«multiple-comparisons» etiketlenmiş sorular

Yanlış keşif oranını kontrol etmek için tek bir veri setine dayanan deneylere çoklu hipotez testi için Benjamini Hochberg benzeri düzeltmeler uygulamamız gerektiğini biliyoruz, aksi takdirde pozitif sonuç veren tüm deneyler yanlış olabilir. Ama neden bu aynı prensibi, verilerin nereden geldiğine bakılmaksızın, zamanın başından beri tüm deneylere uygulamıyoruz. Sonuçta, yayınlanmış bilimsel …

24 hypothesis-testing  multiple-comparisons  bonferroni  false-discovery-rate 

Pek çok testten p değerlerine sahibim ve çoklu test için düzeltmelerden sonra gerçekten önemli bir şeyin olup olmadığını bilmek istiyorum. Komplikasyon: Testlerim bağımsız değil. Düşündüğüm yöntem (Fisher'in Ürün Metodunun bir çeşidi, Zaykin ve diğerleri, Genet Epidemiol , 2002), p değerleri arasındaki korelasyona ihtiyaç duyuyor. Bu korelasyonu tahmin etmek için şu …

24 correlation  multiple-comparisons  statistical-significance  genetics 

Aşağıdaki makaleyi okudum: Perneger (1998) Bonferroni ayarlarında yanlış olan ne ? Yazar Bonferroni düzeltmesinin en iyi ihtimalle biyomedikal araştırmalarda sınırlı uygulamalara sahip olduğunu ve belirli hipotezlerle ilgili kanıtların değerlendirilmesinde kullanılmaması gerektiğini söyleyerek özetledi: Özet noktaları: Çalışma verilerinde yapılan testlerin sayısının istatistiksel olarak anlamlı hale getirilmesi - Bonferroni yöntemi - çözdüğünden …

23 hypothesis-testing  multiple-comparisons  bonferroni 

Bitki örtüsü kapağındaki farklılıkları büyüme formundaki gruplarda (ağaçlar, çalılar, bitkiler vb.) Kontrolle yapılan üç işlemden önce ve sonra incelemek için kullanıyorum. Örneklem büyüklüğüm küçük (n = 5) ve dağıtımlarımın çoğu normalde dağılmıyor. Normal dağılımlar için, tedavi sonuçları arasındaki farkları (değişim yüzdesi) analiz etmek için ANOVA kullandım, sonra sonuç çiftleri arasındaki …

23 multiple-comparisons  nonparametric  tukey-hsd 

Andrew Gelman, Bayesian AB testinin neden birden fazla hipotez düzeltmesi gerektirmediğine dair kapsamlı bir makale yazdı: Neden (Genellikle) Birden Çok Karşılaştırma Hakkında Endişelenmek Gerekmiyor , 2012. Tam anlamıyorum: neden Bayesian yöntemleri çoklu test düzeltmeleri gerektirmiyor? A ~ Distribution1 + Common Distribution B ~ Distribution2 + Common Distribution C ~ Distribution3 …

22 hypothesis-testing  bayesian  multiple-comparisons 

Ben yapıyorum aynı boş hipotezi ile bağımsız istatistiksel testler ve bir içine sonuçlarını birleştirmek istiyoruz -değeri. İki "kabul edilmiş" yöntem varmış gibi görünüyor: Fisher yöntemi ve Stouffer yöntemi .pN-NNppp Benim sorum Stouffer'ın yöntemi hakkında. Her ayrı test için, bir z-puanı elde . Boş bir hipotez altında, her biri standart bir …

22 hypothesis-testing  chi-squared  p-value  multiple-comparisons  combining-p-values 

İki grup üzerinde deneyler yaptığımızda (küçük örneklem büyüklüklerinde (genellikle her tedavi grubu için örnek büyüklüğü yaklaşık 7 ~ 8'dir)), farklılığı test etmek için bir t-testi kullanırız. Bununla birlikte, bir ANOVA yaptığımız zaman (açıkça ikiden fazla grup için), Bonferroni (LSD / # ikili karşılaştırmalar) ya da Tukey'nin sıraları boyunca bir şey …

22 anova  multiple-comparisons  post-hoc  bonferroni  fishers-lsd 

Bonferroni ayarının ne zaman kullanılacağıyla ilgili iki sorum var: Tüm çoklu test durumlarında Bonferroni ayarlarının kullanılması uygun mudur? Eğer biri bir veri setinde bir test yaparsa, o zaman bu veri setini daha ince seviyelere böler (örn. Verileri cinsiyete göre ayırır) ve aynı testleri gerçekleştirir, bu algılanan bireysel testlerin sayısını nasıl …

21 multiple-comparisons  bonferroni  type-i-and-ii-errors 

Temel bileşen analizi (PCA) yaptıktan sonra, PCA alanına yeni bir vektör yansıtmak istiyorum (yani PCA koordinat sistemindeki koordinatlarını bulmak). PCA'yı R dilinde kullanarak hesapladım prcomp. Şimdi vektörümü PCA dönme matrisi ile çarpabilmeliyim. Bu matristeki temel bileşenler satır veya sütunlar halinde mi düzenlenmelidir?

21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 

15'ten fazla 2x2 Chi Square testi yapan bir makaleyi inceliyorum. Birden fazla karşılaştırma için düzeltmeleri gerektiğini önerdim, ancak tüm karşılaştırmaların planlandığını söyleyerek cevap verdiler ve bu nedenle bu gerekli değil. Bunun doğru olmaması gerektiğini, ancak durumun bu olup olmadığını açıkça belirten herhangi bir kaynak bulamadığını düşünüyorum. Herkes bu konuda yardımcı …

20 hypothesis-testing  multiple-comparisons 

Birçok regresyon modeli spesifikasyonunun (örneğin, OLS'de) bir veri kümesi için olasılıklar olarak kabul edildiğinde, bunun çoklu karşılaştırma sorunlarına neden olduğunu ve p-değerleri ve güven aralıklarının artık güvenilir olmadığını duydum. Bunun en uç örneklerinden biri aşamalı regresyon. Modelin belirlenmesine yardımcı olması için verinin kendisini ne zaman kullanabilirim ve bu ne zaman …

20 regression  frequentist  multiple-comparisons 

Denek içi testler için post-hocs yapmak için tercih edilen yöntem nedir? Tukey'in HSD'sinin kullanıldığı yayınlanmış çalışmaları gördüm, ancak Keppel ve Maxwell & Delaney'nin bir incelemesi, bu tasarımlardaki sferikliğin olası ihlallerinin hata terimini yanlış ve bu yaklaşımı sorunlu hale getirdiğini gösteriyor. Maxwell ve Delaney, kitaplarındaki soruna bir yaklaşım sağlar, ancak herhangi …

20 r  repeated-measures  multiple-comparisons  post-hoc  sphericity 

David Colquhoun'un bu büyük makalesini okudum: Yanlış keşif oranı ve p değerlerinin yanlış yorumlanması üzerine bir araştırma (2014). Özünde, ile tip I hatası kontrol etsek de yanlış keşif oranının (FDR) neden kadar yüksek olabileceğini açıklıyor .30%30%30\%α=0.05α=0.05\alpha=0.05 Bununla birlikte, çoklu test durumunda FDR kontrolünü uygularsam ne olacağı konusunda hala kafam karıştı. …

19 hypothesis-testing  statistical-significance  p-value  multiple-comparisons  false-discovery-rate 

Benjamini-Hochberg çoklu test düzeltmesi toplam karşılaştırma sayısına göre ne kadar muhafazakar? Örneğin, iki grup için 18.000 özellik listem varsa ve p değeri almak için bir Wilcoxon testi gerçekleştirirsem. Bu p değerini Benjamini-Hochberg kullanarak ayarlıyorum ve hiçbir şeyin yanında önemli değil. Karşılaştırmaların sayısı arttıkça Bonferroni düzeltmesinin oldukça muhafazakar olabileceğini biliyorum, Benjamini-Hochberg …

19 multiple-comparisons  p-value 

SPSS (3.Basım) Kullanarak Alanı Keşfetme İstatistikleri ANOVA'da post-hoc testlerden biraz etkilenmiştim. Tip I hata oranını kontrol etmek isteyenler için Bonferroni veya Tukey'i önerir ve şöyle der (s. 374): Bonferroni, karşılaştırma sayısı az olduğunda daha fazla güce sahipken, Tukey çok sayıda aracı test ederken daha güçlüdür. Az ve çok sayıda araç …

19 anova  multiple-comparisons  post-hoc  bonferroni  tukey-hsd