«efficiency» etiketlenmiş sorular

Çözülmesi gereken birkaç dışbükey olmayan küresel optimizasyon problemim var. Şu anda , oldukça etkili olan MATLAB's Optimizasyon Araç Kutusu'nu (özellikle, fmincon()algoritma = ile 'sqp') kullanıyorum . Ancak, kodumun çoğu Python'da ve optimizasyonu Python'da da yapmak isterim. Rekabet edebilecek Python bağlarına sahip bir NLP çözücü var mı fmincon()? O olmalı Doğrusal …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Moleküler simülasyonlarda ele almamız gereken en önemli konulardan biri mesafeye bağlı kuvvetlerin hesaplanmasıdır. Biz ayırma mesafesi bile güçlere sahip kuvvet ve mesafe fonksiyonlarını kısıtlamak Eğer , o zaman biz sadece uzaktan karesini hesaplayabilir ve yaklaşık endişe gerekmez . Ancak tek güçler varsa, o zaman ile başa çıkmamız gerekir .rrrr2=r⋅rr2=r⋅rr^2 = …

26 efficiency 

Gromacs ve DL_POLY gibi çeşitli yazılım paketleri kullanarak moleküler dinamik (MD) simülasyonları kullanıyorum. Gromac'lar artık hem partikül ayrışma hem de alan ayrışma algoritmalarını desteklemektedir. Varsayılan olarak, Gromacs simülasyonları alan ayrışmasını kullanır, ancak uzun yıllar öncesine kadar Gromac'larda uygulanan tek yöntem parçacık ayrışmasıydı. Gromacs gazetelerinden birinde (DOI 10.1002 / jcc.20291), yazarlar …

15 parallel-computing  efficiency  molecular-dynamics  simulation 

Araştırma grubum, daha sonra analiz edilmesi gereken tek bir yörüngenin parçası olarak gigabaytlarca veri üretebilen moleküler dinamiklere odaklanıyor. İlgilendiğimiz sorunların birçoğu veri kümesindeki korelasyonları içerir, bu da daha ardışık bir yaklaşım kullanmak yerine büyük miktarda veriyi hafızada izlememiz ve analiz etmemiz gerektiği anlamına gelir. Bilmek istediğim şey, büyük veri kümelerinin …

15 python  c  efficiency 

Örneğin, forbir matrisin dizinleri üzerinde çalışan bir çift döngü varsa, sonra dış döngüde sütun çalışan dizin koyarak daha verimli olduğunu okudum . Örneğin: a=zeros(1000); for j=1:1000 for i=1:1000 a(i,j)=1; end end Üç veya daha fazla fordöngüm varsa kodlamanın en etkili yolu nedir ? Örneğin: a=zeros(100,100,100); for j=1:100 for i=1:100 for …

12 matlab  efficiency 

Ben bir mesafe kriteri sağlandığında olmadığını kontrol etmek hesaplamaları yapmak isteyen am: Bir vektör arasındaki mesafe olduğunu ve anter vektör az bazı değer daha olmalı . Verilerim dikey bir koordinat ızgarasına göre bölümlendi. Kesim, en yakın komşu koordinatların uç noktaları arasındaki mesafeden daha küçük olduğu için, şeylerin doğru ayarlanıp ayarlanmadığını …

12 efficiency 

Otomatik farklılaşma , belirli bir girdi üzerindeki bir programın türevini sayısal olarak değerlendirmemizi sağlar. Bu hesaplamanın orijinal programı çalıştırma maliyetinin beş katından daha az bir maliyetle yapılabileceği teoremi vardır. Bu beş faktörü bir üst sınırdır. Hangi durumlarda bu maliyet daha da azaltılabilir? Birçok saha içi türev kodu orijinal programın hızına …

12 automatic-differentiation  efficiency 

Kapalı. Bu soru konu dışı . Şu anda cevapları kabul etmiyor. Bu soruyu geliştirmek ister misiniz? Sorunuzu güncelleyin o yüzden -konu üzerinde Hesaplamalı Bilim Stack Exchange için. 5 yıl önce kapalı . den büyük ve den daha küçük bir karmaşıklık derecesi var mı ?O(n)O(n)O(n)O(nlogn)O(nlog⁡n)O(n \log n)

10 algorithms  complexity  efficiency 

Ben özellikle DGEMM bileşeni için, akademik bilgi işlem için bu iki grafik kartı arasındaki farkı anlamaya çalışıyorum. Ham istatistiklere bakarsak, her ikisi de aynı GK110 yongasına sahip, neredeyse her kategoride karşılaştırılabilir istatistiklere sahip ve inanıyorum ki, aynı çekirdek mimariye sahip. Herhangi bir indirimden önce K20X bir Titan'ın maliyetinin yaklaşık 4 …

10 performance  gpu  efficiency 

Çift hassasiyetli özel fonksiyonların uygulanmasında son teknoloji nedir? Aşağıdaki integrale ihtiyacım var: içinm=0,1,2,. . . vedaha düşük eksik gama fonksiyonu açısından yazılabilent>0. İşte benim Fortran ve C uygulamam:Fm( t ) = ∫10u2 me- t u2du = γ( m + 12, t )2 tonm + 12Fm(t)=∫01u2me−tu2du=γ(m+12,t)2tm+12 F_m(t) = \int_0^1 u^{2m} e^{-tu^2} …

10 efficiency  accuracy  special-functions