«mixed-model» etiketlenmiş sorular

R 'de lme4 paketini kullanarak karışık efektler modelleme bakıyordum. Öncelikle lmerkomutu kullanıyorum, bu yüzden bu sözdizimini kullanan kod aracılığıyla sorumu ortaya koyacağım . Genel olarak kolay bir soru olabilir lmer, aynı veri kümelerine dayalı olabilirlik oranlarını kullanarak oluşturulmuş herhangi iki modeli karşılaştırmak uygun mudur? Bunun cevabının "hayır" olması gerektiğine inanıyorum, …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Çoklu impütasyonun (MI) mantığı, eksik değerleri bir kez değil birkaç kez (tipik olarak M = 5) katlanarak M tamamlanmış veri kümelerine neden olur. Daha sonra M tamamlanmış veri kümeleri, M tahminlerinin ve standart hatalarının, "genel" tahmin ve standart hatasını elde etmek için Rubin formülleri kullanılarak birleştirildiği tam veri yöntemleriyle analiz …

20 modeling  confidence-interval  mixed-model  data-imputation 

Hassasiyet şu şekilde tanımlanır: p = true positives / (true positives + false positives) Gibi, bu doğru mu true positivesve false positiveshassas 1 yaklaşır yaklaşım 0? Hatırlama için aynı soru: r = true positives / (true positives + false negatives) Şu anda bu değerleri hesaplamam gereken bir istatistiksel test uyguluyorum …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Eşleştirilmiş bir t -testinin, R'de nlme paketiyle gösterilebilen lineer karışık etkili modelin yanı sıra tek yönlü tekrarlanan ölçümlerin (veya öznenin içinde) özel bir örneği olduğunu biliyoruz. Aşağıda gösterildiği gibi. #response data from 10 subjects under two conditions x1<-rnorm(10) x2<-1+rnorm(10) # Now create a dataframe for lme myDat <- data.frame(c(x1,x2), c(rep("x1", …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Özne tasarımında iki yönlü aşağıdaki verileri göz önünde bulundurun: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 Jim Cued Neu …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Diyelim ki GLMM'lerimiz var mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Bu modeller olağan anlamda iç içe değildir: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) b <- glmer(y …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Diyelim ki zaman içinde bazı sayım verilerinin rastgele efektler modeli üzerinde çalışıyoruz ve bazı eğilimleri kontrol etmek istiyoruz. Normalde şöyle bir şey yaparsınız: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") ikinci dereceden bir şekil eklemek t. Bu ilişkiyi modellemek için LOESS daha pürüzsüz veya spline gibi daha karmaşık pürüzsüzleştirme teknikleri kullanmak …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Beni karışık modellerle harekete geçiren bir ayrım var ve merak ediyorum, biraz netlik kazanıp kazanamayacağımı merak ediyorum. Diyelim ki karışık bir sayım verisi modeliniz var. Sabit bir etki (A) ve zaman (T) için başka bir değişken olarak, "Site" değişkeni olarak gruplandırıldığını bildiğiniz bir değişken var. Anladığım kadarıyla: glmer(counts ~ A …

19 r  mixed-model  lme4-nlme 

Temel olarak merak ettiğim şey, farklı kovaryans yapılarının nasıl uygulandığı ve bu matrislerin içindeki değerlerin nasıl hesaplandığıdır. Lme () gibi işlevler, hangi yapıyı istediğimizi seçmemize izin verir, ancak nasıl hesaplandıklarını bilmek isterim. doğrusal karma efektleri düşünün .Y= Xβ+ Zu + ϵY=Xβ+Zu+εY=X\beta+Zu+\epsilon Burada ve ϵ d ∼ N ( 0 , …

19 mixed-model  random-effects-model  covariance  covariance-matrix 

Tekrarlanan önlemler ANOVA için sonuçları çoğaltmak lmeiçin nlmepaketten kullanmaya çalışıyorum aov. Bunu tek faktörlü tekrarlanan ölçümler deneyi ve denekler arasında bir faktör ve bir denek içi faktörü ile iki faktörlü bir deney için yaptım, ancak bunu iki faktörlü iki faktörlü bir deney için yapmakta sorun yaşıyorum - faktörler faktörleri. Aşağıda …

19 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Ben 0 ve 1 arasında bir oran olan bir yanıt değişkeni olan bir model üretmeye çalışıyorum, bu oldukça birkaç 0s ve 1s ama aynı zamanda birçok değer içerir. Beta regresyonu denemeyi düşünüyorum. R (betareg) için bulduğum paket sadece 0 ile 1 arasında değerlere izin veriyor, ancak 0 veya 1'i içermiyor. …

19 regression  mixed-model  beta-distribution  zero-inflation  beta-regression 

Lütfen bu verileri göz önünde bulundurun: dt.m <- structure(list(id = c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12), occasion = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, …

19 r  mixed-model  stata  lme4-nlme 

Bu soruya yanıt olarak , katılımcıları rastgele farklı kategorilerden resimlerle sunduğum tasarımımın tekrarlanan önlemler ANOVA kullanmam gereken bir örnek olup olmadığı konusunda, bunun yerine karışık bir model kullanmamın cevabını aldım. nedenlerimde iki tür bağımlılığım var: konular ve kategoriler için. Benim sorum şu: Bu tür tekrarlı ölçümler tasarımını yaparken bu şekilde …

19 anova  mixed-model  repeated-measures 

Bunun daha önce sorulup sorulmadığını bilmiyorum, ama bunun hakkında hiçbir şey bulamadım. Benim sorum, herhangi birinin karışık etkiler modelinde sabit ve rastgele faktörlerin her biri tarafından açıklanan varyans oranını nasıl elde edeceğini öğrenmek için iyi bir referans sağlayıp sağlayamayacağıdır.

19 mixed-model  variance 

Rulmanlarımı ANOVA ve REGRESSION eşdeğerlerine alma konusunda bu geçici (devam eden) denemeyi tamamlama konusunda yardım alabilir miyim? Bu iki yöntemin kavramlarını, isimlendirmesini ve sözdizimini uzlaştırmaya çalışıyorum. Bu sitede, örneğin şu veya bu gibi ortaklıklarıyla ilgili birçok yayın var , ancak kullanmaya başladığınızda hızlı bir "buradasınız" haritasına sahip olmak hala iyi. …

18 regression  anova  mixed-model