Yivli karışık efekt modeli


9

Zaman içindeki eğilimin curvi-doğrusal olduğu bilinen bir uygulamada spline terimi ile karışık efektler modeli kullanıyorum. Bununla birlikte, değerlendirmek istediğim, eğri-doğrusal eğilimin doğrusallıktan bireysel sapma nedeniyle mi meydana geldiği, yoksa grup düzeyinde uyumun eğri-doğrusal görünmesini sağlayan bir etki mi? JM paketinden bir veri kümesini sıkıcı tekrarlanabilir bir örnek veriyorum.

library(nlme)
library(JM)
data(pbc2)

fitLME1 <- lme(log(serBilir) ~ ns(year, 2), random = ~ year | id, data = pbc2)
fitLME2 <- lme(log(serBilir) ~ year, random = ~ ns(year, 2) | id, data = pbc2)

Aslında bunlardan hangisinin verilerime daha iyi uyduğunu bilmek istiyorum. Ancak karşılaştırma anovabana uğursuz bir uyarı veriyor:

        Model df      AIC      BIC    logLik   Test  L.Ratio p-value
fitLME1     1  7 3063.364 3102.364 -1524.682                        
fitLME2     2  9 2882.324 2932.472 -1432.162 1 vs 2 185.0399  <.0001
Warning message:
In anova.lme(fitLME1, fitLME2) :
  fitted objects with different fixed effects. REML comparisons are not meaningful.

Şimdi, bu tür karşılaştırmaları maksimum olabilirlik yöntemleriyle yapmakta zorluklar olduğunun farkındayım - ama alternatif nedir?


2
Method = "ML" ya da doğru kelime öbeği ne olursa olsun yeniden takmayı deneyin ve uyarının gidip gitmediğine bakın.
mdewey

Yanıtlar:


2

Mdewey'in söylediği gibi, modeli REML tahmin yöntemi olmadan yeniden takın. Uyarının dediği gibi, farklı sabit efekt yapılarınız olduğunda karşılaştırmalar anlamlı değildir.

Sonraki sorunlar, modellerin iç içe olmamasıdır, bu nedenle F-testi muhtemelen mantıklı değildir. Bilgi kriterlerine bakabilirsiniz. Her ikisi de lehine fitLME2.

Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.