmadan arayabilirsiniz . Örneğin:

#!/bin/bash
# run two processes in the background and wait for them to finish

nohup sleep 3 &
nohup sleep 10 &

echo "This will wait until both are done"
date
wait
date
echo "Done"

Birkaç nokta:

• Hedefiniz, nohupuzak kabuk çıkışının çalışan işlemlerinizi öldürmesini önlemekse, nohupoluşturduğu tek çalışan işlemlerde değil, komut dosyasının kendisini kullanmalısınız .

• Açıklandığı gibi burada , nohupsadece SIGHUP almasına ve terminal ile etkileşim süreçlerini engelleyen, ancak kabuk ve çocuk süreçler arasında bir ilişki kesilmez.

• Yukarıdaki noktadan ötürü, olsun ya da olmasın nohup, waitiki fordöngü arasındaki bir basit , ikincisinin forancak ilk tarafından başlatılan tüm alt süreçler forçıktıktan sonra yürütülmesine neden olur .

• Basit bir şekilde wait:

  şu anda aktif olan tüm alt süreçler beklenir ve dönüş durumu sıfırdır.

• İkincisini foryalnızca ilkinde hata yoksa çalıştırmanız gerekiyorsa, her çalışan PID'sini ile kaydetmeniz $!ve tümünü şu adrese iletmeniz gerekir wait:

  pids=
  for ...
      worker ... &
      pids+=" $!"
  done
  wait $pids || { echo "there were errors" >&2; exit 1; }

fgYerleşik kullanın . Arka plan işlemleri bitene kadar bekler.

help fgAyrıntılar için deneyin .

İki fordöngünüzün arasına aşağıdaki kod segmenti gibi bir şey eklerseniz yardımcı olabilir.

flag=0

while [ flag -eq 0 ]
do
  ps -ef | grep "Rscript --vanilla" | grep -v grep > /dev/null
  flag=${?}
  sleep 10
done

Tabii ki, uygulamanızın Rscriptbaşarılı bir şekilde tamamlanma ve etrafta dolaşma şansı varsa, ikinci döngü döngünüzün çalışma şansı olmayabilir. Yukarıdaki kod segmenti, tanımlayıcıya sahip tüm işlemlerin Rscript --vanilladoğru şekilde tamamlanacağını ve kaybolacağını varsayar . Başvurunuzun ne yaptığını ve nasıl çalıştığını bilmeden, bu varsayımlara güvenmek zorundayım.

DÜZENLE

Yorumların ışığında, bu ihtiyaçlarınızı daha iyi karşılayacaktır. (orijinal kodunuzu ve tamamlama kontrol mantığını içerir)

for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
pids[$i]=${!}
done

flag=0

while [ flag -eq 0 ] 
do
  for PID in $(echo ${pids[@]})
  do
    flag=1
    ps -ef | grep ${PID} | grep -v grep >/dev/null; r=${?}
    if [ ${r} -eq 0 ]
    then 
      flag=0
    fi
  done
done

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done