SAS ve R'de ANOVA'daki Tip III toplam karelerin çelişkili sonuçları


15

Hem SASve ile dengesiz bir faktöriyel denemenin verilerini analiz ediyorum R. Hem SASve Rkareler benzer Tip I toplamını sağlar, ancak kareler onların Tip III toplamı birbirinden farklıdır. Aşağıda SASve Rkodlar ve çıkışları.

DATA ASD;
INPUT Y T B;
DATALINES;
 20 1 1
 25 1 2
 26 1 2
 22 1 3
 25 1 3
 25 1 3
 26 2 1
 27 2 1
 22 2 2
 31 2 3
;

PROC GLM DATA=ASD;
CLASS T B;
MODEL Y=T|B;
RUN;

SAS'tan Tip I SS

Source  DF       Type I SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     17.06666667     17.06666667       9.75    0.0354
B       2     12.98000000      6.49000000       3.71    0.1227
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

SAS'tan Tip III SS

Source  DF     Type III SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     23.07692308     23.07692308      13.19    0.0221
B       2     31.05333333     15.52666667       8.87    0.0338
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

R Kodu

Y <- c(20, 25, 26, 22, 25, 25, 26, 27, 22, 31)
T <- factor(x=rep(c(1, 2), times=c(6, 4)))
B <- factor(x=rep(c(1, 2, 3, 1, 2, 3), times=c(1, 2, 3, 2, 1, 1)))
Data <- data.frame(Y, T, B)
Data.lm <- lm(Y~T*B, data = Data)
anova(Data.lm)
drop1(Data.lm,~.,test="F") 

R'den Tip I SS

Analysis of Variance Table

Response: Y
          Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
T          1 17.067  17.067  9.7524 0.03543 *
B          2 12.980   6.490  3.7086 0.12275  
T:B        2 47.853  23.927 13.6724 0.01629 *
Residuals  4  7.000   1.750                  
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

R'den Tip III SS

Single term deletions

Model:
Y ~ T * B
       Df Sum of Sq    RSS     AIC F value  Pr(>F)  
<none>               7.000  8.4333                  
T       1    28.167 35.167 22.5751 16.0952 0.01597 *
B       2    20.333 27.333 18.0552  5.8095 0.06559 .
T:B     2    47.853 54.853 25.0208 13.6724 0.01629 *
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Burada bir şey mi eksik? Hangisi doğru değilse Tip III SS?


John Fox'un cevabını buradan görebilirsiniz: tolstoy.newcastle.edu.au/R/help/05/11/16368.html
Aaron Stack Overflow'dan

Yanıtlar:


29

Tip III SS kullanılan parametrelendirmeye bağlıdır. Eğer ayarlarsam

  options(contrasts=c("contr.sum","contr.poly"))

çalıştırmadan önce lm()ve drop1()SAS ile tam olarak aynı tip III SS'yi alıyorum. Bu konudaki R-topluluğu dogması için , doğrusal modellerde Venables Exeges'lerini okumalısınız .

Ayrıca bakınız: R'de Kontrast kodlarla Tip III SS ANOVA nasıl yapılır?


1
@Peter Bir yoruma sığabileceğini düşünüyorsanız neden olmasın. Ben öyle düşünmüyorum, neden yeni bir soru sormuyorsun?
chl

1
@chl Benim temel noktası ana etkileri olduğunu do diğer değişken 0. Genellikle bu anlamlı olduğunda onlar etkisi vardır - etkileşimlerin varlığında anlam var. Bütün bir iş parçacığına değdiğinden emin değilim.
Peter Flom - Monica'yı eski durumuna döndürün

3
Ben ana etkileri durumlar olduğunu kabul edebilir Venables çok güçlü bir çizgidedir - - yorumlanabilir ancak zor olan çok sayıda durum vardır. Bence "ne yaptığınızı bilmiyorsanız bunu yapmayın" makul bir varsayılan ayardır ...
Ben Bolker

1
Aşağıdakiler kontrastları R standardına sıfırlayacak mı? options(contrasts=c("contr.treatment", "contr.poly"))
Rasmus Larsen

1
evet ...........
Ben Bolker
Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.