«mixed-model» etiketlenmiş sorular

İçtenlikle bu soruyu tam olarak cevaplanabilecek şekilde ifade ettiğimi umuyorum - eğer değilse, lütfen bana bildirin ve tekrar deneyeceğim! Ayrıca bu analizler için R kullanacağımı da not etmeliyim. Benim plant performance (Ys)uyguladığım dört tedaviden etkilendiğini düşündüğüm birkaç önlemim var - flower thinning (X1), fertilization (X2), leaf clipping (X3)ve biased flower …

10 hypothesis-testing  mixed-model  interaction  nonlinear  regression-strategies 

Ben kullanarak bazı davranışsal verilerin analiz ediyorum lme4yılında Rçoğunlukla ardından Bodo Kış mükemmel öğreticiler , ama düzgün etkileşimleri hallediyorum ben anlamıyorum. Daha kötüsü, bu araştırmaya dahil olan hiç kimse karışık modeller kullanmaz, bu yüzden işlerin doğru olduğundan emin olmak konusunda biraz şaşırıyorum. Sadece yardım için bir çığlık atmak yerine, sorunu …

10 r  mixed-model  p-value  lme4-nlme 

Rastgele-etkiler için varsayılan varyans-kovaryans yapısı nedir glmerya lmeriçinde lme4paketin? Koddaki rastgele etkiler için diğer varyans-kovaryans yapısı nasıl belirtilir? Bununla ilgili herhangi bir bilgiyi lme4dokümantasyonda bulamadım .

10 mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Bu soru / konu bir meslektaşı ile bir tartışma geldi ve ben bu konuda bazı fikirler arıyordum: Bazı verileri rastgele etkiler lojistik regresyonu, daha kesin olarak rastgele bir kesme lojistik regresyonu kullanarak modelleniyorum. Sabit etkiler için ilgi çekici ve dikkate alınan 9 değişkenim var. Önemli değişkenleri bulmak ve “en iyi” …

10 mixed-model  model-selection  aic  glmm  stepwise-regression 

Ben böyle modeller var: require(nlme) set.seed(123) n <- 100 k <- 5 cat <- as.factor(rep(1:k, n)) cat_i <- 1:k # intercept per kategorie x <- rep(1:n, each = k) sigma <- 0.2 alpha <- 0.001 y <- cat_i[cat] + alpha * x + rnorm(n*k, 0, sigma) plot(x, y) m1 <- …

10 r  mixed-model  aic 

Bu sadece birkaç kez karşılaştığım bir örnektir, bu yüzden örnek verilerim yok. R'de doğrusal regresyon modeli çalıştırmak: a.lm = lm(Y ~ x1 + x2) x1sürekli bir değişkendir. x2kategoriktir ve üç değeri vardır, örneğin "Düşük", "Orta" ve "Yüksek". Bununla birlikte, R tarafından verilen çıktı aşağıdaki gibi olacaktır: summary(a.lm) Estimate Std. Error …

10 r  regression  categorical-data  regression-coefficients  categorical-encoding  machine-learning  random-forest  anova  spss  r  self-study  bootstrap  monte-carlo  r  multiple-regression  partitioning  neural-networks  normalization  machine-learning  svm  kernel-trick  self-study  survival  cox-model  repeated-measures  survey  likert  correlation  variance  sampling  meta-analysis  anova  independence  sample  assumptions  bayesian  covariance  r  regression  time-series  mathematical-statistics  graphical-model  machine-learning  linear-model  kernel-trick  linear-algebra  self-study  moments  function  correlation  spss  probability  confidence-interval  sampling  mean  population  r  generalized-linear-model  prediction  offset  data-visualization  clustering  sas  cart  binning  sas  logistic  causality  regression  self-study  standard-error  r  distributions  r  regression  time-series  multiple-regression  python  chi-squared  independence  sample  clustering  data-mining  rapidminer  probability  stochastic-processes  clustering  binary-data  dimensionality-reduction  svd  correspondence-analysis  data-visualization  excel  c#  hypothesis-testing  econometrics  survey  rating  composite  regression  least-squares  mcmc  markov-process  kullback-leibler  convergence  predictive-models  r  regression  anova  confidence-interval  survival  cox-model  hazard  normal-distribution  autoregressive  mixed-model  r  mixed-model  sas  hypothesis-testing  mediation  interaction 

Tekrarlanan ikili sonuçları kullanarak bir olay analizi ile uğraşmaya çalışıyorum. Etkinlik zamanının gün cinsinden ölçüldüğünü, ancak şu an için süreyi haftalara ayırdık. Tekrarlanan ikili sonuçları kullanarak bir Kaplan-Meier tahmincisine yaklaşmak istiyorum (fakat ortak değişkenlere izin vermek). Bu, dolambaçlı bir yol gibi görünecek, ancak bunun sıradan sonuçlara ve tekrarlayan olaylara nasıl …

9 mixed-model  survival  random-effects-model  recurrent-events 

Karmaşık maksimal karışık modellerle (verilen veri ve model için olası tüm rastgele etkileri tahmin etmek) uğraşırken nadir görülen bir durum mükemmel değildir (+1 veya -1) veya bazı rastgele etkiler arasında neredeyse mükemmel bir korelasyon. Tartışma amacıyla aşağıdaki model ve model özetini inceleyelim Model: Y ~ X*Cond + (X*Cond|subj) # Y …

9 r  correlation  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

Örnekler: İş tanımında bir cümle var: "İngiltere'de Java kıdemli mühendisi". Derin bir öğrenme modelini 2 kategori olarak tahmin etmek istiyorum: English ve IT jobs. Geleneksel sınıflandırma modeli kullanırsam, sadece softmaxson katmanda işlevli 1 etiket tahmin edebilir . Bu nedenle, her iki kategoride "Evet" / "Hayır" ı tahmin etmek için 2 …

9 machine-learning  deep-learning  natural-language  tensorflow  sampling  distance  non-independent  application  regression  machine-learning  logistic  mixed-model  control-group  crossover  r  multivariate-analysis  ecology  procrustes-analysis  vegan  regression  hypothesis-testing  interpretation  chi-squared  bootstrap  r  bioinformatics  bayesian  exponential  beta-distribution  bernoulli-distribution  conjugate-prior  distributions  bayesian  prior  beta-distribution  covariance  naive-bayes  smoothing  laplace-smoothing  distributions  data-visualization  regression  probit  penalized  estimation  unbiased-estimator  fisher-information  unbalanced-classes  bayesian  model-selection  aic  multiple-regression  cross-validation  regression-coefficients  nonlinear-regression  standardization  naive-bayes  trend  machine-learning  clustering  unsupervised-learning  wilcoxon-mann-whitney  z-score  econometrics  generalized-moments  method-of-moments  machine-learning  conv-neural-network  image-processing  ocr  machine-learning  neural-networks  conv-neural-network  tensorflow  r  logistic  scoring-rules  probability  self-study  pdf  cdf  classification  svm  resampling  forecasting  rms  volatility-forecasting  diebold-mariano  neural-networks  prediction-interval  uncertainty 

Boylamsal bir çalışmada, birimlerinin sonuçları toplam sabit ölçüm olayı ile zaman noktalarında tekrar tekrar (sabit = birimler üzerindeki ölçümler aynı anda alınır).Yben tYbentY_{it}benbenitttmmm Birimler rastgele bir tedaviye, veya bir kontrol grubuna, atanır . Tedavinin ortalama etkisini tahmin etmek ve test etmek istiyorum, yani beklentilerin zaman ve bireyler arasında alındığı. Bu …

9 mixed-model  panel-data  multilevel-analysis  random-effects-model  fixed-effects-model 

R paketine bir glmermodel lme4takıyorum. Burada gösterilen p değeri olan bir anova tablosu arıyorum, ama ona uyan herhangi bir paket bulamıyorum. R ile yapmak mümkün mü? Uyduğum model şu şekildedir: model1<-glmer(dmn~period*teethTreated+(1|fullName), family="poisson", data=subset(dataset, group=='Four times a year'), control=glmerControl(optimizer="bobyqa"))

9 r  anova  lme4-nlme  mixed-model 

Ben belirli bir grup birey (3 grup var) için değişken logInd Yılın etkisi analiz etmeye çalışıyorum. En basit model: > fix1 = lm(logInd ~ 0 + Group + Year:Group, data = mydata) > summary(fix1) Call: lm(formula = logInd ~ 0 + Group + Year:Group, data = mydata) Residuals: Min 1Q …

9 r  mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model 

Bu makaleden aşağıdaki greftler alınmıştır . Ben bootstrap için acemi ve R bootpaket ile doğrusal karışık model için parametrik, yarı parametrik ve parametrik olmayan bootstrapping bootstrapping uygulamaya çalışıyorum . R Kodu İşte benim Rkod: library(SASmixed) library(lme4) library(boot) fm1Cult <- lmer(drywt ~ Inoc + Cult + (1|Block) + (1|Cult), data=Cultivation) fixef(fm1Cult) …

9 r  mixed-model  bootstrap  central-limit-theorem  stable-distribution  time-series  hypothesis-testing  markov-process  r  correlation  categorical-data  association-measure  meta-analysis  r  anova  confidence-interval  lm  r  bayesian  multilevel-analysis  logit  regression  logistic  least-squares  eda  regression  notation  distributions  random-variable  expected-value  distributions  markov-process  hidden-markov-model  r  variance  group-differences  microarray  r  descriptive-statistics  machine-learning  references  r  regression  r  categorical-data  random-forest  data-transformation  data-visualization  interactive-visualization  binomial  beta-distribution  time-series  forecasting  logistic  arima  beta-regression  r  time-series  seasonality  large-data  unevenly-spaced-time-series  correlation  statistical-significance  normalization  population  group-differences  demography 

Şu anda sayıların nasıl elde edildiğindeki (bir tanı testinden diğerine geçme) bir değişimin zaman içindeki diğer eğilimleri kontrol ederken ( hastalık insidansı). Birkaç farklı siteye ilişkin verilerim var. Ben de GAM'larla uğraşırken, zaman eğilimleri olan bir dizi oldukça basit GLM'ye uyuyorum, ardından sonuçları bir araya getiriyorum. Bunun kodu SAS'ta şöyle …

9 mixed-model  generalized-linear-model  poisson-distribution  random-effects-model 

Analiz etmek için oldukça karmaşık bir veri setim var ve bunun için iyi bir çözüm bulamıyorum. Işte burada: 1. ham veri aslında şarkı kayıtları böcek. Her şarkı birkaç parçadan ve her parça alt birimlerden oluşur. Tüm bireyler 5 dakika boyunca kaydedildi. Seri çekim sayısı ve kayıttaki konumları bireyler arasında ve …

9 time-series  mixed-model  repeated-measures  random-effects-model