«mixed-model» etiketlenmiş sorular

Bazı bazı tepki değişken olduğunu varsayalım yijyijy_{ij} den ölçüldü jjj içinde kardeş inci iii inci aileyi. Ek olarak, her bir denekten aynı anda bazı davranışsal veriler xijxijx_{ij} toplanmıştır. Aşağıdaki doğrusal karışık efektler modeli ile durumu analiz etmeye çalışıyorum: yij=α0+α1xij+δ1ixij+εijyij=α0+α1xij+δ1ixij+εijy_{ij} = \alpha_0 + \alpha_1 x_{ij} + \delta_{1i} x_{ij} + \varepsilon_{ij} burada …

14 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix  non-independent 

Birisi bana diğer rastgele etkileri de tahmin etmem gerektiğinde R'nin parçalı doğrusal bir modelde (sabit veya rastgele bir parametre olarak) kırılma noktasını nasıl tahmin edeceğini söyleyebilir mi? Aşağıda bir kırılma noktası için rastgele bir eğim varyansı ve rastgele bir y kesme noktası varyansı ile bir hokey sopası / kırık çubuk …

14 r  mixed-model  lme4-nlme  change-point  piecewise-linear 

Birisi bana boyuna verileri kullanma aov()ve lme()analiz etme arasındaki farkı söyleyebilir ve bu iki yöntemden elde edilen sonuçları nasıl yorumlayabilir? Aşağıda, aynı kullanarak veri kümesi analiz aov()ve lme()ve 2 farklı sonuçlar aldık. İle aov()ben Tedavi etkileşimi süresinde önemli bir sonuç var, ama doğrusal karma modelin yerleştirilmesi, Tedavi etkileşimi zaman önemsizdir. …

14 r  mixed-model  repeated-measures  panel-data 

Douglas Bates, aşağıdaki modellerin "vektör değerli rasgele efektler için varyans-kovaryans matrisinin bileşik simetri adı verilen özel bir formu varsa" eşdeğer olduğunu belirtir ( bu sunumdaki slayt 91 ): m1 <- lmer(y ~ factor + (0 + factor|group), data) m2 <- lmer(y ~ factor + (1|group) + (1|group:factor), data) Özellikle Bates …

13 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

ANOVA'nın tahminlerini moment yöntemini kullanarak yaptığı çeşitli yerlerde görüyorum. Bu iddiayla kafam karıştı, çünkü anların yöntemine aşina olmasam da, anlayışım bunun maksimum olabilirlik yönteminden farklı ve ona eşit olmayan bir şey olduğu; Öte yandan, ANOVA kategorik prediktörlerin ve regresyon parametrelerinin EKK tahmini doğrusal bir regresyon olarak görülebilir olduğu maksimum olabilirlik. …

13 anova  mixed-model  maximum-likelihood  method-of-moments 

Temel istatistiklerde, çıkarımların geçerli olabilmesi için genel bir doğrusal model ile gözlemlerin bağımsız olması gerektiğini öğrendim. Kümeleme gerçekleştiğinde, bağımsızlık artık hesaba katılmadıkça geçersiz çıkarımlara yol açmayabilir. Bu tür kümelenmeyi hesaba katmanın bir yolu karışık modeller kullanmaktır. Bunu açıkça gösteren simüle edilmiş ya da edilmemiş bir örnek veri kümesi bulmak istiyorum. …

13 r  mixed-model  inference  independence 

Bu varsayımsal veri kümesini ele alalım: set.seed(12345) num.subjects <- 10 dose <- rep(c(1,10,50,100), num.subjects) subject <- rep(1:num.subjects, each=4) group <- rep(1:2, each=num.subjects/2*4) response <- dose*dose/10 * group + rnorm(length(dose), 50, 30) df <- data.frame(dose=dose, response=response, subject=subject, group=group) Kullanabileceğimiz lmerastgele bir etki modeli ile tepkisini modellemek için: require(nlme) model <- lme(response …

13 mixed-model  linear-model  prediction 

Diyelim ki ailelerde yuvalanmış kardeşlerde bazı değişkenler ölçtüm. Veri yapısı şöyle görünür: aile kardeş değeri ------ ------- ----- 1 1 y_11 1 2 y_12 2 1 y_21 2 2 y_22 2 3 y_23 ... ... ... Aynı aile içinde kardeşler üzerinde yapılan ölçümler arasındaki ilişkiyi bilmek istiyorum. Bunu yapmanın olağan …

13 mixed-model  intraclass-correlation 

LME modellerinin, doğruluk verilerinin analizinde (yani, psikoloji deneylerinde) daha geleneksel olduğunu, geleneksel yaklaşımların (örneğin ANOVA) yapamayacağı binom ve normal olmayan dağılımlarla çalışabildiklerini duydum. LME modellerinin bu diğer dağıtımları dahil etmelerine izin veren matematiksel temeli nedir ve bunu açıklayan teknik olmayan bazı makaleler nelerdir?

13 mixed-model 

Aşağıdaki paragrafta belirtildiği gibi, karışık efekt modelinde her bireyin eğimlerini çıkarmak istiyorum Yaş, cinsiyet ve eğitim yılı terimleri de dahil olmak üzere bilişsel özet ölçütlerdeki bireysel değişim yollarını sabit etkiler olarak karakterize etmek için karışık efekt modelleri kullanıldı (Laird ve Ware, 1982; Wilson vd., 2000, 2002c) ... Yaş, cinsiyet ve …

13 r  mixed-model 

Karışık modellerde değerlerini hesaplama hakkında okuyordum ve R-sig SSS'sini okuduktan sonra, bu forumdaki diğer yayınlar (birkaçını bağlayacağım, ancak yeterli itibarım yok) ve kullandığım diğer referansları anladım Karışık modeller bağlamında değerleri karmaşıktır.R 2R2R2R^2R2R2R^2 Ancak, yakın zamanda bu iki makaleye rastladım. Bu yöntemler umut verici görünse de (bana göre) bir istatistikçi değilim …

13 r  mixed-model  r-squared  lme4-nlme 

R'deki doğrusal karışık efekt modellemesini kullanarak bazı verileri analiz ediyorum. Sonuçlarla bir poster yapmayı planlıyorum ve sadece karışık efekt modelleri ile deneyimli herhangi bir kişinin, sonuçları göstermek için hangi grafikleri kullanacağını önerebileceğini merak ediyorum modeli. Kalan arsalar, orijinal değerlere karşı uygun değerlerin arsalarını vb. Düşünüyordum. Bunun verilerime çok bağlı olacağını …

13 r  data-visualization  mixed-model 

Doğrusal olmayan karışık bir nlmemodelin tahminlerinde% 95 güven aralığı elde etmek istiyorum . Bunu yapmak için standart bir şey sağlanmadığı için , Ben Bolker'ın kitap bölümünde maksimum olasılıkla uygun modeller bağlamında belirtildiğinlme gibi "nüfus tahmin aralıkları" yöntemini kullanmanın doğru olup olmadığını merak ediyordum . takılan modelin varyans-kovaryans matrisine dayalı sabit …

12 r  mixed-model  confidence-interval  lme4-nlme 

Çok düzeyli modellemede, sınıf içi korelasyon genellikle rastgele etkiler ANOVA'dan hesaplanır yben j= γ00+ uj+ eben jybenj=γ00+uj+ebenj y_{ij} = \gamma_{00} + u_j + e_{ij} burada seviye-2 artıklar ve e i j seviye-1 artıklardır. Sonra, tahminleri elde σ 2 u ve σ 2 e varyansı için u j ve E i …

12 correlation  mixed-model  intraclass-correlation 

TL; DR: lme4optimizasyon varsayılan olarak model parametreleri sayısında lineer olarak görünmektedir ve bir yolu eşdeğer daha yavaş glmgruplar için kukla değişkenlerle modeli. Hızlandırmak için yapabileceğim bir şey var mı? Oldukça büyük bir hiyerarşik logit modeli (~ 50k satır, 100 sütun, 50 grup) sığdırmaya çalışıyorum. Verilere normal bir logit modeli takmak …

12 r  mixed-model  optimization  lme4-nlme  numerics