«sequence-analysis» etiketlenmiş sorular

Shannon'un entropisi , her sonucun olasılıklarının toplamının, her sonuç için olasılıkların logaritması ile çarpımının negatifidir. Logaritma bu denklemde hangi amaca hizmet eder? Sezgisel veya görsel bir cevap (derinden matematiksel bir cevabın aksine) bonus puan verilecektir!

72 entropy  intuition  sequence-analysis 

Negatif binom dağılımı biyoenformatikte sayım verileri için (özellikle belirli bir deneyden belirli bir genomun belirli bir bölgesinde okunan sıralı okuma sayısı) popüler bir model haline gelmiştir. Açıklamalar değişiklik gösterir: Bazıları bunu Poisson dağılımı gibi çalışan ancak ek bir parametreye sahip, gerçek dağılımı modellemek için daha fazla özgürlüğe izin veren ve …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

Formun bir GLMM var: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Kullandığımda , araç paketinden veya drop1(model, test="Chi")kullandığımdan farklı sonuçlar alıyorum . Bu son ikisi aynı cevapları verir.Anova(model, type="III")summary(model) Bir grup uydurma veri kullanarak, bu iki yöntemin normalde farklı olmadığını gördüm. Dengeli doğrusal …

10 r  anova  glmm  r  mixed-model  bootstrap  sample-size  cross-validation  roc  auc  sampling  stratification  random-allocation  logistic  stata  interpretation  proportion  r  regression  multiple-regression  linear-model  lm  r  cross-validation  cart  rpart  logistic  generalized-linear-model  econometrics  experiment-design  causality  instrumental-variables  random-allocation  predictive-models  data-mining  estimation  contingency-tables  epidemiology  standard-deviation  mean  ancova  psychology  statistical-significance  cross-validation  synthetic-data  poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis  distributions  binomial  classification  k-means  distance  unsupervised-learning  euclidean  correlation  chi-squared  spearman-rho  forecasting  excel  exponential-smoothing  binomial  sample-size  r  change-point  wilcoxon-signed-rank  ranks  clustering  matlab  covariance  covariance-matrix  normal-distribution  simulation  random-generation  bivariate  standardization  confounding  z-statistic  forecasting  arima  minitab  poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion  probability  self-study  markov-process  estimation  maximum-likelihood  classification  pca  group-differences  chi-squared  survival  missing-data  contingency-tables  anova  proportion 

Durum: İki kuş (erkek ve dişi) yuvadaki yumurtalarını davetsiz misafirlere karşı korur. Her kuş koruma için saldırı veya tehdit kullanabilir ve mevcut veya yok olabilir. Verilerden ortaya çıkan, davranışın tamamlayıcı olabileceğine dair bir model vardır - kadın kullanım tehdidi sırasında erkek saldırıları ve bunun tersi. Sorum şu: Bu işbirliğini istatistiksel …

10 r  sequence-analysis