«hpc» etiketlenmiş sorular

Hesaplamalı bilim doktora programımda neredeyse sadece C ++ ve Fortran'da çalışıyoruz. Bazı profesörler birbirlerini tercih ediyor gibi görünüyor. Hangisinin 'daha iyi' olduğunu ya da belirli bir durumda birinin diğerinden daha iyi olup olmadığını merak ediyorum.

56 hpc  fortran  c++  languages 

Sektörün, çekirdeklerin işlenmesinde katlanarak artmaya yöneldiği ilk 500 anketinden açıkça anlaşılıyor . En büyük süper bilgisayarlar, düğümler arası iletişim için MPI kullanır, ancak düğümler arası paralellik için net bir eğilim olmadığı görülmekle birlikte, her bir çekirdeğe tek bir MPI işlemini eşleştirmenin en basit (ancak en verimli olanı değil) yaklaşımı ile …

36 exascale  programming-paradigms  hpc 

vector<vector<double>>Yüksek performanslı bilimsel bilgi işlem kodu için bir matris sınıfı oluşturmak için (std kullanarak) kullanmak iyi bir fikir midir? Cevabınız hayır ise. Niye ya? Teşekkürler

36 hpc  c++ 

CUDA ve OpenCL, 2013 sonu itibariyle birbirleriyle nasıl bir programcının bakış açısından karşılaştırılır? Grubum GPU hesaplamayı kullanmaya çalışmayı düşünüyor. Yalnızca OpenCL'i destekleyen, ancak CUDA'yı destekleyen bir donanım seçerek kendimizi önemli ölçüde sınırlıyor muyuz? Daha spesifik olmak gerekirse, aşağıdaki varsayımlar doğru mu? CUDA'da mümkün olan her şey OpenCL'de de mümkündür Kütüphaneleri …

34 hpc  gpu  cuda  opencl 

Hakkında bir Amazon EC2 hesaplama küme maliyetleri $ 800- $ 1000 3 yıl boyunca fiziksel işlemci çekirdek başına (görev döngüsüne bağlı olarak). Son donanım edinme turumuzda laboratuvarım, Amazon'un kümelerine benzeyen 48 çekirdekli donanım çekirdeğini yaklaşık 300 dolarlık bir çekirdek için aldı. Burada bir şey mi eksik? Moleküler dinamik simülasyonları gibi …

23 cloud-computing  hpc 

OpenCL programlama paradigması, heterojen bilişim için telif ücretsiz bir standart açar. OpenCL'i temel alan yazılımlar geliştirmek için zamanımızı harcayalım mı? Artılar ve eksiler?

22 hpc  programming-paradigms 

Laboratuvarımızdaki kişisel tecrübemle başlayacağım. 9. ve 10. günlerde ifortta -O3 ve işlemciye özgü bayraklarla (örneğin -xW -xSSE4.2) derlenen optimizasyonlarda oldukça agresif davranırdık. Fakat ifort 11 ile başlayarak, şunu fark etmeye başladık: 1. sonuçlardaki bazı tutarsızlıklar (anlambilim korunmadığından) 2. -O2 ile karşılaştırıldığında daha küçük kazançlar. Şimdilik, genellikle -O2 ve -xhost ile …

21 performance  hpc  compiling  fortran 

Sıfırdan paralel bir bilimsel hesaplama yazılımı geliştirmek istiyorum. Hangi dilin başlayacağı konusunda bazı düşünceler istiyorum. Program, txt dosyalarına veri okuma / yazma ve paralel olarak yoğun hesaplamaların yapılmasını, birçok LU faktorizasyonunu ve seyrek lineer çözücülerin kullanımını içerir. Düşündüğüm aday çözümler OpenMP veya co-array ile Fortran 2003/2008, openmp cilk + veya …

18 python  hpc  c++  fortran  simulation 

GROMACS moleküler dinamiği (MD) kodunu çalıştırdım24 Intel Xeon CPU içeren düğümlerden oluşan bir Ubuntu Linux kümesinde . Özel ilgi alanım kayan nokta aritmetik hassasiyetine biraz duyarlı olduğu için, çift hassasiyetin daha yüksek hesaplama maliyetine rağmen GROMACS'ı tek hassasiyet yerine çift hassasiyetle çalıştırmak zorunda kaldım. Küme üzerinde, GROMACS'ı çift hassasiyetle derledim. …

17 hpc  floating-point  molecular-dynamics  gpu 

Kendi çalışmalarımın çoğu algoritma ölçeğini daha iyi hale getirme etrafında dönüyor ve paralel ölçekleme ve / veya paralel verimliliği göstermenin tercih edilen yollarından biri, bir algoritma / kodun performansını çekirdek sayısı, örneğin ör. burada ekseni çekirdek sayısını ve eksenini bir miktar metrik temsil eder , örneğin birim zaman başına yapılan …

17 parallel-computing  hpc  scaling  plotting 

OS X'in başlangıcına geri dönünce, en azından Mac dünyasında (o zaman bilimsel hesaplamalara yakın bir yerde değildim) Mac OS hakkında bilimsel bilgi işlem ve HPC uygulamaları için bir platform olarak büyük bir hubbub var gibiydi. XGrid kutudan çıktı, Virginia Tech süslü Mac tabanlı bilgi işlem kümesine sahipti, Stanford harika şeyler …

17 software  hpc 

Çalışma grubumuz, bina enerji performansını simüle eden bir masaüstü uygulaması üretir. Bir .NET uygulamasıdır ve kullanıcı çok fazla simülasyon çalıştırdığında oldukça zaman alıcı olabilir. Simülasyonlar tamamen paralelleştirilebilir ve "ofiste" çok önemli HPC bilgi işlem kaynaklarımız var. Sahip olduğumuz bir fikir, kullanıcıların çok uzun süre çalışacağını bildiğimiz simülasyonları boşaltmasına izin vermektir …

17 hpc  partitioning 

Bu soru hesaplama ile ilgili olduğu için buraya göndermeye karar verdim. İnşallah uygun görülecektir. Atmosferik ve okyanus modellerini çalıştırmaya yeni başladım ve mevcut masaüstümden daha fazla çekirdek, bellek ve disk alanına ihtiyacım olduğunu fark ettim. Kurumum, araştırmacıların çekirdek başına ayda sabit bir fiyatla çekirdek kiralayabilecekleri yüksek performanslı bir bilgi işlem …

16 hpc 

MPI hakkında en sevmediğim şey veri tipleriyle (yani veri haritaları / maskeleri) uğraşmaktır, çünkü bunlar nesne yönelimli C ++ ile güzel uymuyor. boost::mpiancak web sitelerinden yalnızca MPI 1.1'i destekler: boost :: mpi, standart İleti Geçiş Arabirimi için C ++ dostu bir arabirimdir… Boost.MPI, Boost.Serialization kitaplığını kullanarak kullanıcı tanımlı türler için …

16 hpc  c++  mpi 

Çok fazla HPC çalışması yapmayan bir alandayım ve bununla karşılaştığında, genellikle diğer alanlardan araştırmacıların yöntemlerine ve benzerlerine yeni uygulamalar keşfetmesinin sonucu. Öncelikle bunun anlamı, çalışma sırasında asla gerçekten tanıtılmaması veya atölye, seminer ve benzerlerinde çok fazla yetiştirilmemesidir - bir kişinin tüm kariyerine ihtiyaç duymadan gitmek mümkündür. Ancak aynı zamanda, en …

16 hpc  education