«pymc» etiketlenmiş sorular

PyMC, MCMC'yi kullanarak Bayes çıkarımı yapmak için bir Python kitaplığıdır. JAGS ve BUGS'ye eşdeğer bir Python'dur.

3
Bir örnek: ikili sonuç için glmnet kullanarak LASSO regresyonu
Ben kullanımı ile serpmek başlıyorum glmnetile LASSO Regresyon ilgi benim sonuç dikotom olduğunu. Aşağıda küçük bir sahte veri çerçevesi oluşturdum: age <- c(4, 8, 7, 12, 6, 9, 10, 14, 7) gender <- c(1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0) bmi_p <- c(0.86, 0.45, 0.99, 0.84, 0.85, 0.67, …
77 r  self-study  lasso  regression  interpretation  anova  statistical-significance  survey  conditional-probability  independence  naive-bayes  graphical-model  r  time-series  forecasting  arima  r  forecasting  exponential-smoothing  bootstrap  outliers  r  regression  poisson-distribution  zero-inflation  genetic-algorithms  machine-learning  feature-selection  cart  categorical-data  interpretation  descriptive-statistics  variance  multivariate-analysis  covariance-matrix  r  data-visualization  generalized-linear-model  binomial  proportion  pca  matlab  svd  time-series  correlation  spss  arima  chi-squared  curve-fitting  text-mining  zipf  probability  categorical-data  distance  group-differences  bhattacharyya  regression  variance  mean  data-visualization  variance  clustering  r  standard-error  association-measure  somers-d  normal-distribution  integral  numerical-integration  bayesian  clustering  python  pymc  nonparametric-bayes  machine-learning  svm  kernel-trick  hyperparameter  poisson-distribution  mean  continuous-data  univariate  missing-data  dag  python  likelihood  dirichlet-distribution  r  anova  hypothesis-testing  statistical-significance  p-value  rating  data-imputation  censoring  threshold 

1
Pymc kullanarak Bayes ağ çıkarımları (Yeni başlayanların kafa karışıklığı)
Şu anda Coursera'da Daphne Koller'in PGM kursuna katılıyorum. Bu bağlamda, genellikle bir Bayes Ağı'nı, gözlemlenen verilerin bir parçası olan değişkenlerin bir sebep ve sonuç odaklı grafiği olarak modelliyoruz. Ancak PyMC öğreticileri ve örneklerinde genellikle PGM ile aynı şekilde modellenmediğini veya en azından kafam karıştığını görüyorum. PyMC'de gözlemlenen herhangi bir gerçek …

2
MCMC örnekleyicileri için neden Jeffreys veya entropi temelli önceliklerin kullanılmasına karşı öneriler var?
On onların wiki sayfasından Stan devletin geliştiriciler: Sevmediğimiz bazı ilkeler: değişmezlik, Jeffreys, entropi Bunun yerine, birçok normal dağıtım önerisi görüyorum. Şimdiye kadar örnekleme itimat etmedi Bayes yöntemleri kullanılır ve nazik anlamış mutlu oldu neden binom olasılıkları için iyi bir seçimdi.θ ~ beta ( α = 12, β= 12)θ~Beta(α=12,β=12)\theta \sim \text{Beta}\left(\alpha=\frac{1}{2},\beta=\frac{1}{2}\right)
12 bayesian  mcmc  prior  pymc  stan 

1
Tren bekleme sürelerinin Bayesci modellenmesi: Model tanımı
Bu benim sık sık kamptan gelen ve Bayesci veri analizi yapmak için ilk denemem. A. Gelman'ın Bayesian Veri Analizinden bir dizi ders ve birkaç bölüm okudum. Seçtiğim ilk az ya da çok bağımsız veri analizi örneği tren bekleme süreleridir. Kendi kendime sordum: bekleme sürelerinin dağılımı nedir? Veri kümesi bir blogda …
12 bayesian  pymc 

2
PyMC acemi: takılan modelden nasıl numune alınır
Çok basit bir model deniyorum: Hassasiyeti bildiğimi varsaydığım bir Normal yerleştirmek ve sadece ortalamayı bulmak istiyorum. Aşağıdaki kod Normal'e uygun görünüyor. Ancak montajdan sonra, modelden örnek almak istiyorum, yani datadeğişkenime benzer yeni veriler üretmek istiyorum . trace("mean")Ortalama değişken için örnek almak için kullanabileceğimi biliyorum . Ancak modelin kendisinden nasıl yeni …
12 mcmc  pymc 

1
PyMC3'te Bayesci model seçimi
Verilerimde Bayesian modellerini çalıştırmak için PyMC3 kullanıyorum. Bayesian modellemede yeniyim, ancak bu sitedeki bazı blog yayınlarına , Wikipedia ve QA'ya göre , verilerimi en iyi hangi modeli temsil edebileceğini seçmek için Bayes faktörünü ve BIC ölçütünü kullanmak geçerli bir yaklaşım gibi görünüyor. benim verim). Bayes faktörünü hesaplamak için karşılaştırmak istediğim …

3
MCMC ve PyMC ile 2-Gauss karışım modeli çıkarımı
Sorun Basit bir 2-Gauss karışım popülasyonunun model parametrelerine uymak istiyorum. Bayesian yöntemleri çevresindeki tüm hype göz önüne alındığında, bu sorun için Bayesian çıkarım geleneksel uydurma yöntemleri daha iyi bir araç olup olmadığını anlamak istiyorum. Şimdiye kadar MCMC bu oyuncak örneğinde çok kötü bir performans sergiliyor, ancak belki de bir şeyleri …

2
Parametrik olmayan kümeleme için PyMC: Gauss karışımının parametrelerini tahmin etmek için Dirichlet işlemi kümelenemiyor
Sorun kurulumu PyMC'yi uygulamak istediğim ilk oyuncak sorunlarından biri parametrik olmayan kümelenmedir: bazı veriler verildiğinde, Gauss karışımı olarak modelleyin ve kümelerin sayısını ve her kümenin ortalamasını ve kovaryansını öğrenin. Bu yöntem hakkında bildiklerimin çoğu, Michael Jordan ve Yee Whye Teh'in 2007'den beri (seyreklik öfke haline gelmeden önce) ve son birkaç …

2
PyMC'de iki normal dağılım için montaj modeli
Daha fazla istatistik öğrenmeye çalışan bir yazılım mühendisi olduğum için, başlamadan önce beni affetmen gerekecek, bu ciddi yeni bölge ... Ben öğrenme been PyMC ve bazı gerçekten (gerçekten) basit örnekleri çalışma. Çalışamadığım (ve ilgili örnekleri bulamadığım) bir problem, iki normal dağılımdan üretilen verilere bir model uydurmaktır. Diyelim ki 1000 değerim …
10 modeling  python  pymc 

2
Olasılıksal programlama ile anahtar noktası tespiti (pymc)
Şu anda Hackerlar için Olasılıksal Programlama ve Bayesian Yöntemleri "kitabını" okuyorum . Birkaç bölüm okudum ve pymc ile ilk örnek metin mesajları bir cadı noktası tespit oluşan ilk Bölüm üzerinde düşünüyordum. Bu örnekte, anahtarlama noktasının ne zaman gerçekleştiğini gösteren rastgele değişken ile gösterilir . MCMC adımından sonra posterior dağılımı verilir:ττ\tauττ\tau …
Sitemizi kullandığınızda şunları okuyup anladığınızı kabul etmiş olursunuz: Çerez Politikası ve Gizlilik Politikası.
Licensed under cc by-sa 3.0 with attribution required.