«r» etiketlenmiş sorular

İki zaman serisinin çapraz korelasyonundan (ccf fonksiyonu) elde edilen farklı gecikmelerdeki korelasyonların anlamlı olup olmadığını nasıl anlarsınız?

13 r  statistical-significance  cross-correlation 

Aşağıdaki gibi bir veri kümesine basit bir güç yasası modeli sığdırmaya çalışıyorum: mydf: rev weeks 17906.4 1 5303.72 2 2700.58 3 1696.77 4 947.53 5 362.03 6 Amaç, güç hattını geçmek ve revgelecek haftalara yönelik vlaueları tahmin etmek için kullanmaktır . Bir grup araştırma beni nlsşu şekilde uyguladığım işleve götürdü …

13 r  predictive-models  nonlinear-regression  power-law  nls 

Bu, Bootstrap'e benzer : tahmin, güven aralığının dışında Bir popülasyondaki genotiplerin sayısını temsil eden bazı verilerim var. Shannon dizinini kullanarak genetik çeşitliliği tahmin etmek ve ayrıca bootstrapping kullanarak bir güven aralığı oluşturmak istiyorum. Bununla birlikte, önyükleme yoluyla tahminin son derece önyargılı olduğunu ve gözlemlediğim istatistik dışında kalan bir güven aralığıyla …

13 r  confidence-interval  bootstrap  bias  diversity 

R'deki doğrusal karışık efekt modellemesini kullanarak bazı verileri analiz ediyorum. Sonuçlarla bir poster yapmayı planlıyorum ve sadece karışık efekt modelleri ile deneyimli herhangi bir kişinin, sonuçları göstermek için hangi grafikleri kullanacağını önerebileceğini merak ediyorum modeli. Kalan arsalar, orijinal değerlere karşı uygun değerlerin arsalarını vb. Düşünüyordum. Bunun verilerime çok bağlı olacağını …

13 r  data-visualization  mixed-model 

Glm formülünde bir faktör değişkeni (örn. M ve F seviyeli cinsiyet) kullanılırsa, kukla değişkenler oluşturulur ve glm modeli özetinde ilişkili katsayılarıyla (örn. Cinsiyet C) bulunabilir. Faktörü bu şekilde bölmek için R'ye güvenmek yerine, faktör bir dizi sayısal 0/1 değişkeni (örneğin, cinsiyetM (M için 1, F için 0), cinsiyetF (F için …

13 r  generalized-linear-model  categorical-data  categorical-encoding 

Zamana bağlı Cox modelinde temel tehlike işlevini tahmin etmem gerekiyorλ0( t )λ0(t)\lambda_0(t) λ ( t ) = λ0( t ) exp( Z( t )'β)λ(t)=λ0(t)exp⁡(Z(t)′β)\lambda(t) = \lambda_0(t) \exp(Z(t)'\beta) Hayatta Kalma kursu alırken, Breslow tahmincisi bir adım fonksiyonu verdiği için birikimli tehlike fonksiyonunun ( ) doğrudan türevinin iyi bir tahminci olmayacağını hatırlıyorum …

13 r  survival  cox-model 

Bir doğrusal açıklayıcı değişken ile bağımlı değişken ile ikinci dereceden bir ilişkisi olan başka bir açıklayıcı değişken arasına iki yönlü etkileşimler yerleştirmekle ilgiliysem , hem ikinci dereceden bileşenle etkileşimi hem de doğrusal ile etkileşimi dahil etmek zorunda kalırdım bileşen? Örn: Sırayla önceki iş parçacığı üzerinde bina: Eğrilik terimleri ve model …

13 r  regression  model-selection 

R'de, bir set.seed () ayarlayıp sonra bir listeyi rasgele seçmek için örnek işlevini kullanırsam, aynı permütasyonu üretmeyeceğimi garanti edebilir miyim? yani ... set.seed(25) limit <- 3 myindex <- seq(0,limit) for (x in seq(1,factorial(limit))) { permutations <- sample(myindex) print(permutations) } Bu üretir [1] 1 2 0 3 [1] 0 2 1 …

13 r  sampling  combinatorics  resampling 

Bu yeni bir soru ise özür dilerim; Kendime ilk kez istatistik öğretmeye çalışıyorum. Sanırım temel prosedürüm var, ama R ile yürütmek için mücadele ediyorum. Bu yüzden, çoklu doğrusal form regresyonunda regresyon katsayılarının önemini değerlendirmeye çalışıyorum y^=Xβ^y^=Xβ^ \hat y = X \hat \beta Ben test etmek için t-istatistik düşünüyorum verilirH0:β^j=0,Ha:β^j≠0H0:β^j=0,Ha:β^j≠0H_0: \hat …

13 r  statistical-significance  multiple-regression 

Şuna benzeyen verilerim var: Üzerine normal dağılım (çekirdek yoğunluğu tahmini daha iyi çalışır, ancak böyle büyük bir hassasiyete ihtiyacım yok) uygulamaya çalıştım ve oldukça iyi çalışıyor. Yoğunluk grafiği bir elips yapar. Bir noktanın elips bölgesinde olup olmadığına karar vermek için bu elips işlevini almam gerekiyor. Bu nasıl yapılır? R veya …

13 r  regression  pdf  bivariate 

Umarım bu forumlardaki biri gen ekspresyon çalışmalarındaki bu temel problemde bana yardımcı olabilir. Deneysel ve kontrol dokusunun derin dizilimini yaptım. Daha sonra kontrol üzerindeki deney numunesinde genlerin kat zenginleştirme değerlerini elde ettim. Referans genomun ~ 15.000 geni vardır. İlgilenen numunemde 15.000 genin 3.000'i kontrole kıyasla belirli bir kesimin üzerinde zenginleştirildi. …

13 r  genetics  bioinformatics  microarray  biostatistics 

RandomForestR paketini kullanıyorum ve Y ekseni değerlerini kısmi bağımlılık grafiklerinde nasıl yorumlayacağım konusunda kafam karıştı. Yardım belgeleri, planın "bir değişkenin sınıf olasılığı üzerindeki marjinal etkisinin grafiksel bir tasviri" olduğunu belirtir. Ancak, hala y ekseninin tam olarak neyi temsil ettiği konusunda kafam karıştı. Özellikle, negatif değerler ne anlama geliyor? Sınıfı doğru …

13 r  interpretation  random-forest  partial-plot 

Ben nls () çıktısını yorumlamaya çalışıyorum. Bunu okudum yazıyı ama hala en uygun seçim nasıl anlamıyorum. Benim uyar iki çıktı var: > summary(m) Formula: y ~ I(a * x^b) Parameters: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) a 479.92903 62.96371 7.622 0.000618 *** b 0.27553 0.04534 6.077 0.001744 ** --- Signif. …

12 r  least-squares  nonlinear-regression  goodness-of-fit 

Yakın tarihli bir makalede Norton ve ark. (2018) [ 1 ] şunu belirtir:[ 1 ][1]^{[1]} Olasılık oranı tahminleriyle sonuçlanan istatistiksel modeller farklı açıklayıcı değişkenlere sahip olduğu için aynı çalışmadaki farklı olasılık oranları karşılaştırılamaz, çünkü her model farklı bir rasgele ölçeklendirme faktörüne sahiptir. Bir çalışmadaki oran oranının büyüklüğü, başka bir çalışmadan …

12 r  logistic  meta-analysis  odds-ratio  adjustment 

Mensa Uluslararası Facebook Sayfasına aşağıdaki sorun gönderildi: \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad Gönderinin kendisi 1000+ yorum aldı, ancak Bertrand'ın kutu paradoksu olduğunu ve cevabın 2 olduğunu bildiğim için orada tartışma hakkında ayrıntılara girmeyeceğim. . Beni burada ilgilendiren şey Monte Carlo yaklaşımını kullanarak bu soruna nasıl cevap veriyor? Bu sorunu çözmek için algoritma nasıl?2323\frac23 İşte …

12 r  probability  simulation  monte-carlo  paradox