Fisher'ın kesin testi hangi dağılımı varsayıyor?


11

Çalışmamda Fisher'ın kesin testinin çeşitli kullanımlarını gördüm ve verilerime ne kadar iyi uyduğunu merak ediyordum. Birkaç kaynağa baktığımda istatistiğin nasıl hesaplanacağını anladım, ancak varsayılan sıfır hipotezinin açık ve resmi bir açıklamasını hiç görmedim.

Birisi beni varsayılan dağıtımın resmi bir açıklamasını açıklayabilir ya da yönlendirebilir mi? Acil durum tablosundaki değerler açısından bir açıklama için minnettar olacaktır.


3
2x2 durumunda hipergeometrik dağılıma dayanır.
Glen_b -Dica Monica

Yanıtlar:


11

İçinde durumunda dağılım varsayım iki bağımsız binom rastgele değişkenler olarak verilmektedir x 1 ~ B i n ( n 1 , θ 1 ) ve X, 2 ~ B i n ( n- 2 , θ 2 ) . Sıfır hipotezi eşitlik θ 1 = θ 2'dir . Ancak Fisher'ın kesin testi koşullu bir testtir: X 1 verilen X 1'in koşullu dağılımına dayanır 12×2X1Bin(n1,θ1)X2Bin(n2,θ2)θ1=θ2X1 . Bu dağılım, bilinmeyen bir parametresi olan hipergeometrik bir dağılımdır: oran oranı ψ = θ 1X1+X2 ve sonra sıfır hipoteziψ=1'dir.ψ=θ11θ1θ21θ2ψ=1

Bu dağıtımın Wikipedia sayfası var .

R ile değerlendirmek için, koşullu olasılığı tanımlayan formülü kullanabilirsiniz:

p1 <- 7/27
p2 <- 14/70
x1 <- 7; n1 <- 27
x2 <- 14; n2 <- 56
# 
m <- x1+x2
dbinom(x1, n1, p1)*dbinom(x2, n2, p2)/sum(dbinom(0:m, n1, p1)*dbinom(m-(0:m), n2, p2))
[1] 0.1818838

Veya paketin dnoncenhypergeomişlevini kullanın MCMCpack:

psi <- p1/(1-p1)/(p2/(1-p2)) # this is the odds ratio
MCMCpack::dnoncenhypergeom(x=x1, n1, n2, x1+x2, psi)
[1] 0.1818838

Teşekkürler @Stephane. Neden hipergeometrik hale geldiğini ve parametrelerin ne olduğunu daha fazla açıklayabilir misiniz?
Amit Lavon

2
Üzgünüz @AmitLavon, bu hipergeometrik dağılım hakkında ayrıntıları bilmiyorum.
Stéphane Laurent

1
@AmitLavon Yanıtımı wikipedia bağlantısını ve R kodunu içerecek şekilde düzenledim.
Stéphane Laurent

10

χ2

  • İlişkilendirme için değerlendirilen iki değişken, ölü / canlı ABD / Avrupa gibi gerçekten çok yönlü ya hep ya hiç. Değişkenlerden biri veya her ikisi de altta yatan bir sürekliliği basitleştiriyorsa, kategorik veri analizi hiç yapılmamalıdır.
  • YXYY=yXxYX2×2uyumluluk tablosu testi, tedavi A'daki her bireyin aynı ölüm olasılığına sahip olduğunu varsayar. [Bunun çok sıkı bir varsayım olduğu iddia edilebilir, ancak bu pozisyon, düzeltilmemiş birliktelik testleri yapmaktan kaynaklanan güç kaybının farkında değildir.

χ2XYYPPχ2 P


Teşekkürler @FrankHarrell. Ki-kare P-değerlerinin Fisher'dan daha doğru olduğu iddianız için referans verebilir misiniz?
Amit Lavon

1
Örneğin citeulike.org/user/harrelfe/tag/fishers-exact-test adresine bakın . Bu, stackexchange üzerinde uzun süre tartışılmıştır.
Frank Harrell

ne yazık ki ctiteulike gitti ve web.archive.org sadece harrelfe hesabının ilk sayfasını taramış gibi görünüyor.
Glen_b-Monica

Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.