«python» etiketlenmiş sorular

Programlamaya yeniyim ve ilk büyük sorunumu çözmeye ve ilk büyük programımı yazmaya çalışıyorum. Öğrenmek için açık kaynak kod örnekleri aradım, ancak şimdiye kadar sadece tam olarak anlamadığım veya gerçekten öğrenmem gereken çok ilgili şeyler yapan dillerde kodlar buldum. Burada bazı kavramsal adımlar atmakta zorlanıyorum. Küçük organik molekülleri oluşturmak, değiştirmek ve …

12 computational-chemistry  python  visualization 

Sorumun özü şudur: İki ODE sistemim var. Birinin başlangıç ​​değeri kısıtlaması, diğerinin son değeri kısıtlaması vardır. Bu, bazı değişkenler üzerinde başlangıç ​​değeri kısıtlaması ve diğerleri üzerinde son değer kısıtlaması olan tek bir sistem olarak düşünülebilir. Detaylar burada: Doğrusal bir dinamik sistem sürmek için sürekli-zaman sonlu-ufuk LQR kontrolörü kullanmaya çalışıyorum. Python …

12 python  ode  boundary-conditions 

Manyetohidrodinamik (MHD) için sonlu bir hacim kodu yazmam gerekiyor. Daha önce sayısal kod yazmıştım ama bu ölçekte değil. Ben sadece hangi iyi bir seçim olacağını sormak istedim, sınıfları ile bir veri yapısı (nesne yönelimli yaklaşım) kullanarak veya sadece hız, ölçeklenebilirlik vb açısından farklı özellikler için birden çok dizi kullanarak. Python …

11 python  finite-volume  data-structures 

Python kullanarak bir kafes oluşturmak istediğim 3 boyutlu noktalardan oluşan bir veri kümem var. Gördüğüm tüm yazılımlar kenarları sağlamanızı gerektiriyor. Python'da girdi olarak 3D'de bir dizi nokta alan ve bir kafes çıkaran bir program var mı? Mümkünse ağ örgüsünün düzgün olmasını istiyorum.

11 python  mesh-generation 

İki boyutta Poisson denklemi tarafından yönetilen fiziksel bir sorunum var iki gradyan bileşenlerinin ölçümler ∂ U / ∂ X ve ∂ U / ∂ y sınırının bir kısmı boyunca, Γ m , yani empoze etmek istiyorum ∂ u- ∇2u = f( x , y) ,ben nΩ−∇2u=f(x,y),inΩ -\nabla^2 u = f(x,y), …

11 finite-element  python  fenics 

CVXOPT: http://abel.ee.ucla.edu/cvxopt/index.html OpenOpt: http://openopt.org/Hoşgeldiniz Aralarındaki ilişki nedir? Bunların avantajları / dezavantajları nelerdir? BTW, Python / C ++ için kayda değer başka yüksek kaliteli genel amaçlı dışbükey optimizasyon kütüphanesi var mı?

11 python  convex-optimization 

Matris toplama, çarpma vb. Gibi basit görevleri yerine getirmek için Paylaşılan Bellek makineleri (hem C hem de FORTRAN) için OpenMP kodlama deneyimim var (Sadece LAPACK ile nasıl rekabet ettiğini görmek için). OpenMP'yi belgelere bakmaya gerek kalmadan basit görevleri yerine getirecek kadar biliyorum. Son zamanlarda, projelerim için Python'a geçtim ve Python …

11 parallel-computing  python 

İgraph, networkX, R veya Python'da uygulanan iki taraflı grafikler (2 modlu ağlar) için topluluk algılaması için herhangi bir algoritma var mı? Özellikle, toplulukların tespitini iki moddan sadece birinde kısıtlayabilecek böyle bir uygulama var mı?

11 python  graph-theory 

Petsc4py vs c / c ++ / fortran ne kadar yavaş? Ben önemli ölçüde yürütülmekte olan koda bağlıdır, ama bir matris-vektör ürün gibi basit bir şey hakkında ne fark?

11 petsc  python 

Lütfen Python paketini (petsc4py vb.) Ve desteklediği seyrek çözücüleri listeleyin. Paket başına bir (topluluk-wiki) yanıtı lütfen.

11 python  linear-solver  sparse-matrix 

Python yani d y birinci dereceden bir ODE çözmek için dördüncü derece Runge-Kutta yöntemi uygulamaya çalışıyorum. Yöntemin nasıl çalıştığını anlıyorum, ancakf(x,y)hesaplanmasayısını en aza indiren verimli bir algoritma yazmaya çalışıyorumçünkü bu oldukça maliyetli. Adımlar üzerinde arttıkça daha önce hesaplanan ancak nasıl yapılacağını göremediğiniz veri noktalarını yeniden kullanabileceğiniz söylendi. Bunu nasıl yapacağını …

11 ode  python  explicit-methods 

Pandas'ın ilk olarak finans dünyası için geliştirildiğini, en azından özellikle doğa bilimleri (fizik, biyoloji vb.) İçin olmadığı bir yerde okudum , bu yüzden benzer bir veri analizi Python paketi daha “doğa bilimleri odaklı” var mı? Pandaları kullanmaya yeni başladım ve diğer paketleri veya ev yapımı çözümü kullanmadan çözemediğim iki sorunla …

11 python  data-analysis  data-management 

Yavaş değişen bir veri kümem var ve kovaryans matrisinin özvektörlerini / özdeğerlerini takip etmem gerekiyor. Kullanıyorum scipy.linalg.eigh, ama çok pahalı ve zaten biraz yanlış olan bir ayrışmam olduğu gerçeğini kullanmıyor. Herkes bu sorunla başa çıkmak için daha iyi bir yaklaşım önerebilir mi?

10 linear-algebra  optimization  python  eigenvalues 

Gelen Cevabıma a MSE üzerinde soruya 2D Hamilton fizik simülasyonu ile ilgili olarak, daha yüksek bir dereceden kullanarak sürmüştür simplektik entegratörü . Daha sonra, farklı zaman adımlarının yöntemlerin farklı siparişlerle küresel doğruluk üzerindeki etkilerini göstermenin iyi bir fikir olabileceğini düşündüm ve bu yönde bir Python / Pylab betiği yazdım ve …

10 python  time-integration 

Modelin indirgenmesi için, matrisi olan bir matrisin en büyük tekil değerlerini - say 20 ile ilişkili olan sol tekil vektörleri hesaplamak istiyorum , burada ve . Ne yazık ki, matrisim herhangi bir yapı olmadan yoğun olacak. N ≈ 10 6 k ≈ 10 3 AA ∈ RN-, kA∈RN,kA \in \mathbb …

10 linear-algebra  python  reference-request  numpy  svd