«mpi» etiketlenmiş sorular

MPI standardının 3.0 sürümü C ++ arayüzünü resmen silmiş (daha önce kullanımdan kaldırılmıştır). Uygulamalar hala destekleyebilirken, MPI-3'te yeni olan özellikler, MPI standardında tanımlanan bir C ++ arayüzüne sahip değildir. Daha fazla bilgi için http://blogs.cisco.com/performance/the-mpi-c-bindings-what-happened-and-why/ adresini ziyaret edin. C ++ arayüzünü MPI'dan kaldırma motivasyonu C arayüzüne göre önemli bir değere sahip …

28 c++  mpi 

Önemsiz olarak paralelleştirilebilen bir uygulamam var, ancak performansı büyük ölçüde G / Ç'ye bağlı. Uygulama, genellikle 2-5 GB boyutunda bir dosyada depolanan tek bir girdi dizisini okur (ancak bu sayının gelecekte büyümesini beklerim). Tipik bir hesaplama, aynı işlemi o dizinin her satırına veya sütununa uygular. CPU-ağır işlemler için yaklaşık 100 …

20 io  parallel-computing  mpi 

MPI hakkında en sevmediğim şey veri tipleriyle (yani veri haritaları / maskeleri) uğraşmaktır, çünkü bunlar nesne yönelimli C ++ ile güzel uymuyor. boost::mpiancak web sitelerinden yalnızca MPI 1.1'i destekler: boost :: mpi, standart İleti Geçiş Arabirimi için C ++ dostu bir arabirimdir… Boost.MPI, Boost.Serialization kitaplığını kullanarak kullanıcı tanımlı türler için …

16 hpc  c++  mpi 

5 Boyutlu nüfus dengesi modelini sayısal olarak çözmek için kodu paralelleştiriyorum. Şu anda FORTRAN'da çok iyi bir MPICH2 paralel kod var ama parametre değerlerini arttırdığımız gibi diziler dağıtılmış bellek modunda çalışmak için çok büyük hale geliyor. Her düğümün iki adet 8 çekirdekli CPU ve 128 GB RAM'e sahip olduğu 15 …

14 parallel-computing  fortran  numerics  mpi  compiling 

Genellikle, seri kodu yazıyorum ve bunu yaptığımda bazı xUnit tarzı test çerçevesiyle (MATLAB xUnit, PyUnit / nose veya Google'ın C ++ test çerçevesi) birim testleri yazıyorum. Bir cursory Google aramasına dayanarak, uygulayıcıların MPI kullanan test kodunu nasıl kullandığını çok fazla görmedim. Bunun için en iyi uygulamalar var mı? Birim testi …

13 parallel-computing  petsc  mpi  testing  reproducibility 

Tek bir mpi_allgather işlemi veya bir mpi_scatter ve bir mpi_gather işlemi kullanarak paralelleştirilebilir bir sorun üzerinde çalışıyorum. Bu işlemler bir while döngüsü içinde çağrılır, bu nedenle birçok kez çağrılabilirler. Bir MPI_allgather şeması ile uygulamada, yinelenen matris çözme için tüm süreçlere dağıtılmış bir vektör topluyorum. Diğer uygulamada, dağıtılmış vektörü tek bir …

11 algorithms  complexity  mpi 

Bir MPI uygulamasını son derece asenkron iletişim paterni ile optimize etmeye çalışıyorum. Her sıralamada hesaplanacak şeylerin bir listesi vardır ve girişler veya çıkışlar farklı bir sıralamada bulunuyorsa gerektiği şekilde mesaj gönderir. Ayrıca, her rütbe iş parçacığı (şu anda bir iletişim iş parçacığı ve 5 işçi ile) dişli. Bana her iş …

10 mpi  visualization 

Süper bilgisayarların gerçek görevle ilgili işleri yapmak yerine koordine etmeye ne kadar kaynak harcadığını belirten güvenilir referanslar arıyorum. Kaynaklar kullanılabilir işlem gücü olabilir, ancak Watt bile geçerli bir birim gibi görünüyor. Profesörlerimden veya ders kitaplarımızdan birinin, bir zamanlar büyük ölçüde paralel sistemlerde, mevcut işlem gücünün yarısının görevi ve mesaj iletmeyi …

10 hpc  mpi