«negative-binomial» etiketlenmiş sorular

Temel bileşen analizi (PCA) yaptıktan sonra, PCA alanına yeni bir vektör yansıtmak istiyorum (yani PCA koordinat sistemindeki koordinatlarını bulmak). PCA'yı R dilinde kullanarak hesapladım prcomp. Şimdi vektörümü PCA dönme matrisi ile çarpabilmeliyim. Bu matristeki temel bileşenler satır veya sütunlar halinde mi düzenlenmelidir?

21 r  pca  r  variance  heteroscedasticity  misspecification  distributions  time-series  data-visualization  modeling  histogram  kolmogorov-smirnov  negative-binomial  likelihood-ratio  econometrics  panel-data  categorical-data  scales  survey  distributions  pdf  histogram  correlation  algorithms  r  gpu  parallel-computing  approximation  mean  median  references  sample-size  normality-assumption  central-limit-theorem  rule-of-thumb  confidence-interval  estimation  mixed-model  psychometrics  random-effects-model  hypothesis-testing  sample-size  dataset  large-data  regression  standard-deviation  variance  approximation  hypothesis-testing  variance  central-limit-theorem  kernel-trick  kernel-smoothing  error  sampling  hypothesis-testing  normality-assumption  philosophical  confidence-interval  modeling  model-selection  experiment-design  hypothesis-testing  statistical-significance  power  asymptotics  information-retrieval  anova  multiple-comparisons  ancova  classification  clustering  factor-analysis  psychometrics  r  sampling  expectation-maximization  markov-process  r  data-visualization  correlation  regression  statistical-significance  degrees-of-freedom  experiment-design  r  regression  curve-fitting  change-point  loess  machine-learning  classification  self-study  monte-carlo  markov-process  references  mathematical-statistics  data-visualization  python  cart  boosting  regression  classification  robust  cart  survey  binomial  psychometrics  likert  psychology  asymptotics  multinomial 

Hassasiyet şu şekilde tanımlanır: p = true positives / (true positives + false positives) Gibi, bu doğru mu true positivesve false positiveshassas 1 yaklaşır yaklaşım 0? Hatırlama için aynı soru: r = true positives / (true positives + false negatives) Şu anda bu değerleri hesaplamam gereken bir istatistiksel test uyguluyorum …

20 precision-recall  data-visualization  logarithm  references  r  networks  data-visualization  standard-deviation  probability  binomial  negative-binomial  r  categorical-data  aggregation  plyr  survival  python  regression  r  t-test  bayesian  logistic  data-transformation  confidence-interval  t-test  interpretation  distributions  data-visualization  pca  genetics  r  finance  maximum  probability  standard-deviation  probability  r  information-theory  references  computational-statistics  computing  references  engineering-statistics  t-test  hypothesis-testing  independence  definition  r  censoring  negative-binomial  poisson-distribution  variance  mixed-model  correlation  intraclass-correlation  aggregation  interpretation  effect-size  hypothesis-testing  goodness-of-fit  normality-assumption  small-sample  distributions  regression  normality-assumption  t-test  anova  confidence-interval  z-statistic  finance  hypothesis-testing  mean  model-selection  information-geometry  bayesian  frequentist  terminology  type-i-and-ii-errors  cross-validation  smoothing  splines  data-transformation  normality-assumption  variance-stabilizing  r  spss  stata  python  correlation  logistic  logit  link-function  regression  predictor  pca  factor-analysis  r  bayesian  maximum-likelihood  mcmc  conditional-probability  statistical-significance  chi-squared  proportion  estimation  error  shrinkage  application  steins-phenomenon 

Bazılarınız bu güzel makaleyi okumuş olabilir: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) Sayım verilerini günlüğe kaydetmeyin. Ekoloji ve Evrimde Yöntemler 1: 118-122. tıklayın . Araştırma alanımda (ekotoksikoloji) kötü çoğaltılmış deneylerle uğraşıyoruz ve GLM'ler yaygın olarak kullanılmıyor. Bu yüzden O'Hara & Kotze (2010) ile benzer bir simülasyon yaptım, ancak ekotoksikolojik verileri taklit …

18 r  generalized-linear-model  simulation  negative-binomial  type-i-and-ii-errors 

Bir skellam dağılımı Poisson dağılımına sahip iki değişken arasındaki farkı açıklar. Negatif binom dağılımlarını takip eden değişkenler arasındaki farkı tanımlayan benzer bir dağılım var mı? Verilerim bir Poisson süreci tarafından üretiliyor, ancak dağıtımda aşırı dağılmaya yol açan adil miktarda gürültü içeriyor. Bu nedenle, verilerin negatif binom (NB) dağılımı ile modellenmesi …

18 distributions  modeling  poisson-distribution  negative-binomial  skellam 

Sen ve ben sırayla bozuk para çeviren bir oyun oynamaya karar veriyoruz. Toplamda 10 kafa çeviren ilk oyuncu oyunu kazanır. Doğal olarak, önce kimin gitmesi gerektiği konusunda bir tartışma var. Bu oyunun simülasyonları, ilk çeviren oyuncunun ikinci çeviren oyuncudan% 6 daha fazla kazandığını göstermektedir (ilk oyuncu zamanın yaklaşık% 53'ünü kazanır). …

17 probability  python  binomial  negative-binomial 

Soru Negatif bir binom (NB) dağılımının varyansı her zaman ortalamasından daha büyüktür. Bir numunenin ortalaması varyansından daha büyük olduğunda, NB parametrelerini maksimum olasılıkla veya moment tahmini ile uydurmaya çalışmak başarısız olur (sonlu parametrelerle çözüm yoktur). Bununla birlikte, bir NB dağılımından alınan bir numunenin ortalama varyanstan daha büyük olması mümkündür. İşte …

17 estimation  maximum-likelihood  negative-binomial 

Sayım verilerinin aşağıdaki histogramına sahibim. Ve ona ayrık bir dağıtım yapmak istiyorum. Bu konuda nasıl ilerlemem gerektiğinden emin değilim. İlk önce histogramdaki ayrık bir dağılımı, yani Negatif Binom dağılımını üst üste koymalı mıyım, böylece ayrık dağılımın parametrelerini alıp p-değerlerini kontrol etmek için bir Kolmogorov-Smirnov testi yapmalıyım? Bu yöntemin doğru olup …

17 r  poisson-distribution  discrete-data  computational-statistics  negative-binomial 

R'de sıfır şişirilmiş negatif binom karışık etkiler model tahmini sağlayan böyle bir paket var mı? Bununla demek istediğim: Pscl paketindeki zeroinfl işlevinde olduğu gibi sıfır enflasyon için binom modelini belirtebileceğiniz sıfır enflasyon: zeroinfl (y ~ X | Z, dist = "negbin") burada Z sıfır enflasyon modelinin formülüdür; Modelin sayım kısmı …

17 r  mixed-model  count-data  negative-binomial  zero-inflation 

Negatif binom dağılımı biyoenformatikte sayım verileri için (özellikle belirli bir deneyden belirli bir genomun belirli bir bölgesinde okunan sıralı okuma sayısı) popüler bir model haline gelmiştir. Açıklamalar değişiklik gösterir: Bazıları bunu Poisson dağılımı gibi çalışan ancak ek bir parametreye sahip, gerçek dağılımı modellemek için daha fazla özgürlüğe izin veren ve …

16 poisson-distribution  negative-binomial  bioinformatics  sequence-analysis 

Poisson dağılımı birim zaman başına olayları ölçebilir ve parametre . Üstel dağılım, parametresi ile bir sonraki olaya kadar geçen süreyi ölçer . Olayları veya zamanları modellemenin daha kolay olmasına bağlı olarak, bir dağıtım diğerine dönüştürülebilir.λλ\lambda1λ1λ\frac{1}{\lambda} Şimdi, bir gama-poisson, daha büyük bir varyansa sahip "gerilmiş" bir zehirdir. Weibull dağılımı, daha büyük …

16 poisson-distribution  negative-binomial  gamma-distribution  exponential-family 

Sayım verileriyle hangi modelin kullanılacağına karar vermek için uygun strateji nedir? Ben çok düzeyli bir model olarak modellemek için gereken veri sayım var ve bunu (bu sitede) bunu yapmak için en iyi yolu böcek veya MCMCglmm olduğunu tavsiye edilmiştir. Ancak ben hala bayes istatistikleri hakkında bilgi edinmek için çalışıyorum, ve …

16 poisson-distribution  generalized-linear-model  negative-binomial  overdispersion 

Poisson model uyumunun artık sapmanın serbestlik derecelerine bölünmesini içeren aşırı dağılmış olup olmadığını kontrol etme tavsiyesini sık sık gördüm. Ortaya çıkan oran "yaklaşık 1" olmalıdır. Soru, "yaklaşık" için hangi aralıktan bahsediyoruz - alternatif model formlarını dikkate almak için alarmları ayarlaması gereken oran nedir?

16 poisson-distribution  negative-binomial  poisson-regression  overdispersion 

Her bir taraf 3 kez ortaya çıkana kadar bir kalıbı kaç kez atmanız gerekir? Bu soru Yeni Zelanda'daki ilkokulda sorulmuştur ve simülasyonlar kullanılarak çözülmüştür. Bu sorunun analitik çözümü nedir?

15 probability  multinomial  negative-binomial  coupon-collector-problem 

Bu nedenle, negatif binomial bir model rastgele etkiler koymak istiyorum. Böyle bir model için STATA üssel katsayılar üretebilir. Yardım dosyasına göre, bu katsayılar insidans oranı oranları olarak yorumlanabilir. Maalesef anadili İngilizce değilim ve insidans oranı oranlarının ne olduğunu veya bunları nasıl çevirebileceğimi gerçekten anlamıyorum. Benim sorum şu, insidans oranı oranlarını …

14 interpretation  negative-binomial  regression-coefficients 

Ben sadece negatif bir binom GLM koştu ve bu çıktı: Call: glm.nb(formula = small ~ method + site + depth, data = size.dat, init.theta = 1.080668549, link = log) Deviance Residuals: Min 1Q Median 3Q Max -2.2452 -0.9973 -0.3028 0.3864 1.8727 Coefficients: Estimate Std. Error z value Pr(>|z|) (Intercept) 1.6954 …

14 r  categorical-data  generalized-linear-model  interpretation  negative-binomial