R: Veri setinde NaN bulunmamasına rağmen “yabancı işlev çağrısı” na NaN / Inf atma Rastgele Orman [kapalı]

29

Bir veri kümesi üzerinde çapraz doğrulanmış rasgele bir orman çalıştırmak için şapka kullanıyorum. Y değişkeni bir faktördür. Veri setimde hiç NaN, Inf veya NA yok. Ancak rastgele orman çalıştırırken, alıyorum

Error in randomForest.default(m, y, ...) : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)
In addition: There were 28 warnings (use warnings() to see them)
Warning messages:
1: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion
2: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion
3: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion
4: In data.matrix(x) : NAs introduced by coercion

Bu hatanın NA'nın zorlama tarafından getirilmesinden kaynaklanıp kaynaklanmadığı konusunda bir fikri olan var mı? Öyleyse, böyle bir zorlamayı nasıl önleyebilirim?

r random-forest caret regression prediction fitting social-science poisson-distribution distributions characteristic-function bayesian prior regression normal-distribution interaction nonparametric skewness svm standard-deviation standard-error regression-coefficients igraph natural-language word2vec word-embeddings regression machine-learning sampling r regression machine-learning random-forest ensemble sampling unbiased-estimator proof estimators mse probability conditional-probability bayes anova missing-data neural-networks recommender-system r confidence-interval sample multiple-imputation r time-series forecasting mase

— Info5ek
kaynak

36

Eğitim setinizde 'char' sınıfı ile birlikte bazı özellikler bulunmalıdır.

Lütfen bunu kontrol et

> a <- c("1", "2",letters[1:5], "3")
> as.numeric(a)
[1]  1  2 NA NA NA NA NA  3
Warning message:
NAs introduced by coercion

— Pankaj Sharma
kaynak

Eklemek gerekirse, özellik gerçekten kategorikse, yine de onu bir faktöre dönüştürerek dahil edilebilir, örn. filan <-as.factor (filan)

— P.Windridge

14

Muhtemelen nedeni, veri çerçevenizde bazı karakter değişkenlerine sahip olmanızdır.

Tüm karakter değişkenlerini bir satırdaki faktöre dönüştür:

library(dplyr) data_fac=data_char %>% mutate_if(is.character, as.factor)

— pablo_sci
kaynak

2

Bunun mutate_if()için kullanmayı düşünmemiştim ... teşekkürler!

— Andrew Brēza

3

Uyarıda gösterildiği gibi, karakter veri tiplerine sahip sütun sayısı (28) olan 28 hata vardı. Bu sütunları çalıştırmanın başlaması için izin verilen faktörlere zorlamak.

— Info5ek
kaynak