«glmm» etiketlenmiş sorular

Ne zaman rastgele bir efekt kullanılacağını ve ne zaman gereksiz olduğunu anlamaya çalışıyorum. Yaptığım kural, benim yaptığım 4 veya daha fazla grubun / şahsın varsa (15 kişisel geyik). Bu geyiklerin bazıları toplam 29 deneme için 2 veya 3 kez denenmiştir. Riskli manzaralar altında olmadıklarından farklı davranıp davranmadıklarını bilmek istiyorum. Böylece, …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

Karışık ve karıştırılmamış GLM'ler arasındaki farkların ne olduğunu merak ediyorum. Örneğin, SPSS'de açılır menü kullanıcıların her ikisine de sığmasını sağlar: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Eksik değerlerle farklı şekilde mi ilgileniyorlar? Bağımlı değişkenim ikili ve birkaç kategorik ve sürekli bağımsız değişkenim var.

34 mixed-model  generalized-linear-model  glmm  gee 

Şu anda zor sayım verileri için doğru modeli bulmakta zorlanıyorum (bağımlı değişken). Gaussian ya da negatif binomial gibi çeşitli aileleri olan genelleştirilmiş lineer karışık efekt modellerinin yanı sıra lmerve lme4(log kaydı ile ) gibi çeşitli farklı modelleri (veri çeşitlerim için karma efekt modelleri gerekli) denedim . Ancak, ortaya çıkan uyumun …

25 generalized-linear-model  residuals  negative-binomial  count-data  glmm 

Aşağıdaki sözdizimini kullanarak karma efektler lojistik regresyon uyguladık; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Konu ve Öğe rastgele etkilerdir. Konu terimi için katsayı ve standart sapma olan tuhaf bir sonuç alıyoruz; Generalized linear mixed …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

Bağımlı değişkenin yüzde olduğu tekrarlanan ölçümler deneyim var ve bağımsız değişkenler olarak birden fazla faktör var. glmerR paketinden lme4, bunu bir lojistik regresyon problemi olarak (belirterek family=binomial) tedavi etmek için kullanmak istiyorum . Verilerim şuna benzer: > head(data.xvsy) foldnum featureset noisered pooldur dpoolmode auc 1 0 mfcc-ms nr0 1 mean …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Ben bir binom dağılımı ve logit bağlantı fonksiyonu ile bir GLMM var ve verilerin önemli bir yönünün modelde iyi temsil olmadığını hissediyorum. Bunu test etmek için, verilerin logit ölçeğinde doğrusal bir fonksiyon tarafından iyi tanımlanıp tanımlanmadığını bilmek istiyorum. Bu nedenle, artıkların iyi davranıp davranmadığını bilmek istiyorum. Ancak, hangi artıkların arsa …

19 binomial  residuals  glmm  lme4-nlme 

Ben kullanıyorum glmergelen işlevi lme4R paketin ve ben kullanıyorum bobyqaoptimize edici (benim durumumda varsayılan yani). Bir uyarı alıyorum ve bunun ne anlama geldiğini merak ediyorum. Warning message: In optwrap(optimizer, devfun, start, rho$lower, control = control, : convergence code 3 from bobyqa: bobyqa -- a trust region step failed to reduce …

16 r  optimization  lme4-nlme  convergence  glmm 

Ben lme4::glmer()ikili değil, ancak sıfır ile bir arasında sürekli bir değişken olan bir binom genelleştirilmiş karışık model (GLMM) sığdırmak için kullanmaya çalışıyorum . Bu değişken bir olasılık olarak düşünülebilir; aslında olan insan deneklerin (bir deney ben yardım analiz olarak) bildirilen olasılığı. Yani bu kadar değil bir "ayrık" fraksiyon, ancak sürekli …

15 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Rasgele bir efekt olarak kullanmak istediğim değişkenin sadece bazı seviyeler için tek bir gözlemi olduğu bir veri setim var. Önceki soruların cevaplarına dayanarak, prensip olarak, bunun iyi olabileceğini topladım. Sadece 1 gözlemi olan deneklerle karışık bir model takabilir miyim? Rastgele engelleme modeli - konu başına bir ölçüm Ancak, ikinci linkte …

14 r  mixed-model  generalized-linear-model  glmm  lme4-nlme 

Formda bir lojistik regresyon modeli çalıştırıyorum: lmer(response~1+(1|site), family=binomial, REML = FALSE) Normalde ICC'yi kesişme ve artık varyanslardan hesaplarım, ancak modelin özeti artık varyansı içermez. Bunu nasıl hesaplayabilirim?

13 logistic  lme4-nlme  glmm 

Denek içi bir deney kullanarak deneysel araştırmalardan elde edilen sayım verilerini modellerken bir dizi pratik soru ile karşılaştım. Denemeyi, verileri ve şimdiye kadar yaptığım şeyleri kısaca açıklıyorum, ardından sorularımı takip ediyorum. Katılımcıların bir örneğine sırayla dört farklı film gösterildi. Her filmden sonra, RQ (tahmin edilen sayım değişkeni) için ilgi çekici …

12 generalized-linear-model  negative-binomial  glmm  poisson-regression  overdispersion 

Aşağıdaki modele sahibim: > model1<-lmer(aph.remain~sMFS1+sAG1+sSHDI1+sbare+season+crop +(1|landscape),family=poisson) ... ve bu özet çıktı. > summary(model1) Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS1 + sAG1 + sSHDI1 + sbare + season + crop + (1 | landscape) AIC BIC logLik deviance 4057 4088 -2019 4039 Random effects: …

12 r  poisson-distribution  lme4-nlme  glmm  overdispersion 

Marjinal model ve rastgele etkiler modeli ve aralarında nasıl seçim yapılacağı hakkında herhangi bir bilgi ararken bazı bilgiler buldum ama daha fazla veya daha az matematiksel soyut açıklama (örneğin burada: https: //stats.stackexchange) .com / a / 68753/38080 ). Bir yerde, bu iki yöntem / model ( http://www.biomedcentral.com/1471-2288/2/15/ ) arasında bir …

11 mixed-model  random-effects-model  glmm  gee  marginal-model 

Rastgele bir kesişim lojistik regresyonum var (tekrarlanan ölçümler nedeniyle) ve özellikle aykırı değerler ve etkili gözlemlerle ilgili bazı teşhisler yapmak istiyorum. Göze çarpan gözlemler olup olmadığını görmek için artıklara baktım. Ama aynı zamanda Cook'un mesafesi veya DFFITS gibi bir şeye bakmak istiyorum. Hosmer ve Lemeshow (2000), ilişkili veriler için model …

11 mixed-model  outliers  glmm  cooks-distance 

Birisinin nispeten basit bir soru olduğunu düşündüğüm şeylere yardımcı olabileceğini umuyorum ve bence cevabı biliyorum ama onaylamadan emin olamayacağım bir şey haline geldi. Yanıt değişkeni olarak bazı sayım verileri var ve bu değişken bir şeyin orantılı varlığı ile nasıl değiştiğini ölçmek istiyorum. Daha ayrıntılı olarak, yanıt değişkeni, bir dizi alanda …

11 r  binomial  proportion  glmm  lme4-nlme