Olabilirlik oranı testi - lmer R - İç içe olmayan modeller


14

Şu anda bazı çalışmaları gözden geçiriyorum ve aşağıdakilerle karşılaştım, ki bu benim için yanlış görünüyor. Lmer kullanılarak iki karışık model (R olarak) takılmıştır. Modeller iç içe değildir ve olasılık oranı testleri ile karşılaştırılır. Kısacası, burada sahip olduğum şeyin tekrarlanabilir bir örneği:

set.seed(105)
Resp = rnorm(100)
A = factor(rep(1:5,each=20))
B = factor(rep(1:2,times=50))
C = rep(1:4, times=25)
m1 = lmer(Resp ~ A + (1|C), REML = TRUE)
m2 = lmer(Resp ~ B + (1|C), REML = TRUE)
anova(m1,m2)

Gördüğüm kadarıyla lmer, günlük olasılığını hesaplamak için kullanılır ve anovaifade, normal serbestlik derecelerine sahip bir ki-kare kullanan modeller arasındaki farkı test eder. Bu benim için doğru görünmüyor. Eğer doğruysa, bunu haklı çıkaran herhangi bir referans var mı? Benzetimlere dayanan yöntemlerin (Paper by Lewis ve ark., 2011) ve Vuong (1989) tarafından geliştirilen yaklaşımın farkındayım ama burada üretilen şeyin bu olduğunu düşünmüyorum. anovaİfadenin kullanımının doğru olduğunu düşünmüyorum .

Yanıtlar:


8

Bu iki şekilde doğru değildir :

  1. (Sıradan) olabilirlik oranı testi sadece iç içe modelleri karşılaştırmak için kullanılabilir;
  2. Ortalama modelleri REML altında karşılaştıramayız. (Bu durum böyle değil, aşağıdaki @ KarlOveHufthammer'ın yorumlarına bakın.)

ML kullanılması durumunda, iç içe olmayan modelleri karşılaştırmak için AIC veya BIC kullanmanın farkındayım.


9
Nokta 2 ile ilgili olarak, anova()R fonksiyonu yok olup REML altına yerleştirilmiş iki model karşılaştırın; ML kullanarak tekrar takılır ve sonra testi gerçekleştirir. Bkz . lme4:::anova.merModSatırı içeren mods <- lapply(mods, refitML). (Ama hala haklısınız, anova()iç içe olmadıkları için iki modeli karşılaştırmak için kullanılamazlar.)
Karl Ove Hufthammer

2
Ayrıca iç içe üzerinde bazı anlaşmazlıklar olduğunu unutmayın: Brian Ripley yuvalama AIC karşılaştırma için büyük önem taşıdığını söylüyor iken, (. bkz tartışmaya bağlı belgenin 20) Anderson ve Burnham .. katılmıyorum (bkz 2.)
Ben Bolker

2
@BenBolker Tüm normalleştirici sabitleri ve patolojik olmayan modelleri düşündüğünüz sürece AIC'nin iç içe olmayan modellerle kullanımı için başka bir referans (ayrıca buna ve buna bakın ). Bununla birlikte, LMM bağlamında , AIC'nin bazı değişikliklerini kullanmanız gerekir .
LessFaceMoreBook

2
Bağlantı karıştı : bence stats.ox.ac.uk/~ripley/ModelChoice.pdf çalışmalıdır.
Ben Bolker

2
@BenBolker Brian Ripley oldukça fikirli. Ancak, iç içe olmayan modeller için AIC kullanımına karşı yıkıcı bir argüman sunmadı :). Bağlantınızı tekrarladığınız için üzgünüm.
LessFaceMoreBook
Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.