R - istatistiklerine ait referans kitabı var mı ve ne içermelidir?

Arka fon

Bununla ilgili çok fazla tartışma var, bu yüzden cevabımı StackExchange'in önceki ihalelerinden ve öfkeyle googling yaparak bulabileceğimi düşündüm. R ile (biyo) istatistikler için sadece bir referans kitabı bulmaya çalışırken yarım gün kullandıktan sonra, kafam tamamen karıştı ve pes etmek zorunda kaldım. Belki bir araya getirilen ücretsiz materyal aslında şu anda satın alabileceğiniz kitaplardan daha iyidir. Bunu öğrenelim.

İnternet, R dili için iyi bir edebiyatla doludur , bu yüzden çoğu zaman bir ofis dekorasyonu olarak kullanılan, vasat bir kitap için para ödemenin hiçbir anlamı yoktur. R ana sitesi, R ile ilgili kitapları listeler ve birçoğu vardır. Daha kesin olmak gerekirse: 115. Sadece bir tanesine “ bağımsız istatistik referans kitabı ” yazıyor . Şimdi 8 yaşında ve modası geçmiş olabilir. S ile Modern Uygulamalı İstatistik'in dördüncü baskısı daha da eskidir. R Kitap , genellikle referansların yetersizliği, kötü biçimlendirilmiş kod ve özensiz sonuçtan dolayı çok temel olarak çiğnenmektedir ve önerilmemektedir .

Ancak, pratik istatistiklere (her şeyden önce) R (ikincil) için bağımsız bir referans olarak kullanabileceğim bir kitap arıyorum . Kitap ofis masamda, rafta toz yerine ek açıklamalar, kahve lekeleri ve yağlı parmak izleri toplayarak yaşamalıdır. Şimdiye kadar kullandığım ücretsiz pdf koleksiyonunun yerini almalı, R'nin mükemmel bir referans kütüphanesiyle geldiğini unutmamak gerekir. “ Doğru yaklaşım nedir? ”,“ Neden? “ve“ teknik olarak nasıl çalışır? ”genellikle“ R ile nasıl yapılır? ” dan daha fazla soru soruyor.

Ekolojist olduğum için çoğunlukla biyoistatistiğin uygulamaları ile ilgileniyorum. Ancak, bu şeyler genellikle birbirine bağlı olduğu için, disiplinlerarası bir genel referans benim için en değerli şey olacaktır.

Görev

Eğer böyle bir kitap varsa (bundan şüpheliyim), lütfen kitabın adını (cevap başına sadece bir tane) ve kitabın konu için neden referans kitabı olarak adlandırılması gerektiğini açıklayan kısa bir inceleme yapın. Bu soru mevcut olanlardan çok farklı olmadığından, lütfen cevabınız için bu adımı kullanın . Ayrıca kitabın kusurlarını da listeleyebilirsiniz, böylece bunları ideal referans kitabının özellikleri olarak listeleyebiliriz.

Sorum şu ki, R içeren istatistiklerin (en çok kullanılan türde) referans kitaplarının neler içermesi gerekir?

Bazı ilk düşünceler genel özellikleri takip ediyor (lütfen güncelleyin):

• Tuğla gibi kalın
• Özlü, ancak anlaşılabilir
• Rakamlarla doldurulmuş (verilen R kodu ile)
• Metinden en önemli detayları tanımlayan tablo ve çizimleri anlamak kolay
• Anlaması kolay, en önemli denklemleri içeren istatistikler / yöntemler hakkında açıklayıcı metin.
• Her yaklaşım için iyi örnekler (R kodu ile)
• Geniş ve güncel referans listesi
• Minimum yazım hatası sayısı

İçindekiler

Bir istatistikçi olmadığımdan ve soruyu cevaplamak için bu (mevcut değil mi?) Kitabına ihtiyaç duyduğum için içerikler hakkında yazmak benim için zor. Çünkü Türkiye'deki AR Kitap açıkça R ile istatistikler için başvuru kitabı olma niyetinde, ama çoğu zaman eleştiriliyor, ben bağımsız R istatistik referans kitap için içindekiler için bir başlangıç noktası olarak kitaptan içindekiler tablosunu kopyaladı. Ek görev: lütfen içindekiler için ilaveler, öneriler, silme, vb.

1. Başlamak
2. R Dilinin Temelleri
3. Veri girişi
4. Dataframes
5. Grafik
6. Tablolar
7. Matematik
8. Klasik Testler
9. İstatistiksel Modelleme
10. gerileme
11. Varyans Analizi
12. Kovaryans Analizi
13. Genelleştirilmiş Doğrusal Modeller
14. Veri say
15. Tablolardaki Verileri Say
16. Oran Verileri
17. İkili Tepki Değişkenleri
18. Genelleştirilmiş Katkı Modelleri
19. Karışık Etki Modelleri
20. Doğrusal Olmayan Regresyon
21. Ağaç modelleri
22. Zaman serisi analizi
23. Çok Değişkenli İstatistik
24. Mekansal İstatistik
25. Hayatta Kalma Analizi
26. Simülasyon Modelleri
27. Grafik Görünümünü Değiştirme
28. Kaynaklar ve Daha Fazla Okuma
29. indeks

Daha önce ne söylendi?

StackExhange, istatistik ve R kitap önerileri isteyen birkaç basamak içerir. R dilini öğrenmek için kitaplar, istatistik yönü olmadan bir referans kitap olan R dilini öğrenmekten bahseder. R Programlama Sanatı en iyi öneri olarak sıralanır. R kullanarak İstatistikleri Öğrenmek İçin Kitap, referans kitabıyla gerçekten aynı olmayan istatistiklerle ilgili ideal bir giriş kitabıdır. Açık Kaynak istatistiksel ders kitapları yer alıyor R ile çok değişkenli istatistik iyi bir alternatif olarak. İstatistikçi olmayan bilim adamları için hangi kitabı önerirsiniz? Seçim programını belirtmeden en iyi istatistik referans kitabı hakkında sorular sorar.R skorundaki deneysel tasarım verilerinin simülasyonuna dair referans veya kitap, belki de soruma en yakın olanı Bilimsel Programlama ve Simülasyona Giriş R kullanımı burada en çok tavsiye edilen kitaptır ve aradığım şeye yakın olabilir. Ancak, bu kitap ya R ile olan istatistiklere tek bir referans kitabı olarak yetmez.

Referans kitabı için bazı öneriler ve kusurları

Action in R, The R Book'tan daha iyi yorumlar aldı, ancak görünüşe göre tanıtım niteliğinde .

Biyoistatistik tasarım ve R kullanarak analiz: pratik bir rehber belki aradığım şeye yakındır. İyi bir inceleme aldı , ama görünüşe göre bu da birçok yazım hatası içeriyor. Ek olarak, bu kitap istatistiklerin açıklanması üzerine yoğunlaşmıyor, araştırmacıların kullanması için hazır yemek tarifleri olarak istatistiksel analizler veriyor.

R'deki Ekolojik Modeller ve Veriler tanıtım seviyesini atlar. Bu "giriş" kelimesini görmek , R kitap listesindeki 43 tekrarlamayı , ancak istatistiklerin referans kitabının peşindeyseniz belki de tam olarak tatmin edici olmadığını gösteren çok kullanışlı bir özellik …?

Bilimsel Programlama ve Simülasyona Giriş R kullanımı çok olumlu bir inceleme aldı , ancak veri simülasyonuyla sınırlı.

Richiemorrisroe düşündürmektedir S ile Modern Uygulamalı İstatistik mükemmel değerlendirmeleri (aldı R. Bu kitap ile bağımsız bir istatistik referans kitap için yeterlidir 1 , 2 ) ve muhtemelen şu anda başlık için en iyi aday? En son sürüm 10 yıl önce ortaya çıkmış ve bu program geliştirme sürecini uzun zamandır düşünmektedir.

Dimitriy V. Masterov, Regresyon ve Çok Düzeyli / Hiyerarşik Modeller Kullanarak Veri Analizi önermektedir . Bu kitabı henüz kontrol etmedim.

Çok sayıda kitap incelemesi okuduktan sonra, burada sorulan mükemmel kitabın henüz olmadığı anlaşılıyor. Ancak, oldukça yakın olanı seçmek mümkündür. Bu adım, istatistik kullanıcılarının varolan en iyi referans kitabını bulmaları için bir topluluk wiki'si ve yeni ve eski kitap yazarlarının çalışmalarını iyileştirmeleri için bir motivasyon olarak tasarlanmıştır.

Şahsen, S-Plus ile Modern Uygulamalı İstatistik'in ana hatlarıyla belirttiğiniz tüm kutuları işaretlediğini düşündüm. Her örnek R koduna sahiptir, diğer kaynaklara iyi referanslar verir ve Venables ve Ripley gerçekten takdir ettiğim harika ve açıklayıcı ve açıklayıcı bir yazı stiline sahiptir. Kitabı çok sık okudum ve her seferinde ondan daha fazla okudum. Elbette, kilometreniz değişebilir.

Böyle güzel bir soru için teşekkür eder ve özellikle bu bilgileri derler. Maalesef, tarif ettiğiniz kitap mevcut değil ve dürüst olmak gerekirse, muhtemelen mevcut olamazdı. Öncelikle istediğin istatistik için bir referans kitapsa, doğrusal modeller hakkında gerçekten iyi bir kitapla başlardım. Benim tavsiyem Kutner ve ark.hem hacim hem de kütlede tuğladan daha büyük olma kriterlerini karşılar, çok kapsamlı, açık ve pek çok örnekle. Aslında, R gereksinimini ortadan kaldırırsanız, listenizin hemen hemen tamamını tıklar. Sık sık geri dönüyorum. Ancak, ~ 1500 sayfalarda, sadece doğrusal modelleri kapsar - yani, regresyon ve ANOVA - birkaç başka konuda bazı kısa bölümler vardır, ancak bunun için gerçekten başka kitaplar isteyeceksiniz. Daha sonra, çalışmanız gerekebilecek diğer teknikler için (örneğin, hayatta kalma analizi, mekansal analiz vb.), Sizin için uygun düzeyde birinci sınıf bir istatistik referans kitabı alacağım. Bu kitaplar, örnekleri için R'yi kullanmazlarsa, R-kullanımından gibi, R'ye özgü bir kitap almak isteyebilirsiniz! Kitaplar, ancak belgeler arasında, vinyetlerin, R-help posta listelerinin, StackOverflow ve CV'ye ihtiyacınız olmayabilir. Doğru şekilde R programlamayı öğrenmek istiyorsanız, o kitaplardan birini de edinmelisiniz. Bu noktada en az 4 kitabınız var. Üzgünüm, ama bu böyle. İstatistiklerle yoğun olarak çalışan hiç kimsenin her şeyi kapsayan tek bir kitabı yoktur.

Böyle bir kitabın olduğunu sanmıyorum. Bence en yakınımda olan kitap Gelman ve Hill'in Regresyon ve Çok Düzeyli / Hiyerarşik Modeller Kullanarak Veri Analizi .

Eksileri:

• ~ 5 yaşında ve sosyal bilimcileri hedefliyor.

• İçindekiler listenizde her şey bulunmuyor (mekansal değil, temelde zaman serilerinde yok)

Artıları:

• İyi yazılmış

• Bağlantıda bir hata listesi ve bir TOC var.

• Numaralandırılmış listenizde olmayan, eksik veriler gibi önemli şeyleri kapsar.

• Madde imli listenizdeki çoğu maddeye isabet ediyor.

• Çok sayıda grafik ve R kodu (çoklu seviye için bazı Bugs kodu).

• Tüm veri / kod indirmek için kullanılabilir.

İstatistiki Öğrenmenin Elemanları ile çalışıyorum . Bu kitap inanılmaz bir teknik yelpazesini kapsar (yani 700'den fazla sayfa) ancak her bir yaklaşım son derece teorik bir şekilde değil, çok pratik bir şekilde açıklanmaktadır. Açıkça R ile ilgili hiçbir şey içermez, ancak grafikler ve grafiklerin tümü R ile açıkça yapılmıştır ve CRAN'da tartışılan tüm konular için paketler vardır. Yazarların tümü, R'nin (aynı zamanda modern makine öğrenme tekniklerinin adil bir parçası) geliştirilmesine dahil olmuştur.

Şu anda en yüksek oy alan cevabın MASS4'ün talebe oldukça iyi uyduğunu ve oldukça yüksek düzeyde istatistiksel bir sofistike olma ihtiyacını karşılamakta zorluk çeken başka bir katılımcı ile aynı deneyime sahip olduğunu kabul ettim. MASS3 aslında ilk "Rbook'umdu" ve bu kapasitede oldukça iyi hizmet etti. Crawley’nin “The R Book” ’unu satın aldım ve hem R dilinin yanlış bir tanımı hem de istatistiksel teorinin derinliği eksik gibi görünen bir dizi çalışılmış örnekden biraz daha az olması için tatmin edici buldum.

Bununla birlikte, zamanın geçişi ile Harrell'in "Regresyon Modelleme Stratejileri" ni (RMS) bu sorunun "biyoistatistik" odağı için iyi bir derinlikte bulmaya daha uygun buldum. Bu, R üzerine bir tanıtım metni değildir. Bunun için başka bir yere bakması gerekir ve bunun için R'yi Kullanarak Bilimsel Programlama ve Simülasyona Giriş'i tavsiye ederim [ http://www.crcpress.com/product/isbn/9781420068726] veya (rağmen) adı) "Dummy'ler için R", uzun süredir StackOverflow'un R ilanı etiketlerine katkıda bulunan kişiler tarafından yazılmıştır. RMS’nin ilk baskısında yalnızca S’ye daha çok odaklandığında var, ancak o zamandan beri Harrell R’e geçti verms/HmiscR paketi ikilisi. Mekansal analizler veya karışık modeller olmasa da, @ gung'un listelenen alanların bazılarında uzmanlık kapsamı için önerisini sağladığına inanıyorum.

Eğer çevirmek istersen ... (4.900 sayfalık teorik kitabın eşlik eden kitabı):

Büyük r kitap

(Ben ortak yazar olduğum) bu kitap, lisans ve lisansüstü seviyedeki 15 yıllık danışmanlık deneyim ve öğretimin bir derlemesidir ve sadece 4.900 sayfamda matematiğin ayrıntıları (deliller) verilen R öğelerinin örneklerini gösterir. hesaplamaların da elle yapıldığı, eşlik eden, sayısal değerlere sahip kitaplar (sonraki sürümde sunulacak olan +500 sayfa). Bu kitap aynı zamanda, yazılımın doğru değerleri verdiğini kontrol etme imkanı sunar ve Avrupa'daki yüksek lisans derslerinde normalde okutulan dersler hakkında elle veya MS Excel'de hesaplama yapmaktan çok daha eğlencelidir. Bu kitabın amacı aynı sonucu elde etmek için pek çok yerine 1 yazılımı kullanabildiğinizi göstermektir (birlikte JMP + Minitab + SPSS + SAS + MATLAB kullanmak yerine). Bu kitap aynı zamanda R'nin zayıf yönlerini de gösterir (paket bakımı garanti edilmez). Aynı zamanda çeşitli R forumlarında ve bloglarında çok değerli soruların bir özetidir. Ücretsiz ve renkli!