«bugs» etiketlenmiş sorular

Bayesian modellerini tahmin etmek için bir BUGS tarzı ortamı denemek üzereyim. OpenBugs veya JAGS arasında seçim yaparken göz önünde bulundurulması gereken önemli avantajlar var mı? Öngörülebilir bir gelecekte biri diğerinin yerini alacak mı? Seçilen Gibbs Sampler'ı R ile kullanacağım. Henüz belirli bir uygulamam yok, ama hangisini tutacağım ve öğreneceğime karar …

41 r  software  bugs  jags  gibbs 

BUGS ve R'nin farklı parametrelere sahip olduğu bazı dağıtımlar buldum: Normal, log-Normal ve Weibull. Bunların her biri için, R tarafından kullanılan ikinci parametrenin BUGS'de (veya benim durumumda JAGS) kullanılmadan önce ters dönüştürülmesinin (1 / parametre) olması gerektiğini biliyorum. Halen var olan bu dönüşümlerin kapsamlı bir listesini bilen var mı? Bulduğum …

31 r  distributions  bugs  jags  parameterization 

Sorunumu bir örnekle açıklayacağım. Bazı nitelikler verilen bir bireyin gelirini tahmin etmek istediğinizi varsayalım: {Yaş, Cinsiyet, Ülke, Bölge, Şehir}. Bunun gibi bir eğitim veri setine sahipsiniz train <- data.frame(CountryID=c(1,1,1,1, 2,2,2,2, 3,3,3,3), RegionID=c(1,1,1,2, 3,3,4,4, 5,5,5,5), CityID=c(1,1,2,3, 4,5,6,6, 7,7,7,8), Age=c(23,48,62,63, 25,41,45,19, 37,41,31,50), Gender=factor(c("M","F","M","F", "M","F","M","F", "F","F","F","M")), Income=c(31,42,71,65, 50,51,101,38, 47,50,55,23)) train CountryID RegionID CityID …

29 regression  machine-learning  multilevel-analysis  correlation  dataset  spatial  paired-comparisons  cross-correlation  clustering  aic  bic  dependent-variable  k-means  mean  standard-error  measurement-error  errors-in-variables  regression  multiple-regression  pca  linear-model  dimensionality-reduction  machine-learning  neural-networks  deep-learning  conv-neural-network  computer-vision  clustering  spss  r  weighted-data  wilcoxon-signed-rank  bayesian  hierarchical-bayesian  bugs  stan  distributions  categorical-data  variance  ecology  r  survival  regression  r-squared  descriptive-statistics  cross-section  maximum-likelihood  factor-analysis  likert  r  multiple-imputation  propensity-scores  distributions  t-test  logit  probit  z-test  confidence-interval  poisson-distribution  deep-learning  conv-neural-network  residual-networks  r  survey  wilcoxon-mann-whitney  ranking  kruskal-wallis  bias  loss-functions  frequentist  decision-theory  risk  machine-learning  distributions  normal-distribution  multivariate-analysis  inference  dataset  factor-analysis  survey  multilevel-analysis  clinical-trials 

Merhaba istatistiksel gurular ve R programlama sihirbazları, Hayvan yakalamalarını çevresel koşulların ve yılın gününün bir fonksiyonu olarak modellemekle ilgileniyorum. Başka bir çalışmanın parçası olarak, üç yıl içinde ~ 160 gün boyunca yakalama sayım var. Bu günlerin her birinde sıcaklık, yağış, rüzgar hızı, bağıl nem vb. Var. Veriler aynı 5 parselden …

16 r  mixed-model  autocorrelation  bugs  panel-data 

Bayesci Çıkarım yapmak için hangi yazılım istatistik paketini önereceğinizi merak ediyordum. Örneğin, openBUGS veya winBUGS'yi bağımsız olarak çalıştırabileceğinizi veya bunları R'den de çağırabileceğinizi biliyorum. Ancak R'nin bayes analizi yapabilen kendi paketleri (MCMCPack, BACCO) da var. Herkesin R'deki hangi bayes istatistik paketinin en iyi olduğu veya diğer alternatifler (Matlab veya Mathematica) …

14 r  probability  bayesian  inference  bugs 

Kapalı. Bu soru konu dışı . Şu anda cevapları kabul etmiyor. Bu soruyu geliştirmek ister misiniz? Sorunuzu güncelleyin o yüzden -konu üzerinde Çapraz doğrulanmış için. Geçen yıl kapalı . HATA ve R kullanarak Bayes istatistikleri üzerine bir kurs takip ediyorum. Şimdi, HATA zaten biliyorum, harika ama sadece R yerine ayrı …

13 r  bayesian  bugs 

Verilerdeki gizli durumların sayısını tahmin etmek için bir Gizli Markov Modeli (HMM) sığdırmaya çalıştığım bir zaman serisi veri var. Bunu yapmak için sahte kodum şudur: for( i in 2 : max_number_of_states ){ ... calculate HMM with i states ... optimal_number_of_states = "model with smallest BIC" ... } Şimdi, her zamanki …

12 r  aic  hidden-markov-model  bic  spss  manova  time-series  r  lme4-nlme  regression  modeling  negative-binomial  bayesian  bugs  state-space-models  hypothesis-testing  data-transformation  factor-analysis  sem 

Tam koşullu koşulların türetilmesi genellikle zordur, ancak JAGS ve HATA gibi programlar otomatik olarak türetilir. Birisi herhangi bir keyfi model belirtimi için algoritmik olarak tam koşulların nasıl oluşturulduğunu açıklayabilir mi?

11 bayesian  conditional-probability  jags  bugs  gibbs 

Burada , ağırlık parametresi aracılığıyla Rbir glmgerilemeyi "önceden ağırlıklandırabiliriz" . Örneğin: glm.D93 <- glm(counts ~ outcome + treatment, family = poisson(), weights=w) Bu bir JAGSveya BUGSmodelde nasıl yapılabilir ? Bunu tartışan bazı makaleler buldum, ancak hiçbiri bir örnek vermiyor. Esas olarak Poisson ve lojistik regresyon örnekleriyle ilgileniyorum.

10 bayesian  generalized-linear-model  jags  bugs  weighted-regression 

Yanıtın bir oran olduğu bir model oluşturmaya çalışıyorum (aslında bir partinin seçim bölgelerinde aldığı oyların payıdır). Dağıtımı normal değil, bu yüzden bir beta dağıtımı ile modellemeye karar verdim. Ayrıca birkaç tahmin edicim var. Ancak, HATA / JAGS / STAN'da nasıl yazacağımı bilmiyorum (JAGS benim en iyi seçimim olurdu, ama gerçekten …

10 bayesian  jags  bugs  beta-regression  stan 

R'de ayrık zamanlı bir model yerleştirmeye çalışıyorum, ancak nasıl yapılacağından emin değilim. Bağımlı değişkeni farklı satırlarda, her bir zaman gözlemi için bir tane düzenleyebileceğinizi ve glmbir logit veya cloglog bağlantısıyla işlevi kullanabileceğinizi okudum. Bu anlamda, üç sütun vardır: ID, Event(her zaman atıl 1 ya da 0) ve Time Elapsedek olarak, …

10 r  survival  pca  sas  matlab  neural-networks  r  logistic  spatial  spatial-interaction-model  r  time-series  econometrics  var  statistical-significance  t-test  cross-validation  sample-size  r  regression  optimization  least-squares  constrained-regression  nonparametric  ordinal-data  wilcoxon-signed-rank  references  neural-networks  jags  bugs  hierarchical-bayesian  gaussian-mixture  r  regression  svm  predictive-models  libsvm  scikit-learn  probability  self-study  stata  sample-size  spss  wilcoxon-mann-whitney  survey  ordinal-data  likert  group-differences  r  regression  anova  mathematical-statistics  normal-distribution  random-generation  truncation  repeated-measures  variance  variability  distributions  random-generation  uniform  regression  r  generalized-linear-model  goodness-of-fit  data-visualization  r  time-series  arima  autoregressive  confidence-interval  r  time-series  arima  autocorrelation  seasonality  hypothesis-testing  bayesian  frequentist  uninformative-prior  correlation  matlab  cross-correlation 

Parametre dağılımı hakkında bir fikriniz yoksa ne olur? Hangi yaklaşımı kullanmalıyız? Çoğu zaman, belirli bir değişkenin belirli bir türün varlığı / yokluğu üzerinde herhangi bir etkisi olup olmadığını ve değişkenin değişken önemine göre kabul edilip edilmediğini anlamayı hedefleriz. Bu, çoğu zaman, bir parametrenin olması gereken hızlı dağıtım üzerinde düşünmediğimiz anlamına …

10 r  bayesian  mcmc  bugs  winbugs 

Yeni bir WinBUGS kullanıcısıyım ve yardımınız için bir sorum var. Aşağıdaki kodu çalıştırdıktan sonra, (istatistik, yoğunluk) beta0üzerinden parametreleri var beta4, ama kod modellemek için hayarladığım son değerinin tahmin almak için nasıl bilmiyorum NA. Birisi bana bir ipucu verebilir mi? Herhangi bir tavsiye büyük mutluluk duyacağız. model { for(i in 1: …

10 bayesian  bugs  prediction  winbugs 

Gelman & Hill (2006) diyor ki: Bugs'ta, bir regresyondaki eksik sonuçlar sadece veri vektörü, NA'lar ve hepsi dahil edilerek kolayca ele alınabilir. Hatalar, sonuç değişkenini açıkça modellemektedir ve bu nedenle, bu modeli, her yinelemede eksik değerleri etkilemek için kullanmak önemsizdir. Bu, tahmin yapmak için JAGS kullanmanın kolay bir yolu gibi …

10 missing-data  bugs  jags 

Kapalı. Bu soru konu dışı . Şu anda cevapları kabul etmiyor. Bu soruyu geliştirmek ister misiniz? Sorunuzu güncelleyin o yüzden -konu üzerinde Çapraz doğrulanmış için. 2 yıl önce kapalı . R , R2WinBUGS :: bugs ve R2jags: jags işlevleri tarafından oluşturulan nesnelerden bugsve jagsnesnelerden güzel özet grafikler çıkarabiliyor gibi görünüyor …

9 r  data-visualization  jags  bugs