Türü ne olursa olsun, tüm çikolatalar doğrudan güneş ışığından uzak serin ve düşük nemli (kuru) bir yerde saklanmalıdır. Hava geçirmez bir kapta mühürlemek en iyisidir, çünkü ElendiTheTall'un dediği gibi, içindeki kakao yağı lezzetleri emecektir.
Bitter çikolata yıllarca sürecek. Süt ve beyaz çikolata, süt içeriği nedeniyle çok daha kısa bir süre (birkaç ay) sürecektir.
Yanlış saklanan çikolata, yüzeyde beyaz veya gri bir çizgi veya lekelenme gösteren çiçek açar. Lekelenme veya çizme, kakao yağı yağını ayırmaktır ve çikolatanın öfkesinin kaybolduğunun bir işaretidir. Bu tür çikolatalar, çikolatanın tamamen eritileceği herhangi bir uygulama için uygundur (en çok pişirme). Tohumlama yöntemi ile temperleme için baz (tohumsuz) çikolata olarak bile kullanılabilir, ancak diğer şekerleme için kullanılmamalıdır.