«lme4-nlme» etiketlenmiş sorular

lme4 ve nlme, doğrusal, genelleştirilmiş doğrusal ve doğrusal olmayan karışık efekt modellerinin montajı için kullanılan R paketleridir. Karışık modeller hakkında genel sorular için [mixed-model] etiketini kullanın.

3
Rasgele bir etkinin önemli olup olmadığını nasıl test edebilirim?
Ne zaman rastgele bir efekt kullanılacağını ve ne zaman gereksiz olduğunu anlamaya çalışıyorum. Yaptığım kural, benim yaptığım 4 veya daha fazla grubun / şahsın varsa (15 kişisel geyik). Bu geyiklerin bazıları toplam 29 deneme için 2 veya 3 kez denenmiştir. Riskli manzaralar altında olmadıklarından farklı davranıp davranmadıklarını bilmek istiyorum. Böylece, …
4
Aşırı dağınık poisson sonuçları için çok seviyeli bir modeli nasıl takabilirim?
Ben R kullanarak Poisson dağılımlı (fazla dağılımlı) çok seviyeli bir GLMM'ye uymak istiyorum. Şu anda lme4 kullanıyorum ancak yakın zamanda quasipoissonailenin çıkarıldığını fark ettim . Başka bir yerde, gözlem başına bir seviye ile rastgele bir kesişme ekleyerek binom dağılımları için ilave aşırı dağılım modelleyebileceğinizi görmüştüm. Bu, poisson dağılımı için de …
2
lme ve lmer karşılaştırma
Biri beni bu iki işlev arasındaki mevcut farklılıklar hakkında aydınlatabilir mi diye merak ediyordum. Aşağıdaki soruyu buldum: Karma efekt modelleri için nlme veya lme4 R kütüphanesi nasıl seçilir? , ama bu birkaç yıl önceye dayanıyor. Bu yazılım çevrelerinde bir ömür boyu. Özel sorularım: lmeBununla lmerbaşa çıkamayan herhangi bir korelasyon yapısı …
1
Anova () komutu bir lmer model nesnesiyle ne yapar?
Umarım bu, burada benim için birisinin lmer( lme4 R paketinden) uygun olan karışık efektler modelindeki kareler toplamının ayrıştırılması niteliği ile ilgili cevap verebileceği bir sorudur . Öncelikle, bu yaklaşımı kullanma konusundaki tartışmaların farkında olduğumu söylemeliyim ve pratikte modelleri karşılaştırmak için önyüklemeli bir LRT kullanma ihtimalim daha fazla olacaktır (Faraway, 2006 …
5
Biyoloji, psikoloji ve tıp alanında uzman kullanan karma model analizi için örnek raporlar?
Genel görüş birliği lmer(), klasik ANOVA yerine R üzerinden karışık modeller kullanmak gibi göründüğü için (genellikle belirtilen nedenlerden dolayı, dengesiz tasarımlar, rastgele çapraz efektler vb.), Verilerimi denemek istiyorum. Ancak bu yaklaşımı süpervizörüme (nihayetinde p-değeri olan klasik bir analiz bekliyor) veya daha sonra hakemlere “satabileceğim” için endişeleniyorum. lmer()Tarla biyolojisi, psikoloji, tıp …
2
Çok seviyeli bir modelde, tahmin etmeme ve rastlantısal etki korelasyon parametrelerini tahmin etmenin pratik sonuçları nelerdir?
Çok seviyeli bir modelde, tahmin etmeme ve rastlantısal etki korelasyonu parametrelerini tahmin etmenin pratik ve yorumlama ile ilgili etkileri nelerdir? Bunu sormanın pratik nedeni, R'deki lmer çerçevede, parametreler arasındaki korelasyon modelinde tahminler yapıldığında, MCMC teknikleri ile p-değerleri tahmin etmek için uygulanan bir yöntem bulunmamasıdır. Örneğin, bu örneğe bakıldığında (aşağıda alıntı …
3
AIC farklı model tipleri arasında karşılaştırma yapabilir mi?
Doğrusal olmayan modelleri R'de karşılaştırmak için AIC'yi (Akaike'ın Bilgi Ölçütü) kullanıyorum. Farklı model türlerinin AIC'lerini karşılaştırmak geçerli midir? Spesifik olarak, glm ile takılmış bir modeli karşılaştırırken, glmer (lme4) tarafından takılan rastgele etki terimine sahip bir modeli karşılaştırıyorum. Olmazsa, böyle bir karşılaştırma yapmanın bir yolu var mı? Yoksa fikir tamamen geçersiz …
1
predict () lmer Karışık Etki Modelleri için İşlev
Sorun: Diğer okuduğunuz mesajlarınpredict karışık etkiler için geçerli değildir lmer: [R] de {lme4} modelleri. Bu konuyu bir oyuncak veri seti ile keşfetmeye çalıştım ... Arka fon: Veri kümesi bu kaynaktan uyarlanır ve ... require(gsheet) data <- read.csv(text = gsheet2text('https://docs.google.com/spreadsheets/d/1QgtDcGJebyfW7TJsB8n6rAmsyAnlz1xkT3RuPFICTdk/edit?usp=sharing', format ='csv')) Bunlar ilk satırlar ve başlıklar: > head(data) Subject Auditorium …
2
Modelimi lmer'da doğru bir şekilde belirttim mi?
Birçok yardım sitesini araştırdım ve karışık bir modelde daha karmaşık iç içe terimlerin nasıl belirleneceği konusunda kafam hala karıştı. Ayrıca kullanımı gibi karıştı :ve /ve |etkileşimleri belirterek kullanarak rasgele faktörlerle yuva içinde lmer()de lme4yer pakette R. Bu sorunun amacı için, verilerimi bu standart istatistiksel modelle doğru şekilde tasvir ettiğimi varsayalım: …
1
Sıfır korelasyonlu karma modeller teorik olarak ne zaman ses çıkar?
Aşağıdaki karma teklif, karma etki modellemesi alanındaki liderlerden, rastgele etkiler ('ZCP' modelleri) arasındaki sıfır korelasyonlu modellerde koordinatın kaymasının model tahminlerini değiştirdiğini iddia ediyor. Ancak, birileri iddialarını detaylandırabilir veya daha fazla haklı gösterebilir mi? Söz konusu ifadeler Bates ve arkadaşlarının 2015 lme4, lme4 Kullanarak Doğrusal Karışık Etki Modellerini Takma , 7. …
5
Karma doğrusal modelde çoklu bağlantı doğrusallığı nasıl test edilir ve önlenir?
Şu anda bazı karışık efektli doğrusal modeller kullanıyorum. R içinde "lme4" paketini kullanıyorum. Modellerim şu formu alıyor: model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) Modellerimi çalıştırmadan önce, öngörücüler arasında olası çoklu bağlantı olup olmadığını kontrol ettim. Bunu ben yaptım: Tahmin edicilerin bir veri çerçevesi oluşturun …
4
R'deki karışık modellerin lmer / lme karışık modellerini kontrol etme
Üç farklı görevde 30 erkek ve 30 kadını test ettiğim tekrarlanan bir tasarım yaptım. Erkeklerin ve kadınların davranışlarının nasıl farklı olduğunu ve bunun göreve nasıl bağlı olduğunu anlamak istiyorum. Bunu araştırmak için hem lmer hem de lme4 paketini kullandım, ancak her iki yöntem için de varsayımları kontrol etmeye çalışıyorum. Çalıştırdığım …
Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.