«meta-analysis» etiketlenmiş sorular

Genom çapında ilişki çalışmalarından iki veri setim var. Mevcut tek bilgi ilk veri seti için olasılık oranı ve p değeridir. İkinci veri seti için, Oran Oranı, p değeri ve alel frekansları (AFD = hastalık, AFC = kontroller) var (örn: 0.321). Bu verilerin bir meta-analiz yapmaya çalışıyorum ama bunu gerçekleştirmek için …

10 meta-analysis  genetics 

Birden çok sonucu olan bazı makaleler içeren çok seviyeli bir meta-analiz yapıyorum. Bu nedenle rma.mv()işlevi kullanıyorum . Örnek kod: test.main = rma.mv(yi,vi,random = ~1|ID, data = data) İki sorum var: Bir önceki sorguda kullanırken rma.mv(), ranktest()huni arsa asimetrisinin güvenilir bir test olmadığını okudum . Bununla birlikte, orijinal modele moderatör olarak …

9 meta-analysis  sensitivity-analysis  publication-bias  funnel-plot 

Standart sapmaları rapor etmeyen bir dizi çalışmayı kapsayan rastgele etkiler meta analizi üzerinde çalışıyorum; tüm çalışmalar örneklem büyüklüğünü bildirmektedir. SD eksik verilere yaklaşık veya dolaylı neden olabileceğine inanmıyorum. Tüm çalışmalarda standart sapmalar mevcut olmadığında, etki büyüklüğü olarak ham (standartlaştırılmamış) ortalama farklılıkları kullanan bir meta analiz nasıl ağırlıklandırılmalıdır? Tabii ki hala …

9 stata  missing-data  meta-analysis  meta-regression 

Metafor paketini kullanarak R etki boyutlarının d meta-analizini yapıyorum . d , hastalar ile sağlıklı arasındaki bellek puanlarındaki farklılıkları temsil eder. Bununla birlikte, bazı çalışmalar sadece ilgili d ölçümünün alt skorlarını rapor etmektedir (örneğin, birkaç farklı bellek skoru veya üç ayrı bellek testi bloğundan alınan skorlar). Lütfen çalışmaların etki boyutlarını …

9 r  meta-analysis  effect-size  meta-regression 

Diyelim ki gözlemlenmemiş bir gerçekleşme konusunda çıkarım yapmak istiyoruz xxx rastgele bir değişkenin x~x~\tilde x, normalde ortalama ile dağıtılır μxμx\mu_x ve varyans σ2xσx2\sigma^2_x. Diyelim ki başka bir rastgele değişken vary~y~\tilde y (gözlemlenmemiş gerçekleşmesini benzer şekilde arayacağız yyy) normalde ortalama ile dağıtılır μyμy\mu_y ve varyans σ2yσy2\sigma^2_y. İzin Vermekσxyσxy\sigma_{xy} kovaryans olmak x~x~\tilde …

9 meta-analysis 

Diyelim ki belirli bir sağlık önlemine bakarak bir analiz yapıyorum. Hastalar ve kontroller arasındaki bu ölçekteki farkla ve farkın 0'dan farklı olup olmadığıyla ilgileniyorum. Geçmişte aynı araştırma sorum ve sağlık ölçüme, ancak farklı hasta örneklerine baktığım çalışmalar vardı. Bayesci analizimde, ortalama farkı ve standart hatayı içeren önceki çalışmalara dayanarak önceki …

9 bayesian  meta-analysis  case-control-study 

Bu makaleden aşağıdaki greftler alınmıştır . Ben bootstrap için acemi ve R bootpaket ile doğrusal karışık model için parametrik, yarı parametrik ve parametrik olmayan bootstrapping bootstrapping uygulamaya çalışıyorum . R Kodu İşte benim Rkod: library(SASmixed) library(lme4) library(boot) fm1Cult <- lmer(drywt ~ Inoc + Cult + (1|Block) + (1|Cult), data=Cultivation) fixef(fm1Cult) …

9 r  mixed-model  bootstrap  central-limit-theorem  stable-distribution  time-series  hypothesis-testing  markov-process  r  correlation  categorical-data  association-measure  meta-analysis  r  anova  confidence-interval  lm  r  bayesian  multilevel-analysis  logit  regression  logistic  least-squares  eda  regression  notation  distributions  random-variable  expected-value  distributions  markov-process  hidden-markov-model  r  variance  group-differences  microarray  r  descriptive-statistics  machine-learning  references  r  regression  r  categorical-data  random-forest  data-transformation  data-visualization  interactive-visualization  binomial  beta-distribution  time-series  forecasting  logistic  arima  beta-regression  r  time-series  seasonality  large-data  unevenly-spaced-time-series  correlation  statistical-significance  normalization  population  group-differences  demography 

Genom çapında ilişki çalışmalarından iki veri setim var. Mevcut tek bilgi, her genotipli SNP için tek oranlar ve bunların güven aralıklarıdır (% 95). Bu iki olasılık oranını karşılaştıran bir orman grafiği oluşturmak istiyorum, ancak özet efektleri görselleştirmek için birleşik güven aralıklarını hesaplamanın yolunu bulamıyorum. PLINK programını sabit efektler kullanarak meta-analiz …

9 confidence-interval  meta-analysis  genetics  odds-ratio 

Meta analiz ve meta regresyon tekniklerini ( metaforViechtbauer R paketini kullanarak ) biliyorum, ama son zamanlarda kolayca çözemediğim bir sorunla karşılaştım. Diyelim ki anneden doğmamış çocuğa geçebilecek bir hastalığımız var ve zaten birkaç kez çalışıldı. Anne ve çocuk doğumdan hemen sonra virüs açısından test edildi. Doğmamış bir çocuk virüsü anneden …

9 meta-analysis  odds-ratio  relative-risk