Kantil normalizasyonu nasıl çalışır?


15

Mikrodizilerin kullanıldığı gen ekspresyon çalışmalarında, yoğunluk verilerinin normalleştirilmesi gerekir, böylece şiddetler bireyler arasında, genler arasında karşılaştırılabilir. Kavramsal ve algoritmik olarak, "kantil normalleşme" nasıl çalışır ve bunu istatistikçi olmayan bir kişiye nasıl açıklarsınız?


2
Basit: "eğri üzerinde derecelendirme". :-) Quantdec.com/envstats/notes/class_03/probability.htm adresinde bir algoritma veriyorum ("QQ grafiklerini okuma").
whuber

Bu PDF, basit bir işlenmiş örnekle kantil normalleştirmeyi açıklar: plexdb.org/modules/documentation/RMAexplained.pdf Kağıt daha büyük bir süreci (RMA) açıklıyor, ancak kuantil normalleştirme adımlardan biri olarak gerçekleştiriliyor.
JHubbard80

Yanıtlar:


7

Bolstad ve ark. Tarafından varyans ve sapmaya dayalı yüksek yoğunluklu oligonükleotid dizi verileri için normalleştirme yöntemlerinin karşılaştırılması . dizi verileri için kantil normalizasyonu tanıtır ve diğer yöntemlerle karşılaştırır. Algoritmanın oldukça açık bir açıklaması var.

jF^-1G,^jG,^jF^-1G,^jjF^

Günün sonunda, tüm dizileri ortak bir yoğunluk dağılımına dönüştürmek için bir yöntemdir.

Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.