«mixed-model» etiketlenmiş sorular

Şu anda lme4 R paketini kullanıyorum . Rasgele efektli doğrusal karışık efekt modellerini kullanıyorum: library(lme4) mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect + # random effects mod3 <- lmer(r1 …

37 r  regression  mixed-model  random-effects-model 

EffectsPaket için çok hızlı ve kolay bir yol sağlar karışık etki modeli sonuçlar doğrusal çizilmesi ile elde edilen lme4bir paket . effectFonksiyon hesaplar güven aralığı (GA) çok hızlı bir şekilde, ama nasıl güvenilir bunlar güven aralıkları nelerdir? Örneğin: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) fm1 <- lmer(strength ~ batch + (1 | …

36 r  mixed-model  confidence-interval  effects  lme4-nlme 

Hangi koşullar altında birisi daha temel / geleneksel analizlerin (örneğin, ANOVA, OLS regresyon vb.) Aksine çok düzeyli / hiyerarşik analiz kullanmayı düşünmelidir? Bunun zorunlu olarak kabul edilebileceği durumlar var mı? Çok düzeyli / hiyerarşik analiz kullanmanın uygun olmadığı durumlar var mı? Son olarak, yeni başlayanlar için çok düzeyli / hiyerarşik …

36 mixed-model  multilevel-analysis 

Ben Yakın zamanda gerçekleşen bileşik simetrisine karma modeli ilişkisel yapısını ayarlarken bir rastgele faktörü ve sabit olanlar gibi başka faktörler olarak, sadece konunun bir karma modeli bir ANOVA denk olduğunu. Bu nedenle, bileşik simetrinin karışık (yani, bölünmüş arsa) ANOVA bağlamında ne anlama geldiğini bilmek istiyorum, en iyi ihtimalle düz İngilizce …

35 correlation  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Aşağıdaki şekilde düzenlenen bir deneyden toplanan veriler var: Her biri 30 ağaçlı iki alan. 15 işlenir, 15 her yerde kontrol edilir. Her bir ağaçtan, gövdenin üç parçasını ve üç parçanın köklerini örnekliyoruz; bu nedenle, iki faktör seviyesinden (kök, gövde) biriyle temsil edilen ağaç başına 6 seviye 1 örnek. Daha sonra, …

34 r  mixed-model  model  nested-data  lme4-nlme 

Ne zaman rastgele bir efekt kullanılacağını ve ne zaman gereksiz olduğunu anlamaya çalışıyorum. Yaptığım kural, benim yaptığım 4 veya daha fazla grubun / şahsın varsa (15 kişisel geyik). Bu geyiklerin bazıları toplam 29 deneme için 2 veya 3 kez denenmiştir. Riskli manzaralar altında olmadıklarından farklı davranıp davranmadıklarını bilmek istiyorum. Böylece, …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

Karışık ve karıştırılmamış GLM'ler arasındaki farkların ne olduğunu merak ediyorum. Örneğin, SPSS'de açılır menü kullanıcıların her ikisine de sığmasını sağlar: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models & analyze-> mixed models-> generalized linear Eksik değerlerle farklı şekilde mi ilgileniyorlar? Bağımlı değişkenim ikili ve birkaç kategorik ve sürekli bağımsız değişkenim var.

34 mixed-model  generalized-linear-model  glmm  gee 

Sevgili millet - Açıklayamayacağım tuhaf bir şey fark ettim, ya sen? Özetle: bir lojistik regresyon modelinde bir güven aralığı hesaplamaya yönelik manuel yaklaşım ve R işlevi confint()farklı sonuçlar verir. Hosmer ve Lemeshow'un Applied Logistic Regresyon (2. Basım) bölümünden geçiyorum . 3. bölümde, oran oranını ve% 95 güven aralığını hesaplama örneği …

34 r  regression  logistic  confidence-interval  profile-likelihood  correlation  mcmc  error  mixture  measurement  data-augmentation  r  logistic  goodness-of-fit  r  time-series  exponential  descriptive-statistics  average  expected-value  data-visualization  anova  teaching  hypothesis-testing  multivariate-analysis  r  r  mixed-model  clustering  categorical-data  unsupervised-learning  r  logistic  anova  binomial  estimation  variance  expected-value  r  r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures  project-management  r  poisson-distribution  control-chart  project-management  regression  residuals  r  distributions  data-visualization  r  unbiased-estimator  kurtosis  expected-value  regression  spss  meta-analysis  r  censoring  regression  classification  data-mining  mixture 

Bana bir zaman dilimi için öngörülerde bulunacak karışık bir etki modelim var (aslında genelleştirilmiş bir karma model var). Otokorelasyonu dengelemek için eksik verilerim olduğu için bir corCAR1 modeli kullanıyorum. Verilerin bana toplam bir yük vermesi gerekiyor, bu yüzden tüm tahmin aralığı boyunca toplamam gerekiyor. Ancak, toplam yük üzerindeki standart hatanın …

32 mixed-model  variance  random-variable 

Ben R kullanarak Poisson dağılımlı (fazla dağılımlı) çok seviyeli bir GLMM'ye uymak istiyorum. Şu anda lme4 kullanıyorum ancak yakın zamanda quasipoissonailenin çıkarıldığını fark ettim . Başka bir yerde, gözlem başına bir seviye ile rastgele bir kesişme ekleyerek binom dağılımları için ilave aşırı dağılım modelleyebileceğinizi görmüştüm. Bu, poisson dağılımı için de …

32 r  mixed-model  poisson-distribution  lme4-nlme  overdispersion 

Bir karma efekt modeli kullanarak bazı verileri analiz etmeye çalışıyorum. Topladığım veriler zaman içinde farklı genotipteki bazı genç hayvanların ağırlığını temsil ediyor. Burada önerilen yaklaşımı kullanıyorum: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ Özellikle 2 numaralı çözümü kullanıyorum Bu yüzden benim gibi bir şey var require(nlme) model <- lme(weight ~ time * Genotype, random = ~1|Animal/time, …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Biri beni bu iki işlev arasındaki mevcut farklılıklar hakkında aydınlatabilir mi diye merak ediyordum. Aşağıdaki soruyu buldum: Karma efekt modelleri için nlme veya lme4 R kütüphanesi nasıl seçilir? , ama bu birkaç yıl önceye dayanıyor. Bu yazılım çevrelerinde bir ömür boyu. Özel sorularım: lmeBununla lmerbaşa çıkamayan herhangi bir korelasyon yapısı …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

Umarım bu, burada benim için birisinin lmer( lme4 R paketinden) uygun olan karışık efektler modelindeki kareler toplamının ayrıştırılması niteliği ile ilgili cevap verebileceği bir sorudur . Öncelikle, bu yaklaşımı kullanma konusundaki tartışmaların farkında olduğumu söylemeliyim ve pratikte modelleri karşılaştırmak için önyüklemeli bir LRT kullanma ihtimalim daha fazla olacaktır (Faraway, 2006 …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Bağımsız bir kategorik değişkenin (birkaç seviyeli) bir p-değeri ve etki büyüklüğü elde etmek istiyorum - bu "genel" dir ve her seviye için ayrı değildir, lme4R'deki normal çıktı gibi. Bir ANOVA çalıştırırken insanların rapor ettiği şey. Bunu nasıl alabilirim?

28 r  hypothesis-testing  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Umarım hepiniz bu soruyu umursamazsınız, ancak R'de öğrenmeye çalıştığım doğrusal karışık efektler model çıktısı için çıktı yorumlamada yardıma ihtiyacım var. Boyuna veri analizi ve doğrusal karışık etkiler regresyonunda yeniyim. Zaman öngörücüsü olarak haftalarla donattığım bir modelim var ve sonuç olarak da bir iş bulma kursum var. Haftaları (zamanları) ve çeşitli …

28 r  mixed-model  interpretation  panel-data