R sadece HATA alternatifleri [kapalı]

13

Kapalı. Bu soru konu dışı . Şu anda cevapları kabul etmiyor.

Bu soruyu geliştirmek ister misiniz? Sorunuzu güncelleyin o yüzden -konu üzerinde Çapraz doğrulanmış için.

Geçen yıl kapalı .

HATA ve R kullanarak Bayes istatistikleri üzerine bir kurs takip ediyorum. Şimdi, HATA zaten biliyorum, harika ama sadece R yerine ayrı bir program kullanmaktan gerçekten hoşlanmıyorum.

R'de çok sayıda yeni Bayesian paketi olduğunu okudum Bayesian istatistikleri için hangi paketlerin olduğunu ve bunların ne yaptığını gösteren bir liste veya referans var mı? Ayrıca, HATALARIN esnekliği için bir R paketi alternatifi var mı?

r bayesian bugs

— Sacha Epskamp
kaynak

8

Çok güzel vinyetlerle birlikte gelen MCMCglmm paketine bir göz atabilirsiniz . Kol paketinde Andrew Gelman'ın bayesglm()Bayesian genelleştirilmiş doğrusal modellerini takmanın bir işlevi de var . Ayrıca , aynı pakette hiyerarşik modelleme için gelecekteki bir sürümü / işlevleri duydum . blmerbglmer

— chl
kaynak

2

Paket kolunda, R'den böcek çağırmanıza izin veren fucntion hataları var. Yeniden araştırmamda kullandığım şey bu. Gelman'ın blogunda R. tarafından sakinleştirici winbugs örneği var

— Manoel Galdino

9

Bayesian CRAN görev görünümü

— Eduardo Leoni
kaynak

6

Tanıdığım birkaç kişi JAGS kullanıyor . JAGS sözdizimi, HATA'ya benzer.

— csgillespie
kaynak

(+1 ama ben OP bazı saf R çözümü sonra olduğunu düşünüyorum.) Rjags paketi ile harika çalışıyor , ama yine de bizim model harici bir dosyada HATA hata sözdizimi belirtmek gerekir.

— chl

5

İkincisi Bayesli görev görünümü. Sadece çeşitli modeller sunan olgun bir paket olan MCMCpack için bir oy ekleyeceğim . Çoğunlukla oldukça iyi belgelenmiştir.

— JMS
kaynak

0

Performans, insanların MCMglmm gibi paketlere karşı WinBUGS / OpenBUGS / JAGS kullanmasının ana nedenidir. Öyle ~~çok sert~~ bir R komut BÖCEK modellerini çalışmasına izin paketleri, özellikle vardır yerli R. verimli bir Gibbs örnekleyicisi yazmak için pratik değildir RBUGS ve BUGSParallel .

— Jeff Hall
kaynak

1

MCMCglamm"[a] ll simülasyonu seyrek doğrusal sistemler için CSparse kütüphanesi kullanılarak C / C ++ 'da yapılır" (bkz. özet ).

— Bernd Weiss

1

1; bakınız @Bernd. Çoğu olgun paket derlenmiş kod kullanır. Bunun ana nedeni, BUGS ve arkadaşlarının daha fazla modele sığabilmeleri açısından daha esnek olmalarıdır. R paketinin - derlenmiş kodla bile - daha genel olması gerektiğinden, bu daha verimli bir hesaplamaya yol açabilir, ancak olmayabilir.

— JMS

1

MCMCpack, eldeki görev için optimize edilmiş derlenmiş C / C ++ kodu kullanır, bu nedenle JAGS (belirli bir görev için) gibi genelleştirilmiş bir pakette bir şey yapmaktan daha hızlıdır.

— Wayne