R'de sıfır şişirilmiş negatif binom karışık etkiler modeli


17

R'de sıfır şişirilmiş negatif binom karışık etkiler model tahmini sağlayan böyle bir paket var mı?

Bununla demek istediğim:

  • Pscl paketindeki zeroinfl işlevinde olduğu gibi sıfır enflasyon için binom modelini belirtebileceğiniz sıfır enflasyon:

    zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "negbin")
    burada Z sıfır enflasyon modelinin formülüdür;

  • Modelin sayım kısmı için negatif binom dağılımı;

  • Lme4 paketinin işlev lmer'ına benzer şekilde rastgele etkiler belirtildi.

Anladığım kadarıyla glmmADMB, sıfır enflasyon formülünün belirtilememesi dışında her şeyi yapabilir (sadece bir engeldir, yani Z sadece 1'dir). Ama her şeyi yapabilen başka paketler var mı?

Yardımınız için çok minnettar olacağım!


Aynı şeyi arıyorum. Bence glmmADMB istediğim şey, ama çalıştıramıyorum.
gregmacfarlane

ZIM veya aod paketlerinin yapmak istediğiniz şeyi yapıp yapamayacağını merak ediyorum ?
Graeme Walsh

2
Bir güncelleme olarak, Ben Bolker'in glmmTMB paketi sıfır şişirilmiş genelleştirilmiş doğrusal karışık modeli (ZIGLMM) desteklemektedir.
JWilliman

Yanıtlar:


5

Sanırım ihtiyacınız olan paket bu: glmmADMB. Buradan indirdim : http://otter-rsch.com/admbre/examples/glmmadmb/glmmADMB.html

Ama yine de çalıştırmak için bazı problemlerim vardı, bu yüzden bu linkte verilen talimatları takip ettim ve şimdi iyi çalışıyor http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/

Bu yardımcı olur umarım!


Bu paketin yalnızca modelin sıfır şişirilmiş kısmı için sabit bir terimin uygulanmasına izin verdiğini unutmayın.
user2390246

1

PSCL paketi sıfır şişirilmiş Poisson model sağlar. Negatif bir binom modeli yapabileceğini sanmıyorum, ama başlamak için bir yer olabilir. Bağlantılı JSS makalesi, sizi aradığınız şeye yönlendirebilecek ilgili paketleri de tartışır.


1
Pscl paketi (şimdi) kullanarak negatif binom modellerine izin veriyorzeroinfl(..., dist = "negbin", ...)
user2390246

0

Ne yapmaya çalıştığınıza bağlı olarak, aster paketine bakmak isteyebilirsiniz . Aster modelleri, farklı olasılık dağılımlarına sahip olan ve son zamanlarda rastgele etkilere izin verecek şekilde güncellenen çoklu değişkenlerin ortak analizine izin verir . Yaşam öyküsü analizi için tasarlanmışlardır ve yanıtınızı farklı dağılımlara sahip farklı parçalara ayırabileceğiniz durumlarda çalışacaktır (örneğin hayatta kalma = Bernoulli, üreme = Poisson). Sıfırların çoğunu bernoulli ve yanıtın geri kalan kısmını negatif binom olarak modelleyerek "sıfır enflasyon" ile başa çıkabilirler.

Burada çok sayıda belge bulacaksınız:

http://www.stat.umn.edu/geyer/aster/

Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.