«lme4-nlme» etiketlenmiş sorular

Çok değişkenli (yani, çoklu yanıt) karışık bir model yerleştirmeye çalışıyorum R. ASReml-rVe SabreR(harici yazılım gerektiren) paketlerinin yanı sıra , bunun sadece mümkün olduğu görülmektedir MCMCglmm. Olarak kağıt birlikte MCMCglmmpaketi (pp.6), Jarrod'ın Hadfield, bir uzun biçim değişken birden çok tepki değişkenleri yeniden şekillendirilmesi ve sonra genel kesişme bastırma benzerleri gibi bir …

10 r  mixed-model  multivariate-analysis  lme4-nlme  multivariate-regression 

Gelman'ı (yeniden) okudum Neden (genellikle) birden fazla karşılaştırma konusunda endişelenmek zorunda değiliz . Özellikle "Birden fazla sonuç ve diğer zorluklar" bölümünde, aynı kişi / üniteden farklı zamanlarda / koşullarda birden fazla ilgili önlemin bulunduğu durumlar için hiyerarşik bir model kullanılmıştır. Bir dizi istenen özelliğe sahip olduğu görülmektedir. Bunun mutlaka Bayesci …

10 multiple-comparisons  multilevel-analysis  lme4-nlme  jags  hierarchical-bayesian 

Veri yapısı > str(data) 'data.frame': 6138 obs. of 10 variables: $ RT : int 484 391 422 516 563 531 406 500 516 578 ... $ ASCORE : num 5.1 4 3.8 2.6 2.7 6.5 4.9 2.9 2.6 7.2 ... $ HSCORE : num 6 2.1 7.9 1 6.9 8.9 …

10 r  mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme 

Bazı verilerimde (yaş + kohort = periyot) büyük oranda eş zamanlı olan iki farklı zaman değişkenini modellemek istiyorum. Bunu yaparken lmerve bazı etkileşimlerle karşılaştım poly(), ama muhtemelen bununla sınırlı değil lmer, nlmeIIRC ile aynı sonuçları aldım . Açıkçası, poly () işlevinin ne yaptığına dair anlayışım eksik. Ne yaptığını anlıyorum poly(x,d,raw=T)ve …

10 r  lme4-nlme  polynomial 

Büyük bir veri kümesi üzerinde bazı analizleri bitiriyorum. Çalışmanın ilk bölümünde kullanılan doğrusal modeli almak ve doğrusal karışık bir model (LME) kullanarak yeniden takmak istiyorum. LME, modelde kullanılan değişkenlerden birinin rastgele bir etki olarak kullanılması dışında çok benzer olacaktır. Bu veriler, küçük bir gruptaki (~ 10) birçok gözlemden (> 1000) …

10 r  regression  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

Bu daha kavramsal bir soru, ama kullandığım Rzaman içindeki paketlerden bahsedeceğim R. Amaç, öngörme amacıyla doğrusal bir modele uymak ve daha sonra rasgele etkilerin bulunamayacağı yerlerde tahminler yapmak ise, karışık efektler modeli kullanmanın herhangi bir faydası var mı yoksa bunun yerine sabit efekt modeli mi kullanılmalı? Örneğin, ağırlık ve boy …

10 r  multiple-regression  mixed-model  lme4-nlme 

Tasarlanmış bir deneyden göz izleme verilerini analiz ediyorum. Verilerimin basitleştirilmiş bir sürümü şuna benzer (dput () verilerini buradan alabilirsiniz ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9 Plant 75 burada katılımcı …

10 r  mixed-model  poisson-regression  lsmeans  lme4-nlme 

Ben kullanarak bazı davranışsal verilerin analiz ediyorum lme4yılında Rçoğunlukla ardından Bodo Kış mükemmel öğreticiler , ama düzgün etkileşimleri hallediyorum ben anlamıyorum. Daha kötüsü, bu araştırmaya dahil olan hiç kimse karışık modeller kullanmaz, bu yüzden işlerin doğru olduğundan emin olmak konusunda biraz şaşırıyorum. Sadece yardım için bir çığlık atmak yerine, sorunu …

10 r  mixed-model  p-value  lme4-nlme 

Rastgele-etkiler için varsayılan varyans-kovaryans yapısı nedir glmerya lmeriçinde lme4paketin? Koddaki rastgele etkiler için diğer varyans-kovaryans yapısı nasıl belirtilir? Bununla ilgili herhangi bir bilgiyi lme4dokümantasyonda bulamadım .

10 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

En iyi modeli veya modelleri seçmek için AIC'yi kullanarak karışık model analizimi nasıl yürüteceğime dair literatürü araştırmaya çalıştıktan sonra bunalmış hissediyorum. Verilerimin bu kadar karmaşık olduğunu düşünmüyorum, ancak yaptığımın doğru olduğunu doğrulamak için arıyorum ve sonra nasıl ilerleyeceğiniz konusunda tavsiyede bulunuyorum. Lme veya lmer kullanmam gerekip gerekmediğinden emin değilim ve …

10 r  lme4-nlme  random-effects-model  aic 

giriş İki durumda E. coli ile kontamine yüzeylere tekrar tekrar temas eden katılımcılarım var ( A = eldiven giyiyor, B = eldiven yok). Eldivenli ve eldivensiz parmak uçlarındaki bakteri miktarı arasında ve aynı zamanda temas sayısı arasında bir fark olup olmadığını bilmek istiyorum. Her iki faktör de katılımcıdır. Deneysel yöntem: …

9 r  anova  repeated-measures  lme4-nlme  glmm 

Karmaşık maksimal karışık modellerle (verilen veri ve model için olası tüm rastgele etkileri tahmin etmek) uğraşırken nadir görülen bir durum mükemmel değildir (+1 veya -1) veya bazı rastgele etkiler arasında neredeyse mükemmel bir korelasyon. Tartışma amacıyla aşağıdaki model ve model özetini inceleyelim Model: Y ~ X*Cond + (X*Cond|subj) # Y …

9 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

GLMM'lerin özellikleri ve yorumlanması ile ilgili bazı sorularım var. 3 soru kesinlikle istatistiksel ve 2 daha spesifik olarak R hakkında. Buraya gönderiyorum çünkü nihayetinde sorunun GLMM sonuçlarının yorumlanması olduğunu düşünüyorum. Şu anda bir GLMM takmaya çalışıyorum. Boyuna Tract Veritabanı ABD nüfus sayımı verileri kullanıyorum . Benim gözlemlerim sayım yolları. Bağımlı …

9 r  lme4-nlme  poisson-distribution  negative-binomial  glmm 

Zaman içindeki eğilimin curvi-doğrusal olduğu bilinen bir uygulamada spline terimi ile karışık efektler modeli kullanıyorum. Bununla birlikte, değerlendirmek istediğim, eğri-doğrusal eğilimin doğrusallıktan bireysel sapma nedeniyle mi meydana geldiği, yoksa grup düzeyinde uyumun eğri-doğrusal görünmesini sağlayan bir etki mi? JM paketinden bir veri kümesini sıkıcı tekrarlanabilir bir örnek veriyorum. library(nlme) library(JM) …

9 r  splines  lme4-nlme 

Koşul ( cond) bazı sonuç üzerindeki etkisini kontrol etmek için R içinde lmer kullanıyorum . İşte bazı oluşur ler konu tanıtıcı verileri ve vardır a, bve ckoşullardır. library("tidyr") library("dplyr") set.seed(123) temp <- data.frame(s = paste0("S", 1:30), a = rnorm(30, -2, 1), b = rnorm(30, -3, 1), c = rnorm(30, -4, …

9 r  lme4-nlme  contrasts