«r» etiketlenmiş sorular

Bir faktördeki tüm düzeylerin oranı bir eşiğin altında olan bir faktörün seviyelerini birleştirecek olan R'de bir paket / fonksiyon boyunca herkesin çalışıp çalışmadığını merak ediyor musunuz? Özellikle, veri hazırlamanın ilk adımlarından biri, toplamın en az% 2'sini oluşturmayan seyrek faktör düzeylerini ('Diğer' adı verilen bir seviyeye) birlikte çöktürmektir. Bu denetimsiz olarak …

10 r  many-categories 

R kullanarak doğrusal bir model uyduruyorum glmnet. Orijinal (düzenli olmayan) model kullanılarak takıldı lmve sabit bir terimi yoktu (yani formdaydı lm(y~0+x1+x2,data)). glmnetbir tahminler matrisi ve bir cevaplar vektörü alır. glmnetBelgeleri okuyorum ve sürekli terimden bahsedemiyorum. Öyleyse, glmnetdoğrusal uyumu başlangıç ​​noktasından zorlamayı istemenin bir yolu var mı?

10 r  regression  lasso 

Kapalı. Bu soru konu dışı . Şu anda cevapları kabul etmiyor. Bu soruyu geliştirmek ister misiniz? Konuyla ilgili olacak şekilde soruyu güncelleyin , Çapraz Doğrulanmış için olacak . 2 yıl önce kapalı . Rcpp kullanmayı öğrenmek istiyorum . Paketin CRAN web sitesindeki dokümanlardan geçtim, ancak pratik bir örnek üzerinde çalıştığımı …

10 r  c++ 

Eğer biri bartlett.testhomossedastisite varsayımını test ediyorsa, parametrik (Varyansların Homojenliği Bartlett Testi ) ve parametrik olmayan (Figner-Killeen Varyansların Homojenliği Testi fligner.test) testleri mevcuttur. Hangi türün kullanılacağını nasıl söyleyebilirim? Bu, örneğin verilerin normalliğine mi bağlı olmalıdır?

10 r  variance  heteroscedasticity  misspecification 

Temelde tamsayıların uzun bir listesi (birkaç milyon değer) olan bazı genomik kapsama verilerini inceliyorum, her biri genomdaki bu pozisyonun ne kadar iyi (veya "derin") olduğunu söylüyor. Bu verilerde "vadileri", yani çevrelerinden önemli ölçüde "daha düşük" bölgeleri aramak istiyorum. Aradığım vadilerin büyüklüğünün 50 baz ile birkaç bin arasında değişebileceğini unutmayın. Bu …

10 r  distributions  statistical-significance  data-visualization 

CSV ile gelen bir tıbbi anketten (100+ kodlu sütunlarla) verileri R ile analiz etmem gerekiyor. İlk analiz için çıngırak kullanacağım ama perde arkasında hala R var. I Eğer read.csv () dosyası, sayısal kodların kolonların sayısal veri olarak kabul edilir. Onlardan faktör () ile kategorik sütunlar oluşturabileceğimin farkındayım, ancak 100+ sütun …

10 r  categorical-data  data-transformation 

Ben sütunlar a b c(3 öznitelikleri) ile bir veri kümesi var . aise sayısal ve süreklidir bve ciki düzeyde her kategorik. Sınıflandırmak ave bdevam ettirmek için K-En yakın Komşular yöntemini kullanıyorum c. Yani, kaldırarak benim veri seti dönüşümü mesafeleri ölçmek için muktedir bve ekleme b.level1ve b.level2. Gözlem kategorilerinde iilk seviyeye …

10 r  classification  k-nearest-neighbour 

Bu daha kavramsal bir soru, ama kullandığım Rzaman içindeki paketlerden bahsedeceğim R. Amaç, öngörme amacıyla doğrusal bir modele uymak ve daha sonra rasgele etkilerin bulunamayacağı yerlerde tahminler yapmak ise, karışık efektler modeli kullanmanın herhangi bir faydası var mı yoksa bunun yerine sabit efekt modeli mi kullanılmalı? Örneğin, ağırlık ve boy …

10 r  multiple-regression  mixed-model  lme4-nlme 

"Öğrenci kalıntıları" ve "standart kalıntılar" regresyon modellerinde aynı mıdır? R'de doğrusal bir regresyon modeli oluşturdum ve Studentized artıklarının v / s uygun değerlerinin grafiğini çizmek istedim, ancak R'de bunu yapmanın otomatik bir yolunu bulamadım. Bir modelim olduğunu varsayalım library(MASS) lm.fit <- lm(Boston$medv~(Boston$lstat)) daha sonra kullanma plot(lm.fit), Öğrenci Değerli artıkların karşılık …

10 r  regression  residuals  terminology 

Durum: İki kuş (erkek ve dişi) yuvadaki yumurtalarını davetsiz misafirlere karşı korur. Her kuş koruma için saldırı veya tehdit kullanabilir ve mevcut veya yok olabilir. Verilerden ortaya çıkan, davranışın tamamlayıcı olabileceğine dair bir model vardır - kadın kullanım tehdidi sırasında erkek saldırıları ve bunun tersi. Sorum şu: Bu işbirliğini istatistiksel …

10 r  sequence-analysis 

Gerekli paketi yükleyin. library(ggplot2) library(MASS) Gama dağılımına uygun 10.000 sayı oluşturun. x <- round(rgamma(100000,shape = 2,rate = 0.2),1) x <- x[which(x>0)] Olasılık yoğunluğu fonksiyonunu çizin, x'in hangi dağılımı taktığını bilmiyoruz. t1 <- as.data.frame(table(x)) names(t1) <- c("x","y") t1 <- transform(t1,x=as.numeric(as.character(x))) t1$y <- t1$y/sum(t1[,2]) ggplot() + geom_point(data = t1,aes(x = x,y = …

10 r  mathematical-statistics  goodness-of-fit  gamma-distribution  ggplot2 

bağlam R'nin coxph () yönteminin nesneler için tekrarlanan girdileri (veya isterseniz hasta / müşteri) nasıl kabul ettiğini ve işlediğini anlamaya çalışıyorum. Bazıları bu Uzun formatı, bazıları ise 'tekrarlanan önlemler' olarak adlandırır. Örneğin, Yanıtlar bölümünde Kimlik sütununu içeren veri kümesine bakın: Değişen değişkenlere sahip Cox modelleri için en iyi paketler Ayrıca, …

10 r  repeated-measures  survival  cox-model  frailty 

removeSparseTermsFonksiyonun tmpaketteki belgelerine göre, seyreklik budur: A term-document matrix where those terms from x are removed which have at least a sparse percentage of empty (i.e., terms occurring 0 times in a document) elements. I.e., the resulting matrix contains only terms with a sparse factor of less than sparse. Öyleyse, …

10 r  text-mining  natural-language 

R işlevi cv.glm (kütüphane: önyükleme), genelleştirilmiş doğrusal modeller için tahmini K-kat çapraz doğrulama tahmin hatasını hesaplar ve deltayı döndürür. Bu işlevi bir kement regresyonu (kütüphane: glmnet) için kullanmak mantıklı mı ve eğer öyleyse, bu nasıl yapılabilir? Glmnet kütüphanesi, en iyi dönüş parametresini elde etmek için çapraz doğrulamayı kullanır, ancak son …

10 r  regression  cross-validation  lasso  glmnet 

Tasarlanmış bir deneyden göz izleme verilerini analiz ediyorum. Verilerimin basitleştirilmiş bir sürümü şuna benzer (dput () verilerini buradan alabilirsiniz ), head(lookDATA) participant fixationImage fixationCount 1 9 Automobile 81 2 9 Bird 63 3 9 Chair 82 4 9 Dog 64 5 9 Face 90 6 9 Plant 75 burada katılımcı …

10 r  mixed-model  poisson-regression  lsmeans  lme4-nlme