Ne demek istediğinizi "farklı" olarak belirtmeniz gerekecektir. Ayrıca, her zaman serisinde seri korelasyon yapısı hakkında hangi varsayımları yapmak istediğinizi belirtmeniz gerekir.
T-testleri ile, her bir grubun ortalamasını karşılaştırıyorsunuz ve grupların eşit varyanslarla bağımsız gözlemlerden oluştuğunu varsayıyorsunuz (ikincisi bazen rahatlar). Zaman serilerini test ederken, bağımsızlık varsayımı genellikle makul değildir, ancak daha sonra bunu belirli bir korelasyon yapısı ile değiştirmeniz gerekir - örneğin, zaman serisinin eşit otokorelasyonlu AR (1) süreçlerini takip ettiğini varsayabilirsiniz. Sonuç olarak, iki veya daha fazla zaman serisinin ortalamalarını karşılaştırmak bile bağımsız verilerden çok daha zordur.
Her bir zaman serisi hakkında hangi varsayımları yapmak istediğimi ve karşılaştırmak istediklerimi dikkatlice belirtirim ve sonra testi gerçekleştirmek için bir parametrik bootstrap (varsayılan modele göre) kullanırım.