R'de sıfır şişirilmiş negatif binom karışık etkiler modeli

17

R'de sıfır şişirilmiş negatif binom karışık etkiler model tahmini sağlayan böyle bir paket var mı?

Bununla demek istediğim:

Pscl paketindeki zeroinfl işlevinde olduğu gibi sıfır enflasyon için binom modelini belirtebileceğiniz sıfır enflasyon:
```
zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "negbin")
```
burada Z sıfır enflasyon modelinin formülüdür;
Modelin sayım kısmı için negatif binom dağılımı;
Lme4 paketinin işlev lmer'ına benzer şekilde rastgele etkiler belirtildi.

Anladığım kadarıyla glmmADMB, sıfır enflasyon formülünün belirtilememesi dışında her şeyi yapabilir (sadece bir engeldir, yani Z sadece 1'dir). Ama her şeyi yapabilen başka paketler var mı?

Yardımınız için çok minnettar olacağım!

— Nikita Samoylov
kaynak

Aynı şeyi arıyorum. Bence glmmADMB istediğim şey, ama çalıştıramıyorum.

— gregmacfarlane

ZIM veya aod paketlerinin yapmak istediğiniz şeyi yapıp yapamayacağını merak ediyorum ?

— Graeme Walsh

2

Bir güncelleme olarak, Ben Bolker'in glmmTMB paketi sıfır şişirilmiş genelleştirilmiş doğrusal karışık modeli (ZIGLMM) desteklemektedir.

— JWilliman

5

Sanırım ihtiyacınız olan paket bu: glmmADMB. Buradan indirdim : http://otter-rsch.com/admbre/examples/glmmadmb/glmmADMB.html

Ama yine de çalıştırmak için bazı problemlerim vardı, bu yüzden bu linkte verilen talimatları takip ettim ve şimdi iyi çalışıyor http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/

Bu yardımcı olur umarım!

— RocioC
kaynak

Bu paketin yalnızca modelin sıfır şişirilmiş kısmı için sabit bir terimin uygulanmasına izin verdiğini unutmayın.

— user2390246

1

PSCL paketi sıfır şişirilmiş Poisson model sağlar. Negatif bir binom modeli yapabileceğini sanmıyorum, ama başlamak için bir yer olabilir. Bağlantılı JSS makalesi, sizi aradığınız şeye yönlendirebilecek ilgili paketleri de tartışır.

— Charlie
kaynak

1

Pscl paketi (şimdi) kullanarak negatif binom modellerine izin veriyorzeroinfl(..., dist = "negbin", ...)

— user2390246

0

Ne yapmaya çalıştığınıza bağlı olarak, aster paketine bakmak isteyebilirsiniz . Aster modelleri, farklı olasılık dağılımlarına sahip olan ve son zamanlarda rastgele etkilere izin verecek şekilde güncellenen çoklu değişkenlerin ortak analizine izin verir . Yaşam öyküsü analizi için tasarlanmışlardır ve yanıtınızı farklı dağılımlara sahip farklı parçalara ayırabileceğiniz durumlarda çalışacaktır (örneğin hayatta kalma = Bernoulli, üreme = Poisson). Sıfırların çoğunu bernoulli ve yanıtın geri kalan kısmını negatif binom olarak modelleyerek "sıfır enflasyon" ile başa çıkabilirler.

Burada çok sayıda belge bulacaksınız:

http://www.stat.umn.edu/geyer/aster/

— JohnSG
kaynak