Benjamini-Hochberg bağımlılık varsayımları haklı mı?

Yaklaşık 50 farklı değişkene göre üç popülasyon arasındaki önemli farklılıkları test ettiğim bir veri setim var. Bunu bir yandan Kruskal-Wallis testlerini, diğer yandan da iç içe geçmiş GLM model uyumlarının (bağımsız değişken olarak popülasyonlu ve popülasyonsuz) uyum oran testlerini kullanarak yapıyorum.

Sonuç olarak, bir yandan Kruskal-Wallis -değerlerinin bir listesi var ve diğer taraftan LRT karşılaştırmalarından Chi kare -değerleri olduğunu düşünüyorum .$p$$p$

Birden fazla test düzeltmesi yapmam gerekiyor çünkü 50'den fazla farklı test var ve Benjamini-Hochberg FDR en mantıklı seçim gibi görünüyor.

Bununla birlikte, değişkenler muhtemelen bağımsız değildir ve bunların birkaç "klanı" birbiriyle ilişkilidir. O zaman soru şu: değerlerim için temel istatistik kümesinin Benjamini-Hochberg prosedürünün hala FDR'ye bağlı olması için gerekli olan pozitif bağımlılık gereksinimlerini karşılayıp karşılamadığını nasıl anlayabilirim ?$p$

2001'den Benjamini-Hochberg-Yekutieli makalesinde, PRDS koşulunun çok değişkenli normal ve öğrenci dağılımı için geçerli olduğu belirtilmektedir. Model karşılaştırması için olasılık oran testim Ki kare değerleri ne olacak? Kruskal-Wallis testleri için sahip olduğum -değerleri ne olacak ?$p$

Bağımlılık hakkında hiçbir şey varsaymayan Benjamini-Hochberg-Yekutieli en kötü durum FDR düzeltmesini kullanabilirim, ancak bu durumda çok muhafazakar olabileceğini ve bazı ilgili sinyalleri kaçırabileceğini düşünüyorum.

BH prosedürünün geçerliliği hipotez testlerinin pozitif bağımlı olduğuna bağlıdır. 2001 makalelerini okursanız, çok değişkenli normal olmanın gerekli olmadığını görürsünüz, gazetede zayıf koşullar verdiler:

Rosenbaum'un (1984) koşullu (pozitif) birliği, PRDS'yi ima etmek için yeterlidir: $X$ herhangi bir bölüm için koşullu olarak ilişkilendirilir $(X1,$ $X2)$ nın-nin $X$ve herhangi bir işlev $h(X1), X2$ verilmiş $h(X1)$ pozitif ilişkilidir.

Bunlar verileriniz hakkında makul bir varsayım gibi görünüyorsa, bunu bir varsayım olarak ilan edin ve kendinize açıklığa kavuşturmak için karşılandığı ve karşılanmadığı senaryolar bulmaya çalışın.

PRDS, BH'nin FDR'yi kontrol etmesi için yeterli fakat gerekli olmayan bir durumdur. Bunu kullanmanızı ve ayrıca genel bağımlılık için Benjamini-Yekutieli prosedürünü kullanmanızı öneririm. Çıkarımdaki fark büyükse BH'nin bağımlılık yapınızı koruyan permütasyonlar veya yeniden örnekleme temelleri kullanarak belirli kurulumunuzda FDR'yi kontrol ettiğini göstermeyi deneyin.